(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210016550.7 (22)申请日 2022.01.07 (71)申请人 中国热带农业科 学院南亚热带作物 研究所 地址 524091 广东省湛江市麻章区湖秀路1 号 (72)发明人 肖熙鸥　欧雄常　吴彩玉　林文秋　 冯恩友　 (74)专利代理 机构 深圳市铭粤知识产权代理有 限公司 4 4304 专利代理师 孙伟峰 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种用于茄子种资源鉴定的SNP组合标记 (57)摘要 本发明提供了一种用于茄子种资源鉴定的 SNP组合标记， 所述茄子SNP组合标记采用如序列 表SEQ NO.ID 1‑135所示引物序列进行鉴定。 本 发明一种茄子SNP组合标记在品种资源分类、 品 种资源真实性或 品种身份鉴定、 品种指纹图谱构 建、 真假杂交种鉴定中均具有应用。 权利要求书1页 说明书26页 序列表23页 附图2页 CN 114480704 A 2022.05.13 CN 114480704 A 1.一种茄子SNP组合标记， 其特征在于所述茄子SNP组合标记采用如序列表SEQ  NO.ID  1‑144所示引物序列进行鉴定 。 2.一种茄子SNP组合标记的筛选方法， 其特征在于包括如下步骤： (1)SLAF ‑seq基因组 测序， (2)SNP检测， (3)Perfect  SNP过滤， (4)引物设计与合成， (5)引物筛选， (6)种质资源 基因分型， (7)， 进化 树， PCA， 指纹图谱构建。 3.如权利要求1所述 一种茄子SNP组合标记在品种资源分类中的应用。 4.如权利要求1所述一种茄子SNP组合标记在品种资源真实性或品种身份鉴定中的应 用。 5.如权利要求1所述 一种茄子SNP组合标记在真假杂交种鉴定的应用。 6.如权利要求1所述 一种茄子SNP组合标记在指纹图谱构建中的应用。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114480704 A 2一种用于茄子种资源鉴定的SNP组合标记 技术领域 [0001]本发明属于茄子种资源鉴定和育种领域， 具体涉及一种用于茄子种资源鉴定的 SNP组合标记。 背景技术 [0002]茄子(Solanum  melongena  L)属茄科(Solanaceae)茄属(Solanum  L)重要蔬菜。 茄 子具有较强的杂种优势。 因此对已种质资源进行精准鉴定、 分类对于杂种优势的利用有着 重要的意 义。 [0003]传统基于表型对种质资源进行遗传多样性分析的方法在茄子上得到了广泛的应 用。 已有的研究结果表明， 茄子具有丰富的表型变异根据表型的的差异能够区分大部分种 质资源(邓姗等,2020； 李鲁俊等,2019； 齐东霞等,2017)。 但是由于表型鉴定容易受到环境、 人为主观因素的判断， 会对研究结果造成一定的影响。 而基于DNA序列多样性的分子标记 技 术由于其不易受环 境条件和认为主观因素的影响， 在种质资源遗传 多样性分析(郭守鹏等, 2019； 林珲等,2019； 王葡萄等,2020)、 基因定位与克隆(王彤彤等,2012)、 品种真实性和纯 度鉴定(吉康娜 等,2019)以及分子标记辅助育种(张宝玺 等,2020)等方面有着重要的作用。 [0004]随着茄子基因组的的解析， 茄子的分子标记技术得到了快速发展(Barchi  et al, 2019； Wei  et al,2020)。 目前在茄子种质资源遗传多样性分析上利用的分子标记有SRAP (林珲等2 019)、 SSR(郭守鹏等2019)、 ES T‑SSR(曾美娟等,2 020)、 Indel(吉康娜等2 019)、 SNP (Barchi et al,2019； Liu et al,2019； 魏庆镇等,2 019)等。 利用这些分子标记能够有效的 将种质资源进行区分， 为亲缘关系分析、 种子纯度和杂交组配提供了良好的参考(廖秋石 等,2020)。 [0005]由于单核苷 酸多态性(single  nucleotide polymorphisms,SNP)是植物基因组中 分布最丰富的变异， 并且其能实现低成本高通量的检测， 因此SNP标记是极具应用前景的分 子标记技 术(Semagn etal.,2014),已经在多种作物上 得到了广泛应用。 [0006]现有技术存在的问题： 茄子种质资源表型鉴定周期长、 工作量大、 易受环境条件和 人为主观影响。 已有的ISSR， SRAP和SSR等分子标记操作复杂， 实验周期长， 通量低。 本发明 通过对40份茄子材料进行基因组重测序， 开发出能将224份茄子种质完全区分开的135个 SNP位点。 上述SNP标记组合可用于茄子 真实性和身份鉴定， 具有适用的品种种类更多、 低成 本、 高效率 等优点。 发明内容 [0007]本发明要解决的关键技术问题在于通过对40份茄子材料进行基因组重测 序， 开发 出能将224份茄子种质完全 区分开的48个SNP位点。 为解决上述技术 问题， 本发明采用如下 技术方案： [0008]1.一种茄子SNP组合标记， 所述SNP组合标记采用序如列 表SEQ NO.ID 1‑144(或表 1)所示引物序列进行茄子种质资源基因分型。说　明　书 1/26 页 3 CN 114480704 A 3