(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210005141.7 (22)申请日 2022.01.04 (71)申请人 中国农业大 学 地址 100193 北京市海淀区 圆明园西路2号 (72)发明人 侯卓成　张帆　杨方喜　朱峰　 (74)专利代理 机构 北京众合诚成知识产权代理 有限公司 1 1246 代理人 陈波 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 北京鸭皮脂CLN8基因上游关键SNP及其育种 应用 (57)摘要 本申请提供了一种北京鸭CLN8基因上皮脂 相关的SNP位点， 所述SNP位点选自rs322493594、 rs322493651、 rs322493641、 rs322493648、 rs322493619中的一个或多个； 本申请还提供了 这些位点的检测试剂盒及其在检测或预测北京 鸭的皮质重和/或皮质率和北京鸭育种中的应 用。 本申请的方法为北京鸭皮质性能的检测和相 关育种工作提供了准确而高效的途径。 权利要求书1页 说明书5页 附图4页 CN 114317774 A 2022.04.12 CN 114317774 A 1.北京鸭CLN8基因上皮脂相关的SNP位点， 其特征在于， 所述SNP位点选自 rs322493594、 rs32 2493651、 rs322493641、 rs32 2493648、 rs32 2493619中的一个或多个。 2.检测北京鸭CLN8基因上皮脂相关的SNP位点的试剂盒， 其特征在于， 所述试剂盒包含 检测以下一个或多个SNP位点的试剂： rs322493594、 rs322493651、 rs322493641、 rs322493648、 rs32 2493619。 3.根据权利要求2所述的试剂 盒， 其中所述试剂 盒用于检测北京鸭的皮质重和/或皮质 率。 4.检测以下一个或多个SNP位点的试剂： rs322493594、 rs322493651、 rs322493641、 rs322493648、 rs322493619在制备检测或预测北京鸭皮质重和/或皮质率的试剂盒中的应 用。 5.检测或预测北京鸭的皮质重和/或皮质率的方法， 其特征在于， 所述方法包括提取北 京鸭DNA样本； 检测北京鸭样本以下一个或多个SNP位点的核苷酸： rs322493594、 rs322493651、 rs322493641、 rs32 2493648、 rs32 2493619。 6.根据权利要求5所述的方法， 其中所述样本为血 液样本。 7.根据权利要求5所述的方法， 其中所述SNP位点存在突变表示皮质重和/或皮质率较 低。 8.根据权利要求7 所述的方法， 其中所述 突变为杂合或纯和突变。 9.根据权利要求1 ‑8任一项所述SNP位点、 试剂盒或方法在高皮质重和/或皮质率地北 京鸭育种中的应用。 10.根据权利要求9所述的应用， 其中所述应用中选取SNP位点不存在突变地北京鸭个 体用于育种。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114317774 A 2北京鸭皮脂C LN8基因上游关键SNP及其育种应用 技术领域 [0001]本发明涉及分子遗传学领域， 具体涉及了影响北京鸭皮脂性状的关键SNP位点及 其育种中的应用。 背景技术 [0002]北京鸭是世界著名的肉鸭品种， 具有生长快、 饲料转化率高、 繁殖率高、 抗病性强 等优点。 中国是世界上最大的家鸭生产国和消费国， 家鸭产量占全球家鸭产量的75％ (FAO)， 我国2020年肉鸭出栏量较2019年增加5.64％(2020中国家禽发展报告)。 养鸭业在中 国发展迅速， 除了胸肉和蛋类外， 鸭脖和鸡翅等副产品也很受欢迎。 利用本发明则可以推进 北京鸭的推广进程， 增 加北京鸭产业受益， 进行成果 转化。 [0003]皮脂对北京鸭的烤制十分重要， 是决定北京烤鸭风味的关键因素， 探究北京鸭皮 脂沉积的机制以及关键基因的定位是提高北京鸭皮脂 重、 皮脂率 性状的必经途径。 [0004]全基因组关联分析(Genome ‑Wide Association  Study， GWAS)是一种在人类或动 植物全基因组中寻找变异序列的方法。 基于对遗传多样性丰富的自然群体中的个体进 行全 基因组重测序， 结合准确的目标性状的表型数据及统计方法进行全基因组关联分析， 可对 动植物复杂性状进行定位， 快速获得影响目标性状表型变异的遗传标记或候选基因。 随着 北京鸭全基因组测序的完成， 通过高通量测序和全基因组关联研究分析大量自然群体为探 索变异等位基因和重要性状的关键基因提供了巨大 的机会， 这有助于开发分子育种标记， 揭示这些性状的遗传机制。 发明内容 [0005]申请人利用重测 序方法定位影响皮脂性状的关键位点。 共收集1890只北京鸭群体 的重测序数据以及表型数据； 获取所有 北京鸭的全部变异， 并且对变异质量控制； 采用混合 线性模型进 行全基因组关联分析， 以出生日期、 屠宰批次、 性别以及前五个主成分作为协变 量； 分析并定位到了 皮脂重性状的全基因组显著的SNP位点； 对SNP位点上下游5kb范围内的 基因进行查找、 筛选、 定位以及功能注释； 判断SNP的效应， 通过结合表型进行估算， 并且利 用Motif结合预测， 判断SNP范围内的染色质开放区域， 确定SNP作用于基因的方式以及SNP 对基因功能和表型效应的影响。 [0006]一方面， 本申请提供了一种北京鸭CLN8基因上皮脂相关的SNP位点， 所述SNP位点 选自rs322493594、 rs322493651、 rs322493641、 rs322493648、 rs322493619中的一个或多 个。 [0007]另一方面， 本申请提供了检测北京鸭CLN8基因上皮脂相关的S NP位点的试剂盒， 所 述试剂盒包含检测以下一个或多个SNP位点的试剂： rs322493594、 rs322493651、 rs322493641、 rs32 2493648、 rs32 2493619。 [0008]进一步地， 所述试剂盒用于检测北京鸭的皮质重和/或皮质率。 [0009]另一方面， 本申请提供了检测以下一个或多个SNP位点的试剂： rs322493594、说　明　书 1/5 页 3 CN 114317774 A 3