(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210064782.X (22)申请日 2022.01.20 (71)申请人 上海交通大 学医学院附属第九人民 医院 地址 200011 上海市黄浦区制造局路6 39号 (72)发明人 杨庆源　季天海　韩晨杰　朱金潮　 龙满美　郑海燕　 (74)专利代理 机构 上海元好知识产权代理有限 公司 31323 代理人 贾慧琴　包姝晴 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) C12N 15/11(2006.01) G01N 33/68(2006.01) G01N 33/574(2006.01) (54)发明名称 一组用于胶质瘤预后分型的分子标志物及 其分型方法和应用 (57)摘要 本发明公开了一组用于胶质瘤预后分型的 分子标志物及其分型方法和应用， 属于疾病预后 领域。 所述的分子 标志物包 括ATRX和RAD51， 本发 明提出基于ATRX的特定突变类型联合RAD51   mRNA或其DNA甲基化水平的检测， 可以对胶质 瘤 患者的生存期进行预测， 并通过检测结果将病人 更加细致的分为四个亚型， 为胶质瘤的有效治疗 提供潜在的药物靶点。 本发明还经过研究， 指出 了ATRX和RAD51的具体检测指标方法在胶质瘤分 子亚型中的应用， 为本发明标志物的应用提供更 充足的数据支持。 本发明标志物对胶质瘤的预后 分型和评估具有操作简便、 费用低、 效果好等优 点， 易于医疗机构的临床推广。 权利要求书1页 说明书11页 附图8页 CN 114381525 A 2022.04.22 CN 114381525 A 1.一组用于胶质瘤预后分型的分子标志物， 其特征在于， 所述分子标志物包括： ATRX和 RAD51。 2.一种根据权利要求1所述的分子标志物对胶质瘤进行预后分型的方法， 其特征在于， 所述方法包括以下步骤： S1， 检测RAD51的RNA表达水平、 DNA甲基化水平、 蛋白表达水平中的任意一种或多种， 以 及ATRX的突变 类型和/或蛋白表达水平； S2， 根据步骤S1的检测结果对胶质瘤进行预后分型： 当RAD51的RNA表达水平高或DNA甲 基化水平低 或蛋白表达水平高， 以及ATRX为野生型或蛋白表达水平高时， 为生存预后较短 型； 其他情况为预后生存较长型。 3.如权利要求2所述的方法， 其特征在于， 步骤S2中， 当RAD51的RNA表达水平低或DNA甲 基化水平高或蛋白表达水平低， 以及ATRX的突变类型为截断突变或蛋白表达水平低时， 为 预后生存时间最长型。 4.如权利要求1所述的分子标志 物在制备胶质瘤预后评估试剂或试剂盒中的应用。 5.一种胶质瘤预后评估试剂， 其特征在于， 所述试剂能够检测样本 中权利要求1所述的 分子标志 物的蛋白表达水平。 6.如权利要求5所述的胶质瘤预后评估试剂， 其特征在于， 所述的样本为脑胶质瘤组织 样本。 7.如权利要求6所述的胶质瘤预后评估试剂， 其特征在于， 所述试剂包括权利要求1所 述的分子标志 物的蛋白抗体。 8.一种胶质瘤预后评估试剂 盒， 其特征在于， 所述试剂盒包括权利要求5 ‑7中任一项所 述的胶质瘤预后评估试剂。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114381525 A 2一组用于胶质瘤预后分型的分子标志物及其分型方 法和应用 技术领域 [0001]本发明属于疾病预后领域， 具体涉及一组用于胶质瘤预后分型的分子标记物及其 分型方法和应用。 背景技术 [0002]脑胶质瘤是大脑和脊髓胶质细胞癌变起源最常见的原发性颅脑肿瘤， 约占中枢神 经系统起源肿瘤的77％。 根据神经胶质细胞形态将其分为少突神经胶质瘤、 室管膜神经细 胞瘤和星型神经细胞瘤。 世界卫生组织(WHO)依据组织形态学进一步将星型神经细胞瘤分 为四个等级(WHO  I～IV)， I级为纤维性星型细胞瘤(Pilocytic  Astrocytoma， PA)， II级为 弥漫性星型细胞瘤(Diffuse  Astrocytoma， DA)， III级为间变性星型细胞瘤(Anaplastic   Astrocyto ma， AA)， IV级 为恶性胶质瘤(Glioblasto ma， GBM)。 按照恶 性程度又将WHO  I/II级 统称为低级别胶质瘤(Lower ‑grade glioma， LGG)， WHO  III/IV级统称为高级别胶质瘤 (Higher‑grade glioma， HGG)。 不同星型神经细胞瘤的发生频率不同， 其中， 发病率最高的 是WHO IV级GBM， 约占成人脑胶质瘤的67％。 [0003]目前胶质瘤治疗以手术切除为主， 辅以放疗、 化疗等， 小分子靶向药物也仍在临床 研究的不同阶段。 然而， 无论是临床研究的小分子靶向药还是前沿尖端的质子放疗还是最 新的联合靶向治疗方案， HGG患者的预后仍较差， 其中位生存时间(Median  Overall   survival， mOS)仍仅12 ‑18个月。 因此寻找 新的治疗方法及 治疗靶点及其预后评价等是目前 胶质瘤研究中亟 待解决的问题。 [0004]胶质瘤生物遗传学的发展， 表明其发生发展是由多基因参与的复杂过程。 随着神 经分子病理学 的发展， 发现了一系列胶质瘤诊断和预后相关的生物标志物， 并逐步应用于 临床诊断和治疗中。 目前， 胶质瘤常见的的单基因分子病理诊断标记物有IDH1、 ATRX、 1p/ 19q、 EGFR扩增等。 其中， ATRX突变约 见于60‑70％IDH1突变的星型细胞瘤中， 同时细胞核内 ATRX表达的缺失常常是H GG多倍性特征的诊断标准之一。 但是， ATRX在胶质瘤亚型中的预后 诊断价值还存在不一致的观点。 Pekmezci  et al.等人报道称ATRX突变不能预测IDH1突变 星型细胞瘤患者的预后， 仅对IDH1野生型的GBM患者具有正向预后诊断价值。 由此可见， ATRX在不同分子分型胶质瘤中的预后价 值还有待进一步的研究数据支持。 [0005]除了单基因分子诊断标志物， 人们对不同类型胶质瘤的多基因/多组学联合亚群 分子分型也进行了大量研究。 Susmita等人基于ATRX的IHC表达以及IDH1的突变将星型胶质 瘤分为四个亚群： ID H1+/ATRX‑L(loss)， IDH1+/ATRX‑R(retained)， IDH1‑/ATRX‑L， IDH1‑/ATRX ‑R， 四个亚型在低级别胶质瘤和高级别胶质瘤中的分布 存在显著差异； Sandra等 人通过检测 基因组DNA甲基化/IDH突变/1p19q共缺失/WHO组织分型将胶质瘤患者分为四个不同预后亚 型： 预后最差的是IDH野生型的恶性胶质瘤， 其次是IDH突变高级别的星型胶质瘤， 然后是 IDH突变的星型胶质瘤， 预后相对最 好的是IDH突变/1p19q共缺失的少突胶质瘤。 [0006]尽管不同分子标志物(基因组学、 转录组学、 甲基化)在WHO不同级别原发和复发胶 质瘤的诊断和预后价值已经有广泛的研究并得到临床多中心诊断专家的共识推荐， 但是，说　明　书 1/11 页 3 CN 114381525 A 3