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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210028226.7 (22)申请日 2022.01.11 (71)申请人 江苏省海 洋水产研究所 地址 226007 江苏省南 通市教育路31号 (72)发明人 张志伟 林志杰 张志勇 卫明亮  祝斐 贾超峰 孟乾 徐大凤  陈淑吟 张曹进  (74)专利代理 机构 南京业腾知识产权代理事务 所(特殊普通 合伙) 32321 专利代理师 周姗姗 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种与黑鲷生长性状相关的SNP分子标记及 其应用 (57)摘要 本发明公开了一种与黑鲷生长性状相关的 SNP分子标记, 所述SNP分子 标记的序列如SEQ  ID  NO.1、 SEQ  ID NO.2或SEQ  ID NO.3所示。 所述SEQ   ID NO.1自5’端起第276位碱基为T或C, 基因型为 TT的个体生长速度显著高于CC和TC个体; 所述 SEQ ID NO.2自5’端起第364位碱基为A或C, 基因 型为AA的个体生长速度显著高于CC和AC个体; 所 述SEQ ID NO.3自5’端起第6070位碱基为A或T, 基因型为TT的个体生长速度显著高于AA和AT个 体。 本发明所发现的3个SNP分子标记可快速获得 生长速度快且遗传稳定的黑鲷个体, 可应用于选 育出具有快速生长的黑鲷品种。 权利要求书2页 说明书6页 序列表8页 附图1页 CN 114438221 A 2022.05.06 CN 114438221 A 1.一种与黑鲷生长性状相关的SNP分子标记, 其特征在于, 所述SNP分子标记为位于 adenylate  kinase 2基因的SNP分子 标记、 位于cytochro me P450 3A基因的SNP分子标记或 位于complement  component  4基因的SNP分子标记中的一种 或几种, 所述位于adenylate   kinase 2基因的SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ  ID NO.1所示, 该序列的第276位碱基为T 或C; 所述位于cytochrome  P450 3A基因的SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ  ID NO.2所示, 该序列的第3 64位碱基为A或C; 所述位于complement  component  4基因的SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ  ID NO.3 所示, 该序列的第6 070位碱基为A或T。 2.权利要求1所述的与黑鲷生长性状相关的SNP分子标记在筛选快速生长的黑鲷方面 的应用, 所述位于adenylate  kinase 2基因的SNP分子标记的TT基因型个体生长速度显著 高于CC和TC基因型个体; 所述位于cytochrome  P450 3A基因的SNP分子标记的AA基因型个 体生长速度显著高于CC和 AC基因型个体; 所述位于complement  component  4基因的SNP分 子标记的T T基因型个 体生长速度显著高于A A和AT基因型个 体。 3.用于检测权利要求1所述与黑鲷生长性状相关的SNP分子标记的引物组, 其特征在 于, 所述引物组包括用于检测位于adenylate  kinase 2基因的SNP分子标记的引物对、 用于 检测位于cytochrome  P450 3A基因的SNP分子标记的引物对和用于检测位于complement   component 4基因的SNP分子标记的引物对, 所述用于检测位于a denylate  kinase 2基因的 SNP分子标记的引物对包括正向引物、 反向引物和延伸引物, 序列如SEQ  ID NO.4、 SEQ  ID  NO.5和SEQ  ID NO.6所示; 所述用于检测位于cytochrome  P450 3A基因的SNP分子标记的引 物对包括正向引物、 反向引物和延伸引物, 序列如SEQ  ID NO.7、 SEQ  ID NO.8和SEQ  ID  NO.9所示; 所述用于检测位于complement  component  4基因的SNP分子标记的引物对包括 正向引物、 反向引物和延伸引物, 序列如SEQ  ID NO.10、 SEQ  ID NO.11和SEQ  ID NO.12所 示。 4.权利要求3所述引物组在筛 选快速生长的黑鲷方面的应用。 5.一种用于筛选快速生长的黑鲷的试剂盒, 其特征在于, 包括用于检测位于adenylate   kinase 2基因的SNP分子标记的引物对、 用于检测位于cytochrome  P450 3A基因的SNP分子 标记的引物对和用于检测位于complement  component  4基因的SNP分子标记的引物对; 所 述用于检测位于adenylate  kinase 2基因的SNP分子标记的引物对包括正向引物、 反向引 物和延伸引物, 序列如SEQ  ID NO.4、 SEQ  ID NO.5和SEQ  ID NO.6所示; 所述用于检测位于 cytochrome  P450 3A基因的SNP分子标记的引物对包括正向引物、 反向引物和延伸引物, 序 列如SEQ ID NO.7、 SEQ  ID NO.8和SEQ  ID NO.9所示; 所述用于检测位于complement   component  4基因的SNP分子标记的引物对包括正向引物、 反向引物和延伸引物, 序列如SEQ   ID NO.10、 SEQ  ID NO.11和SEQ ID NO.12所示。 6.一种筛 选快速生长的黑鲷的方法, 其特 征在于, 包括如下步骤: (1)提取待检测黑鲷的基因 组DNA; (2)以提取 得到的DNA为模板, 利用权利要求3所述引物组进行PCR扩增, 得到PCR产物; (3)采用SAP(shrimp  alikaiine  phosphtase虾碱性硫酸酶)对PCR扩增产物进行碱性 磷酸酶处 理;权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 114438221 A 2(4)以处理后的PCR扩增产物为模板, 利用权利要求3所述引物组进行延伸反应; (5)对延伸反应产物进行飞行时间质谱检测, 根据检测结果确定样品的SNP 分子标记的 基因型, 位于adenylate  kinase 2基因的SNP分子标记的TT基因型个体、 位于cytochrome   P450 3A基因的SNP分子标记的AA 基因型个体或位于complement  component 4基因的SNP分 子标记的T T基因型个 体为快速生长的黑鲷个 体。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 114438221 A 3

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