(19)国家知识产权局 (12)发明 专利 (10)授权公告 号 (45)授权公告日 (21)申请 号 202210023223.4 (22)申请日 2022.01.10 (65)同一申请的已公布的文献号 申请公布号 CN 114134238 A (43)申请公布日 2022.03.04 (73)专利权人 华南农业大 学 地址 510610 广东省广州市天河区五山 华 南农业大 学 (72)发明人 聂庆华　张思雨　徐海平　郭利金　 徐翌斌　吴瑞权　 (74)专利代理 机构 北京东方盛凡知识产权代理 事务所(普通 合伙) 11562 专利代理师 程小芳 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01)C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (56)对比文件 US 2017159121 A1,2017.0 6.08 CN 112852976 A,2021.0 5.28 CN 111440878 A,2020.07.24 AU 2020102716 A4,2020.12.0 3 潘章源等.家养动物选择信号研究进 展. 《遗 传》 .2016,(第12期), 杜红丽等.利用DNA池和 测序技术快速筛查 候选效应单倍型. 《农业 生物技术学报》 .20 08, (第02期), 审查员 陈莹 (54)发明名称 与番鸭产蛋性状相关的RALGAPA1基因SNP分 子标记及其应用 (57)摘要 本发明公开了一种与番鸭产蛋性状相关的 RALGAPA1基因SNP分子标记及其应用， 属于生物 技术领域， 包括： SNP1、 SNP2和/或SNP8； 其中， 包 括： SNP1、 SNP2和/或SNP8； 其中， 所述SNP1位于5 号染色体RALGAPA1基因内含子区域35658560位 点， 等位基因为T＞G； 所述SNP2位于5号染色体 RALGAPA1基因内含子区域356582 63位点， 等位基 因为G＞T； 所述SNP8位于5号染色体RALGAPA1基 因内含子区域35656935位点， 等位基因为G>A； 本 发明可以准确鉴定不同周龄的番鸭产蛋性状， 为 分子标记辅助选择育种提供新的分子标记。 权利要求书1页 说明书11页 序列表2页 附图1页 CN 114134238 B 2022.07.12 CN 114134238 B 1.一种与番鸭产蛋性状相关的RALGAPA 1基因SNP 分子标记的检测试剂在检测番鸭产蛋 性状中的应用， 其中， 所述与番鸭产蛋性状相关的RALGAPA1基因SNP分子标记， 包括： SNP1、 SNP2和SNP8； 其中， 所述SNP 1位于5号染色体RALGAPA1基因内含子区域35658560位点， 等位 基因为T＞G； 所述SNP2位于5号染色体RALGAPA1基因内含子区域35658263位点， 等位基因为 G＞T； 所述SNP 8位于5号染色体RALGAPA1基因内含子区域3 5656935位点， 等位基因为G>A。 2.一种引物在鉴别番 鸭的产蛋性状或制备鉴别番 鸭的产蛋性状的试剂盒中的应用， 其 中， 所述引物的核苷酸序列如SEQ  ID No.3‑6所示， 所述引物用于扩增权利要求1中所述的 与番鸭产蛋性状相关的RALGAPA1基因SNP分子标记。 3.一种鉴别番 鸭产蛋性状的方法， 其特征在于， 鉴别待测样本番鸭中如权利要求1中所 述的分子标记的基因型。 4.根据权利要求3所述的方法， 其特 征在于， 包括以下步骤： （1） 提取待测样本番鸭的基因 组DNA； （2） 利用权利要求2中所述的引物进行PCR扩增， 获取扩增引物； （3） 将所述扩增产物经测序后， 获取分子标记的基因型； （4） 根据基因分型 结果， 判断所述待测样本番鸭的产蛋性状。 5.根据权利要求4所述的方法， 其特征在于， 在步骤 （2） 中， 所述PCR扩增的扩增体系包 括： 2xTaq MasterMix  15 μL、 混合引物各1.2 μL、 超纯 水10.6 μL和DNA 2 μL； 所述PCR扩增的反应程序为： 94℃  2min， 94℃  30s、 53℃  30s、 72℃  30s， 30cycles， 72 ℃ 2min。 6.一种与番鸭产蛋性状相关的RALGAPA 1基因SNP 分子标记、 引物在番鸭育种中的应用， 其中， 所述与番 鸭产蛋性状相关的RALGAPA1基因SNP分子标记， 包括： SNP 1、 SNP2和SNP8； 其 中， 所述SNP1位于5号染色体RALGAPA1基因内含子区域35658560位点， 等位基因为T＞G； 所 述SNP2位于5号染色体RALGAPA1基因内含子区域35658263位点， 等位基因为G＞T； 所述SNP8 位于5号染色体RALGAPA1基因内含子区域3 5656935位点， 等位基因为G>A； 所述引物的核苷酸序列如SEQ  ID No.3‑6所示， 所述引物用于扩增所述与番鸭产 蛋性 状相关的RALGAPA1基因SNP分子标记。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114134238 B 2与番鸭产蛋性状相关的RALGAPA1基因SNP分子标记及其应用 技术领域 [0001]本发明涉及生物技术领域， 特别是涉及一种与 番鸭产蛋性状相关的RALGAPA1基因 SNP分子标记及其应用。 背景技术 [0002]番鸭以适应性强， 繁殖力强， 产肉量高著称， 原产于中南美洲热带地区， 适宜中国 南方地区养殖。 番鸭适合香芋焖鸭、 香焖番鸭、 笋干焖番鸭、 四物番鸭汤、 盐焗番鸭、 茶树菇 番鸭汤和 姜母鸭等许多中式做法， 在华南地区具有较好的市场前景。 国内虽已开展番鸭的 规模化养殖， 但番鸭的育种进展落后， 尤其是繁殖性能， 严重制约了生产力的提高。 繁殖性 状遗传力低， 基于性状的选择育种很难取 得大的进展。 [0003]卵巢是雌性的生殖器官， 与产蛋特性密切相关， 家禽的卵巢功能直接影响产蛋量。 卵泡发育过程复杂， 与多种内分泌、 自分泌和旁分泌因子有关。 卵巢中原始卵泡的数量是固 定的， 卵泡的静止、 存活和激活取决于动态平衡的过程。 TGF ‑β、 FGFs、 IGFs、 DRD2、 FSHR、 GnRH、 STAR和PRLR被 证实与家禽的卵巢功能有关， 影响产蛋量。 [0004]RALGAPA1基因不仅与免疫有关， 其表达水平还与生育的持续时间有关。 分子标记 辅助选择能够加速育种进展， 常用的分子标记有RFLP、 RAPD、 SSR和AFLP等， 但是， 这些分子 标记使用时需要凝胶电泳检测， 速度慢， 还会造成污染。 SNP是一种单核苷 酸多态性， 包括基 因组碱基的插入、 缺失、 突变等， 可利用Sanger测序精确检测。 Sanger测序不仅价格低， 准确 性高， 而且借助现代化设备， 能够实现规模化检测。 以此， 利用Sanger测序检测RALGAPA1基 因的SNP， 并将其与产蛋性状关联， 用作分子标记辅助选择育种的分子标记。 发明内容 [0005]本发明的目的是提供一种与 番鸭产蛋性状相关的RALGAPA1基因S NP分子标记及其 应用， 以解决上述现有技术存在的问题， 本发明发现番鸭RALGAPA1基因内含子区存在多个 SNP位点， 并将其与番鸭的产蛋性状关联分析， 为MAS提供新的SNP分子标记。 [0006]为实现上述目的， 本发明提供了如下 方案： [0007]本发明提供一种与番鸭产蛋性状相关的RALGAPA1基因SNP分子标记， 包括： SNP1、 SNP2和/或SNP8； 其中， 所述SNP1位于5号染色体RALGAPA1基因内含子区域35658560位点， 等 位基因为T＞G； 所述SNP2位于5号染色体RALGAPA1基因内含子区域35658263位点， 等位基因 为G＞T； 所述SNP 8位于5号染色体RALGAPA1基因内含子区域3 5656935位点， 等位基因为G>A。 [0008]本发明还提供一种上述的与 番鸭产蛋性状相关的RALGAPA1基因S NP分子标记的检 测试剂在检测番鸭产蛋性状中的应用。 [0009]本发明还提供一种扩增上述的与番鸭产蛋性状相关的RALGAPA1基因S NP分子标记 的引物， 包括如SEQ  ID No.3‑6所示序列的引物。 [0010]本发明还提供一种上述的引物在鉴别番鸭的产蛋性状或制 备鉴别番鸭的产蛋性 状的试剂盒中的应用。说　明　书 1/11 页 3 CN 114134238 B 3