(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210028836.7 (22)申请日 2022.01.11 (71)申请人 湖北省农业科 学院经济作物研究所 地址 430064 湖北省武汉市洪山区南湖瑶 苑 (72)发明人 李宁　王飞　尹延旭　高升华　 姚明华　徐凯　刘亚博　 (74)专利代理 机构 武汉宇晨专利事务所(普通 合伙) 42001 代理人 龚莹莹 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 与辣椒青果紫色条纹的紧密相关的SNP、 特 异CAPS引物及应用 (57)摘要 本发明属于辣椒 分子育种技术领域， 公开了 与辣椒青果紫色条纹的紧密相关的SNP、 特异 CAPS引物及应用。 本发明所述的SNP位点的位置 在辣椒P10染色体的第184,011,859位， 碱基为T 时， 则辣椒青果具有紫色条纹， 碱基为G时， 则辣 椒青果不具有紫色条纹特征。 本发 明还提供了检 测辣椒青果紫色条纹的特异CAPS引 物CAPS690 ‑ 01， 可以在苗期准确检测辣椒青果是否具有 紫色 条纹特征， 准确性高， 显著提高育种效率并降低 育种成本 。 权利要求书1页 说明书4页 序列表1页 附图2页 CN 114350840 A 2022.04.15 CN 114350840 A 1.检测与辣椒青果紫色条纹的紧密相关的SNP位点的试剂在辣椒青果紫色条纹育种中 的应用； 所述的SNP位点在辣椒P10染色体的第184,011,859位， 辣椒CM334  参考基因组， V1.55， ftp://ftp.solgenomics.net/gen omes/Capsicum_an nuum/C.annuum_cvCM334/。 2.根据权利要求1所述的应用， 所述的试剂为引物： F:  5’ ‑TGGATTCGTCGAACTCACTCAA ‑ 3’； R: 5’ ‑ACGCAGTGA AGGGTATGGTC‑3’。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114350840 A 2与辣椒青果紫色条纹的紧密相关的SNP、 特异 CAPS引物及应用 技术领域 [0001]本发明涉及 辣椒分子育种技术领域， 具体涉及与辣椒青果紫色条纹的紧密相关的 SNP、 特异CAP S引物及应用。 背景技术 [0002]色泽是辣椒果实最重要的品质性状之一， 对其感官品质和营养品质都有不可替代 的贡献。 辣椒果实色泽从青熟期到老熟期变化多样， 其中紫色的辣椒果实中含有丰富的花 青素对人体健康有益。 此外， 花青素是一种重要的抗氧化性物质， 在辣椒抗病、 抗逆及果实 耐贮性等方面也具有重要的作用。 [0003]辣椒中已经鉴定出两个调控未成熟辣椒果实紫色积累的基因， 分别为CaAn2和 Ca3gt。 CaAn2基因编码一个R2R3 ‑MYB转录因子， 在紫色辣椒与 绿色辣椒中该基因的编码区 没有差异， 紫色辣椒能够积累花青素的原因是CaAn2基因启动子区中插入了4.3kb的非长末 端重复序列反转录转座子而激活CaAn2基因的表达， 而使辣椒能够积累 花青素。 根据CaAn2 基因启动子区的差异， 获得了与CaAn2基因完全共分离的基因标记A_SCAR(F： 5 ’CACT  CCGACTTGTCTTTACGG  3’， P1R： 5’TAACTTGAGCCGGGGGTCT  3’， P2R： 5’CACG GAAGGAGGCTAGTCAA   3’)， 可以准确鉴定CaAn2基因型紫色辣椒种质。 Ca3gt基因编码一个花青素转运的基因， 该 基因位于辣椒Chr10染色体CaAn2基因的下游， 并获得了一个紧密连锁标记CAPS ‑78‑708(F： 5’CATGCCACAAGAAGTTGTAGCACAT  3’， R： 5’ACTTTCATCAGAATTAACATCTGAAATAA  3’)， 该基因型 辣椒的表型 特征为仅在未成熟果实上积累花青素而呈现紫色。 [0004]本发明涉及的辣椒青果紫色条纹性状， 自辣椒幼果时期的果实上开始呈现不均匀 分布紫色纵向条纹， 类似茄子中的 “竹丝茄”， 且紫条纹着色不显著受光的诱导。 在茄 科蔬菜 中， 除“竹丝茄”的果实果皮呈现紫色条纹外， 番茄和辣椒中果 实呈现紫色条 纹并不常见。 因 此， 应用该紫色条纹性状的辣椒材料开展辣椒品质育种 具有重要意义， 同时也为丰富辣椒 花青素合成与调控机制理论， 为 辣椒紫色性状 研究提供新案例。 发明内容 [0005]本发明的目的在于提供检测与辣椒青果紫色条纹的紧密相关的SNP位点的试剂在 辣椒青果 紫色条纹育种中的应用。 [0006]为了达到上述目的， 本发明采取以下技 术措施： [0007]本发明通过对青果紫色条纹材料 ‘竹丝辣椒Chen12 ’(购自湖北蔬谷农业科技有限 公司)和青果非紫色条纹辣椒 ‘16ZX101‑M‑1 线椒’(李宁,宫丽媛,高升华,尹延旭,余楚 英,王飞,陈财,吴君,焦春海,姚明华.辣椒种质的抗性基因分子标记检测[J].中国蔬菜, 2020(08):19 ‑32)构建F2分离群体， 利用BSA ‑seq结合群体作图方法， 精细定位并鉴定调控 辣椒青果紫色条纹的候选基因， 并根据候选基因在紫色条纹和非紫色条纹双亲间的差异， 将青果紫色条纹性状相关基因的候选区段定位在辣椒P10号染色体(辣椒CM334参考基因 组， V1.55， ftp://ftp.solgeno mics.net/genomes/Capsicum_annuum/C.annuum_cvCM334/)说　明　书 1/4 页 3 CN 114350840 A 3