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(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210032720.0 (22)申请日 2022.01.12 (71)申请人 武汉艾迪康医学检验所有限公司 地址 430000 湖北省武汉市江汉区江汉经 济开发区江兴路17号中信大楼C栋2-4 层 (72)发明人 周桂兰  (74)专利代理 机构 浙江杭州金通专利事务所有 限公司 3 3100 代理人 黄素萍 (51)Int.Cl. C12N 15/11(2006.01) C40B 50/06(2006.01) C12Q 1/6883(2018.01) C12Q 1/6874(2018.01) (54)发明名称 一组探针和利用杂交捕获法检测药物基因 组学相关基因C YP2D6多态性的建库试剂盒 (57)摘要 本发明提供了一组探针以及一种含有所述 一组探针的试剂盒, 用于制造一种利用杂交捕获 法检测药物基因组学相关基因CYP2D6多态性的 建库试剂盒。 本发明一次检测就可以快速获得 CYP2D6的基因型与代谢药物能力, 同时本 试剂盒 操作简便, 耗时小, 极易实现自动化检测, 特别适 用于大样 本量相关研究, 对于发现新的基因型也 有很大意 义。 权利要求书1页 说明书11页 附图1页 CN 114317533 A 2022.04.12 CN 114317533 A 1.一组探针, 其特征在于, 所述一组探针包括碱基序列SEQ  ID NO:1~57中的至少一 种。 2.如权利要求1所示的一组探针, 其特征在于, 所述一组探针用于制造一种利用杂交捕 获法检测药物基因 组学相关基因C YP2D6多态性的建库试剂盒。 3.一种利用杂交捕获法检测药物基因组学相关基因CYP2D6多态性的建库试剂盒, 所述 建库试剂盒包括一组探针, 其特征在于, 所述一组探针包括碱基序列SEQ  ID NO:1~57中的 至少一种。 4.一种用于基因突变检测的建库试剂 盒, 所述建库 试剂盒包括一组探针, 其特征在于, 所述一组探针包括碱基序列SEQ  ID NO:1~57中的至少一种。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114317533 A 2一组探针和利用杂交捕获法检测药物基因组学相关基因 CYP2D6多态性的建库试剂盒 技术领域 [0001]本发明涉及一组探针和一种利用杂交捕获法检测药物基因组学相关基因CYP2D6 多态性的建库试剂盒。 背景技术 [0002]近年来随着精准医疗的逐步推广, 药物基因组学(pharmacogenomics,PGx)作为实 现个体化给药的有力手段得到了迅猛发展。 PGx主要研究影响药物反应(包括疗效、 不良反 应发生)个体差异的基因多态性, 涉及编码药物代谢酶、 转运体、 作用靶点等的基因.这些基 因特性的变化会影响体内药物浓度及靶组织的药物敏感性.故而对这些基因组生物标志物 进行检测、 分析能够有助于指导临床精准用药、 预测药物不良反应的发生、 指导新药研发与 应用。 [0003]CYP450家族是一个与90%临床药物代 谢相关的同工 酶家族。 CYP 450代谢酶主要负 责的药物清除 Ⅰ相反应, 是药物代谢的 限速步骤, 因此编码 CYP450家族的基因是与底物药代 动力学最相关的遗传学因素。 [0004]CYP2D6(cytochrome  P450 family 2subfamily  D member 6)是CYP450酶系中最 先被发现的受单基因控制的酶。 迄今已有100余个CYP2D6等位基因被发现, 表现出高度的基 因多态性。 其基因型与代谢药物 能力密切相关, 各基因型根据药物代谢表型 的不同主要分 为弱代谢型(poor  metabolizer, PM)、 中间代谢型(intermediatemetaboliz er, IM)、 正 常代 谢型(extensive  metabolizer, EM)和超快代谢型(ultrarapid  metabolizer, UM)四种, 未 突变的人群携带的野生型属于EM, 在亚洲人群中最常见的突变型为IM, 由于对于药物代谢 能力的减弱引起蓄积, 临床上EM型患者产生药物相关不良反应的概率增加 。 CYP2D6等位基 因的突变率在不同人种中具有显著差异, 在亚洲人群中最普遍的突变型为CYP2D 6*10, 其突 变率约为50%, 远高于高加索人群中的突变频率(5%), 该突变型可降低CYP2D6活性, 而 CYP2D6*3和CYP2D6*4突变在亚洲人群中未被发现, CYP2D6*5发生率则与高加索人群及非洲 人群相近 。 CYP2D6*9多态性是G2613 ‑A2615缺失, 也可引起代谢酶活性降低。 [0005]传统的基因突变检测方法, 如Sanger测序、 焦磷酸测序和实 时荧光PC R等仅能对单 个基因, 或者单个 基因的部分外 显子突变进行检测, 对复杂变异类型的检测存在局限性。 [0006]随着药物基因组学知识的不断积累, 以及分子检测技术的不断发展, 多位点/多药 物的个体化用药检测 正在被行业所接受。 一次检测就可以获得常用药物或一类药物(如心 血管、 免疫抑制)的药物代谢酶及作用靶点基因的遗传信息, 对药物剂量、 药物种类选择及 药物间相互作用等个 体化用药 方案的制定产生决定性影响。 [0007]目前获三类证批件的PGx体外诊断试剂远不能覆盖临床所需检测的基因位点, 随 着二代测序技术的普及, 高通量测序能够同时对 上百万甚至数十亿个DNA片段进 行测序, 因 此可在较低成本下一次对多至上百个药物基因组学相关基因、 全外显子及 全基因组进 行检 测, 而且需要的样本量并不增加。 高通量测序技术因其在通量、 成本和效率方面的优势, 在说 明 书 1/11 页 3 CN 114317533 A 3

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