(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210046225.5 (22)申请日 2022.01.14 (71)申请人 西北农林科技大 学 地址 710000 陕西省西安市杨凌示范区 邰 城路3号 (72)发明人 曾庆东　刘胜杰　相明杰　吴建辉　 王长发　郑炜君　李春莲　袁凤平　 康振生　韩德俊　 (74)专利代理 机构 北京德崇智捷知识产权代理 有限公司 1 1467 专利代理师 郜彦茹 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种16K小麦全基因组mSNP区段组合、 基因 芯片及应用 (57)摘要 本发明涉及一种16K小麦全基因组mSNP区段 组合、 基因芯片及应用， 所述16K小麦全基因组 mSNP区段组合， 包括15478个mSNP区段， 所述 15478个mSNP区段的物理位置 是基于小麦品种中 国春(Chinese  Spring)的全基因组序列比对确 定的， 所述16K小麦品种中国春的全基因组序列 的版本号为Chinese_Spring  IWGSC RefSeq  1.0， 所述15478个mSNP区段如S00001 ‑15478所 示。 本发明的mSNP区段组合具有代表性高， 多样 性信息丰富、 标记分布均匀的特点， 同等的标记 密度下， 具有更低的成本价格， 极大的降低了应 用成本。 权利要求书1页 说明书204页 附图4页 CN 114525353 A 2022.05.24 CN 114525353 A 1.一种16K小麦全基因组mSNP区段组合， 其特征在于， 包括15478个mSNP区段， 所述 15478个mSNP区段的物理位置是基于小麦品种中国春的全基因组序列比对确 定的， 所述小 麦品种中国春的全基因组序列的版本号为Chinese_SpringIWGSC  RefSeq 1.0， 15478个所 述mSNP区段如S0 0001‑15478所示。 2.一套用于检测如权利要求1所述16K小麦全基因 组mSNP区段组合的核苷酸探针。 3.一种用于检测如权利要求1所述16K小麦基因组mSNP区段组合的基因芯片， 其特征在 于， 所述基因芯片为液相芯片， 所述基因芯片含有一套用于检测 权利要求1所述的16K小麦 全基因组mSNP区段组合的核苷酸探针。 4.一种如权利 要求1所述的16K小麦全基因组mSNP区段组合或如权利要求3所述的基因 芯片在制备小麦基因 组SNP基因芯片上的应用。 5.一种如权利 要求1所述的16K小麦全基因组mSNP区段组合或如权利要求3所述的基因 芯片在小麦连锁分析中的应用。 6.一种如权利 要求1所述的16K小麦全基因组mSNP区段组合或如权利要求3所述的基因 芯片在彩色小麦品种资源鉴定中的应用。 7.一种如权利 要求1所述的16K小麦全基因组mSNP区段组合或如权利要求3所述的基因 芯片在小麦全基因 组关联分析中的应用。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114525353 A 2一种16K小 麦全基因组mSNP区段组合、 基因芯片及应用 技术领域 [0001]本发明属于分子遗传育种领域， 具体涉及一种16K小麦全基因组mSNP区段组合、 基 因芯片及应用。 背景技术 [0002]小麦是最主要的粮食作物之一， 为人类提供超过20％的能量， 并且 随着人口不断 增长以及生活水平的不断提高， 人们对于小麦产量和品质提出了更高的需求。 然而， 随着 耕 地面积不断的受到挤压， 在栽培管理措施不变的情况下， 通过小麦育种技术不断培育新的 具有高产、 优质的突破性品种是实现增产增质的唯一手段。 [0003]目前， 虽然 分子学遗传育种技术正在如火如荼的发展， 但是， 由于小麦属于异源六 倍体植物， 具有复杂， 庞大 的基因组， 极大的限制 了小麦的基础研究， 且再加上小麦表型形 状的复杂性等问题， 进一步增大了小麦 分子学育种技术研究的难度， 因此， 目前小麦的育种 技术仍旧采用的是依赖表型选择的传统育种技术， 其所存在的问题是： 1)表型易受环境条 件的影响， 且非常依赖于育种家个人 的经验， 容易受育种家主观因素 的影响， 选择精度低； 2) 利用表型进 行选择， 由于不清楚遗传 背景， 具有盲目性大的缺点， 选择效率低下； 3)品质 性状鉴定程序复杂， 周期长， 难度大， 成本高， 不利于大规模操作。 发明内容 [0004]本发明的目的在于克服现有技术中的的缺陷， 提供了一种16K小麦全基因组mSNP 区段组合、 基因芯片及应用。 [0005]为实现上述目的， 本发明所采取的技 术方案如下： [0006]技术方案一： [0007]一种16K小麦全基因组mSNP区段组合， 其特征在于， 包括15478个mSNP区段， 所述 15478个mSNP区段的物理位置是基于小麦品种中国春(Chinese  Spring)的全基因组序列比 对确定的， 所述16K小麦品种中国春的全基因组序列的版本号为Chinese_Spring  IWGSC  RefSeq 1.0， 所述mSNP区段采用染色体编号_启始位点的物理位置_终止位点的物理位置的 方式进行表示， 15478个所述mSNP区段如S0 0001‑15478所示。 [0008]S00001： 1A_1208095_12082 94； S00002： 1A_3382953_3383124； [0009]S00003： 1A_3845828_3845949； S0 0004： 1A_391 1208_391 1329； [0010]S00005： 1A_4033752_4033873； S00006： 1A_4055921_4056120； [0011]S00007： 1A_6668635_6668674； S0 0008： 1A_67913 57_67915 56； [0012]S00009： 1A_9579728_9579849； S0 0010： 1A_9579875_9579 996； [0013]S00011： 1A_10060497_10060574； S00012： 1A_10 607573_10 607772； [0014]S00013： 1A_14 467814_14 467856； S00014： 1A_14 475247_14 475446； [0015]S00015： 1A_15 373477_15373676； S00016： 1A_1543207 7_15432276； [0016]S00017： 1A_17258547_172586 36； S00018： 1A_17 791668_17791771；说　明　书 1/204 页 3 CN 114525353 A 3