(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210018326.1 (22)申请日 2022.01.07 (71)申请人 深圳市龙华区人民医院 地址 518100 广东省深圳市宝安区龙华建 设东路2号 (72)发明人 陈文标　沈观乐　林俊其　余瑞林　 黄小明　高妩媚　 (74)专利代理 机构 北京集佳知识产权代理有限 公司 11227 专利代理师 温可睿 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 肺腺癌基 于代谢基因的分子分型 (57)摘要 本发明涉及生物 技术领域， 尤其涉及肺腺癌 基于代谢基因的分子分型。 本发明提供了75个基 因在制备肺癌预后的产品中的应用。 本发明利用 来自TCGA、 GEO公共数据库 中基因表达数据、 CNV 数据以及SNV突变数据， 通过收集到的之前研究 的代谢相关的基因集， 通过预后相关的代谢基因 对肺腺癌进行了重分类， 分析比较了不同分类的 生存曲线， 并鉴定了不同分类中的免疫特征， 并 且比较了不同亚型与免疫 治疗的效果。 权利要求书1页 说明书12页 附图11页 CN 114480644 A 2022.05.13 CN 114480644 A 1.以如下基因为标志 物， 在制备肺腺癌 患者预后的产品中的应用； 所述基因包括NOSTRIN、 PDK4、 DNASE1L3、 ERN2、 JPH1、 ITLN2、 TGFBR3、 BEX2、 PIP5KIB、 HMGCS2、 RSPO4、 GPX3、 GRIA1、 HIF3A、 ALKAL2、 SOX13、 UP K3B、 GNMT、 ADAMTSL3、 DACT2、 P KNOX2、 SVEP1、 XAGE2、 GANC、 GSTA2、 S100P、 SLC7A11、 INSL4、 FGA、 RHCG、 ARL14、 FAM83B、 MAGEA4、 AKAP12、 IGFBP1、 SRXN1、 SPX、 EPS8L3、 KLK8、 MAGEAI、 G6PD、 CDK6、 AKR1C4、 GCLM、 SERPINB3、 MAGEB2、 CA12、 RND3、 UGDH、 TFRC、 PREP、 SFRP2、 MMP11、 CILP、 CA9、 ITPKA、 COL1A1、 CCL20、 C6orf223、 GALNT6、 PLPP4、 TFP12、 LRRC15、 GALNT14、 COL10A1、 MB、 TNC、 TBX15、 SPP1、 PLAU、 KLK12、 SULF1、 CI LP2、 P2RY 6或CST1中至少一种。 2.根据权利要求1所述的应用， 其特征在于， 所述预后包括对肺腺癌进行分型、 预测药 物有效性、 预测治疗方案有效性、 预测患者 生存率和/或评估患者的免疫细胞浸润得分。 3.根据权利要求2所述的应用， 其特征在于， 所述分型包括： 将肺腺癌分为三个类型， 其 中： C1亚型主 要与代谢信号 通路相关； C2亚型主 要与肿瘤信号 通路相关； C3亚型与代谢与肿瘤信号 通路都相关。 4.根据权利要求2或3所述的应用， 其特征在于， 所述预测患 者生存率包括三个亚型中， C1亚型的预后最 好， C2亚型的预后最差， 亚型C 3的预后介于 C2与C1之间。 5.根据根据权利要求2所述的应用， 其特征在于， 所述药物包括Bexarotene、 Doxorubicin、 Embelin、 Etop oside、 Gemcitabine、 Mitomycin  C、 Vinorelbine或Cisp latin 中至少一种。 6.根据权利要求2所述的应用， 其特征在于， 所述治疗方案包括免疫治疗； 所述免疫治 疗包括nivolumab治疗或pembro lizumab治疗。 7.根据权利要求2或6所述的应用， 其特征在于， 所述预测治疗方案有效性包括， 三个亚 型中C3亚型的患者对pembro lizumab治疗的反应最 好。 8.根据权利要求2或3所述的应用， 其特征在于， 所述预测患 者生存率中， 三个亚型中C2 亚型的死 亡率高于 C1亚型或C 3亚型。 9.根据权利要求2或3所述的应用， 其特征在于， 所述评估患 者的免疫细胞浸润得分中， 三个亚型中C1亚型的免疫浸润得分最高。 10.一种肺腺癌患者预后的产品， 其特征在于， 包括检测如下基因的试剂： 所述基因包 括NOSTRIN、 PDK4、 DNASE1L3、 ERN2、 JPH1、 ITLN2、 TGFBR3、 BEX2、 PIP5KIB、 HMGCS2、 RSPO4、 GPX3、 GRIA1、 HIF3A、 ALKAL2、 SOX13、 UPK3B、 GNMT、 ADAMTSL3、 DACT2、 PKNOX2、 SVEP1、 XAGE2、 GANC、 GSTA2、 S100P、 SLC7A11、 INSL4、 FGA、 RHCG、 ARL14、 FAM83B、 MAGEA4、 AKAP12、 IGFBP1、 SRXN1、 SPX、 EPS8L3、 KLK8、 MAGEAI、 G6PD、 CDK6、 AKR1C4、 GCLM、 SERPINB3、 MAGEB2、 CA12、 RND3、 UGDH、 TFRC、 PREP、 SFRP2、 MMP11、 CILP、 CA9、 ITPKA、 COL1A1、 CCL20、 C6orf223、 GALNT6、 PLPP4、 TFP12、 LRRC15、 GALNT14、 COL10A1、 MB、 TNC、 TBX15、 SPP1、 PLAU、 KLK12、 SULF1、 CILP2、 P2RY6或 CST1中至少一种。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114480644 A 2肺腺癌基于代谢 基因的分子分型 技术领域 [0001]本发明涉及生物技 术领域， 尤其涉及肺腺癌基于代谢基因的分子分型。 背景技术 [0002]肺腺癌是肺癌的一种， 属于非小细胞肺癌， 多数起源于支气管黏膜上皮，  少数起 源于大支气管的黏液腺。 肺腺癌早期通常不会引起明显的体征和症状，  常常在胸部X光线 检查时被发现。 当肺腺癌病情进展至晚期时， 会出现较为明  显的咳嗽、 血痰、 胸痛、 局部喘 鸣以及发热和呼吸急促 等症状。 [0003]肺腺癌的常规治疗方式包括手术、 放疗、 化疗、 靶向治疗和免疫治疗等。  在肺腺癌 早期， 医生一般会选择手术治疗， 以期获得最佳治疗效果。 对于晚  期患者而言， 医生在选择 治疗方案时， 会采取多 学科综合治疗和个体化治疗  相结合的原则， 具体方案取决于肺腺癌 的临床分型以及患者 年龄和整体健康  状况。 [0004]现有技术中， 根据肺腺癌的病理， 将其分为浸润性腺癌， 浸润性腺癌变  异型、 微浸 润性腺癌和浸润前病变； 浸润前病变又分为原 位腺癌和不 典型腺 瘤样增生。 根据这样的分 类， 可以对不同类型的肺腺癌进 行预后， 其中， 不  典型腺瘤样增生和原 位腺癌的预后最好， 微浸润腺癌的复发率 最低。 [0005]但现有技术对肺 腺癌的分类仅是通过病理进行区分， 难免存在不够准确  的问题， 且目前的分型对用药的指导 仍不够准确。 发明内容 [0006]有鉴于此， 本发明要解决的技 术问题在于提供肺腺癌基于代谢基因的分  子分型。 [0007]本发明以如下基因为标志 物， 提供了其在制备肺腺癌 患者预后的产品中  的应用； [0008]所述基因包括NOSTRIN、 PDK4、 DNASE1L3、 ERN2、 JPH1、 ITLN2、  TGFBR3、 BEX2、 PIP5KIB、 HMGCS2、 RSPO4、 GPX3、 GRIA1、 HIF3A、  ALKAL2、 SOX13、 UPK3B、 GNMT、 ADAMTSL3、 DACT2、 PKNOX2、 SVEP1、 XAGE2、 GANC、 GSTA2、 S100P、 SLC7A11、 INSL4、 FGA、 RHCG、 ARL14、   FAM83B、 MAGEA4、 AKAP12、 IGFBP1、 SRXN1、 SPX、 EPS8L3、 KLK8、  MAGEAI、 G6PD、 CDK6、 AKR1C4、 GCLM、 SERPINB3、 MAGEB2、 CA12、  RND3、 UGDH、 TFRC、 PREP、 SFRP2、 MMP11、 CILP、 CA9、 ITPKA、 COL1A1、 CCL20、 C6orf223、 GALNT6、 PLPP4、 TFP12、 LRRC15、 GALNT14、 COL10A1、  MB、 TNC、 TBX15、 SPP1、 PLAU、 KLK12、 SULF1、 CI LP2、 P2RY 6或CST1 中至少一种。 [0009]本发明中， 所述预后包括对肺腺癌进行分型、 预测药物有效性、 预测治  疗方案有 效性、 预测患者 生存率和/或评估患者的免疫细胞浸润得分。 [0010]本发明中， 所述分型包括： 将肺腺癌分为 三个类型， 其中： [0011]所述分型包括： 将肺腺癌分为三个类型， 其中： C 1亚型主要与代 谢信号 通路相关。 C2亚型主 要与肿瘤信号 通路相关。 C 3亚型与代谢与肿瘤信号 通路 都相关。 [0012]本发明中， 所述预测患者生存率包括： 三个亚型中， C 1亚型的预后最好，  C2亚型的 预后最差， 亚型C 3的