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(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210074153.5 (22)申请日 2022.01.21 (71)申请人 阔然生物医药 科技 (上海) 有限公司 地址 201800 上海市嘉定区安亭镇宝安公 路4997号1幢2层A区201室 (72)发明人 毛颖 卜令斌 史之峰 陈永武  陈亮 董雪芳  (74)专利代理 机构 北京中和立达知识产权代理 有限公司 1 1756 代理人 张可 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种成人脑胶质瘤分子分型N GS panel及其 应用 (57)摘要 本发明提供了一种成人胶质瘤分子分型 panel, 该panel基于二代测序技术设计, 针对 IDH1、 IDH2、 CDKN2A、 CDKN2B、 TERT、 EGFR、 H3F3A、 chr7/chr10、 1p/19q、 ATRX、 TP53、 HIST1H3B、 HIST1H3C、 BRAF等基因的全外显子区域及启动子 区域进行检测, 制作成本较低、 覆盖涉及基因可 有效对成人胶质瘤进行分型诊断和预后评估, 具 有广阔的应用前 景。 权利要求书1页 说明书6页 附图2页 CN 114350811 A 2022.04.15 CN 114350811 A 1.一种基于二代测序技术的成人脑胶质瘤分子分型panel, 其特征在于, 所述panel针 对IDH1、 IDH2、 CDKN2A、 CDKN2B、 TERT、 EGFR、 H3F3A、 chr7/chr10、 1p/19q、 ATRX、 TP53、 HIST1H3B、 HIST1H 3C、 BRAF2等基因的全外 显子区域及启动子区域进行检测。 2.如权利 要求1所述的成人脑胶质瘤分子分型panel, 其特征在于, 所述panel包括用于 检测上述基因片段的探针序列。 3.一种用于诊断成人脑胶质瘤分子分型的试剂盒, 其特征在于, 所述试剂盒包括如权 利要求1或2所述的panel。 4.一种用于成人脑胶质瘤预后评估的试剂盒, 其特征在于, 所述试剂盒包括如权利要 求1或2所述的panel。 5.如权利要求1或2所述的成人脑胶质瘤 分子分型panel在用于制备诊断成人脑胶质瘤 分子分型的产品中的应用。 6.如权利要求1或2所述的成人脑胶质瘤 分子分型panel在用于制备成人脑胶质瘤预后 评估的产品中的应用。 7.如权利要求5或6所述的应用, 其特 征在于, 所述产品为试剂盒。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114350811 A 2一种成人脑胶质瘤分子分型NGS  panel及其应用 技术领域 [0001]本发明涉及 医学检测领域, 具体涉及利用一种成人脑胶质瘤分子分型NGS  panel 及其应用。 背景技术 [0002]二代测序(Next ‑generation  sequencing, NGS)又称为高通量测序(High ‑ throughput  sequencing), 是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。 是对于传统的 一代sanger测序的一次创新。 二代测序已经成为目前肿瘤基因检测的主要检测技术。 与其 他检测技 术相比, 优势明显: [0003]1.检测范围广: 传统的Sanger测序仅限于检测基因的错义突变和小插入和缺失。 而对于一些大片段缺失如胶质瘤的E GFRVIII突变涉及的2 ‑7号外显子的缺 失的检测是无法 检测的。 而NGS技术在探针 设计和生信流程搭建过程中进 行一定的部署, 可以检测这些大片 段缺失。 [0004]2.检测费用低: NGS检测技术可以设计一款探针, 该款探针可以涵盖多个基因, 可 以一个平台一次检测多个 基因, 不涉及多个平台、 多次测序, 节约成本 。 [0005]3.测序通量大: 二代测序最显著的特征是高通量,一次性能对几十万到几百万条 DNA分子进行序列测序。 [0006]脑胶质瘤是神经外科最常见的原发性颅内恶性肿瘤, 呈浸润性生长, 侵袭性强, 极 易复发, 严重影响患者的生存期和 生存质量。 胶质瘤最早根据肿瘤的组织形态学分类进行 分型, 可以分为少突胶质细胞瘤、 星 形细胞瘤等各个亚型。 而随着分子生物学与分子遗传学 技术在包括胶质瘤的各类肿瘤研究中的应用, 已发现一系列对诊断、 鉴别诊断及指导分子 靶向治疗有实用价值的生物学标志, 并根据生物学标志的不同, 初步提出了胶质瘤的分子 分型。 [0007]2016年版世界卫生组织(WHO)中枢神经系统肿瘤分类首次在组织学病理的基础上 使用分子病理来进 行胶质瘤分类, 胶质瘤也正式进入分子诊断时代。 在2016年WH O中枢神经 系统分类中推荐胶质瘤检测如IDH、 1p/19q、 H3F3A等分子标志物, 根据检测的分子标志物进 行分子分型(图一)。 而由于这些分子标志物的纳入也出现了一些新的分子亚型, 对胶质瘤 患者进行更精准分型。 随后中国也推出了关于胶质瘤的共识— 《2018年胶质瘤诊疗规范》 。 提出了分子诊断在 胶质瘤分型中的应用。 [0008]随着对胶质瘤的进一步研究, 胶质瘤的更多分子标志物被发现, 新的指南也对胶 质瘤进行新推荐。 cIMPACT ‑NOW更新以及2021版WHO中枢神经系统肿瘤分类中也是根据胶质 瘤的研究提出新的分子标志物检测推荐, 同时根据这些新的分子标志物对原有的胶质瘤分 型提出了一定的改变, 在2021版WHO中枢神经系统肿瘤分类和cIMPACT ‑NOW更新5中提出IDH 突变型的星形细胞瘤作为一个独立亚型, 但会根据微血管增生和坏死以及CDKN2A/B纯合缺 失进行分级(WHO  2, 3, 4级); 在2 021版WHO中枢神经系统肿瘤分类和cIMPA CT‑NOW更新3中提 出IDH野生型的成人弥漫性星 形细胞瘤根据分子特征(TERT启动子突变、 EGFR扩增, 7号染色说 明 书 1/6 页 3 CN 114350811 A 3

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