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(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210014200.7 (22)申请日 2022.01.06 (71)申请人 南方医科 大学珠江医院 地址 510282 广东省广州市海珠区工业大 道中253号南方医科 大学珠江医院 (72)发明人 邹兆伟 巫诚 俞金龙 曾丽斯  (74)专利代理 机构 广州市诺 丰知识产权代理事 务所(普通 合伙) 44714 代理人 许飞 马倩 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) C12N 15/11(2006.01) C12Q 1/6851(2018.01) C12Q 1/6837(2018.01) C12M 1/34(2006.01)C12M 1/00(2006.01) A61K 31/7105(2006.01) A61K 45/00(2006.01) A61P 35/00(2006.01) (54)发明名称 用于肠癌 患者预后预测及治 疗的lncRNA (57)摘要 本发明公开了用于肠癌患者预后预测及治 疗的lncRNA。 通过前期对肠癌中差异表达的 lncRNA进行分析, 发明人发现lncRNA  BF368575 在肠癌组织和部分肠癌细胞系中高表达, 其高表 达与肠癌患者较差的预后密切相关, lncRNA   BF368575表达越低预后越好。 功能实验显示 lncRNA BF368575在体内外均能促进肠癌 细胞的 增殖, 可能通过上调PEG10发挥促癌作用; lncRNA   BF368575的表达水平与肠癌患者的预后明显相 关, 可用于预测肠癌预后。 权利要求书1页 说明书8页 附图7页 CN 114350802 A 2022.04.15 CN 114350802 A 1.检测lncRNA BF368575表达量的定量试剂在制备肠 细胞癌预后检测试剂中的应用。 2.根据权利要求1所述的应用, 其特征在于: 所述定量试剂选自高通量lncRNA芯片、 组 织芯片或PCR试剂。 3.根据权利要求1所述的应用, 其特征在于: lncRNA  BF368575表达量显著升高时, 判定 为肠癌患者预后较差 。 4.根据权利要求1所述的应用, 其特征在于: 所述定量试剂检测的样本为患者血清和/ 或组织。 5.一种肠 细胞癌预后分析系统, 包括: lncRNA表达量检测装置, 用于检测样本中l ncRNA BF368575的表达量; 预后分析装置, 基于l ncRNA BF368575的表达量, 确定肠 细胞癌预后; 结果输出装置, 用于 输出预后分析装置分析 得到的结果。 6.根据权利 要求5所述的肠细胞癌预后分析系统, 其特征在于: 所述lncRNA表达量检测 装置选自高通 量lncRNA芯片、 组织芯片或PCR试剂。 7.根据权利要求5所述的肠细胞癌预后分析系统, 其特征在于: lncRNA  BF368575表达 量显著升高时, 判定为肠 细胞癌治疗后复发高风险。 8.根据权利 要求5所述的肠细胞癌预后分析系统, 其特征在于: 所述lncRNA表达量检测 装置分析的样本为患者血清和/或组织。 9.抑制lncRNA BF368575表达的试剂在制备肠 细胞癌治疗药物中的应用。 10.根据权利要求9所述的应用, 其特征在于: 所述试剂选自针对lncRNA  BF368575的 miRNA、 siRNA或shRNA, l ncRNA BF368575启动子抑制剂。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114350802 A 2用于肠癌患者预后预测及治疗的lncRNA 技术领域 [0001]本发明涉及肿瘤领域, 具体涉及用于肠癌 患者预后预测及治疗的l ncRNA。 背景技术 [0002]肠癌是常见消化道恶性肿瘤之一, 据2020年最新全球癌症数据统计, 肠癌发病率 在各种肿瘤中仍 位居前列, 全年有1 148515例新发病例, 并且有576858例患者死于肠癌[1]。 [0003]通常, 肠癌在发达地域如北美、 欧洲、 澳大利亚有着较高的发病率和死亡率[2]。 但 是, 近年来, 由于经济水平提升, 肠癌在东亚国家的发病率也在逐年提高, 肠癌的早期诊断、 治疗已经成为一个全球性热点问题[3]。 目前, 放疗、 化疗和 手术已成为肠癌治疗的常规手 段[4]。 得益于肠镜以及腹腔 镜技术的发展, 我们已经可以不用开刀就达到完全切除病灶的 目的。 早期肠癌患者5年生存率达90%以上[5 ‑7]。 但是, 晚期肠癌患者或已发生远处转移患 者的远期生存率不足两年[8]。 据统计, 到2030年, 全球将有2000000肠癌患者, 其中1000000 将死于肠癌[9,  10]。 因此, 肠癌治疗依旧面临挑战。 [0004]目前, 造成肠癌患者治疗失败最常见的原因是癌细胞远处转移。 该过程是受多种 复杂因素影响的, 涉及癌细胞侵袭, 上皮 间质转化, 细胞外基质降解, 微环境趋化作用、 许多 致癌基因的异常激活或失活、 肿瘤抑制基因和信号通路在转录, 转录后和翻译水平受到调 节, 调控机制异常复杂[11]。 因此, 需进一步研究结直肠癌发生发展的分子机制, 寻找新的 预防、 诊断和治疗肠癌的方法。 [0005]非编码RNA (ncRNA) 是一般不具备蛋白质编码功能 的RNA。 人类基因组由大约 2%的 编码基因和98%左右的非编码RNA (nCRNA) 构成[12]。 非编码RNA包括微小RNA (miRNA) , 长链 非编码RNA (LncRNA) , 核仁小RNA (Sn ORNA) 以及其他类型 非编码RNA[13]。 LncRNA是碱基长度 在200bp到10万bp的非编码RNA, LncRNA包含的外显子数量比mRNA较低, 但是其与mRNA有着 相似的转录过程, 也被聚合酶 Ⅱ转录, 且大多数有经过5 ’端加帽、 聚腺苷酸化和拼接过程 [14, 15]。 人类基因组含有大量的长链非编码RNA,  ENCODE工程发现并注释了9640个长链 非编码RNA[12]。 由于没有足够的阅读 框, 最初 lncRNA被认 为是不具备任何生理功能。 但是 近年来研究表明LncRNA在细胞代谢、 分化, 在疾病发展中发挥重要作用。 LncRNA参与了调控 基因表达、 蛋白质翻译等细胞机制过程, 以及细胞分化、 细胞系选择、 器官发生和组织内稳 态的过程。 除此之外, LncRNA还参与了心血管疾病和癌症等疾病的发生。  LncRNA调节生理 状况和疾病 过程的方式多样, 其可以通过基因组表观调节、 转录调节以及转录后调节的方 式单独或者联合 地改变目的基因的表达[16]  。 [0006]研究证实, 许多肿瘤组织都有一些组织特异性LncRNAs的表达, 如肝癌、 肺癌、 前列 腺癌、 肾癌等等。 肿瘤组织/细胞中的某些LncRNAs异常表达与肿瘤分化程度、 预后有关[17 ‑ 22]。 在肠癌中,  LncRNA同样发挥着 重要作用, 其能通过改变恶性生物学表型来促进或者抑 制肠癌的发展[2 3, 24],例如  LncRNA‑HEIH在肠癌中表达升高, 且  LncRNA‑HEH的表达增高 与肠癌患者TMN分期差、 预后不良明显相关[23]。 另有研究表明,  LncRNA‑CRNDE 促进肠癌 细胞的增殖和耐药,  LncRNA‑‑xisT则介导肠癌的转移和上皮间质转 化过程[25,  26]。说 明 书 1/8 页 3 CN 114350802 A 3

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