(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210072736.4 (22)申请日 2022.01.21 (71)申请人 西南科技大 学 地址 621010 四川省绵阳市涪城区青龙 大 道中段59号 (72)发明人 周新力　李鑫　方桃红　张敏　 郑晓晨　王玉琪　田冉　苟兆霞　 李可心　杨随庄　康振生　 (74)专利代理 机构 北京众合诚成知识产权代理 有限公司 1 1246 代理人 刘妮 (51)Int.Cl. C12N 15/29(2006.01) C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种成株期抗条锈病基因QYrsv、 swust -1BL 紧密连锁分子标记及应用 (57)摘要 本发明公开了一种成株期抗条锈病基因 QYrsv.swust ‑1BL紧密连锁分子标记及应用， 该 抗条锈病基因定位于硬粒小麦S vevo参考基因组 1B染色体长臂物理位点662,307,854～ 662,550, 261bp区段内； 该分子标记与抗条锈病基因 QYrsv.swust ‑1BL紧密连锁， 为A012893和 A012894； 分子 标记A012893的引物的核苷酸序列 如SEQ ID NO.36～SEQ  ID NO.38所示； 分子标记 A012894的引物的核苷酸序列如SEQ  ID NO.39～ SEQ ID NO.41所示。 本发明定位的抗条锈病基因 QYrsv.swust ‑1BL可提高小麦品种对小麦 条锈病 的抗性； 与抗病基因紧密连锁的分子标记， 能够 利用标记辅助选择评估该基因在条锈病持久抗 性育种中的应用。 权利要求书1页 说明书10页 序列表11页 附图1页 CN 114410652 A 2022.04.29 CN 114410652 A 1.一种成株期抗条锈病基因QYrsv.swust ‑1BL， 其特征在于， 该成株期抗条锈病基因 QYrsv.swust ‑1BL定位在硬粒小麦Svevo参考基因组1B染色体长臂物理区段内， 该成株期抗 条锈病基因QYrsv.swust ‑1BL的核苷酸序列为硬粒小麦Svevo参考基因组662,307,854～ 662,550,261bp的序列。 2.一种成株期抗条锈病基因QYrsv.swust ‑1BL紧密连锁的分子标记的引物， 其特征在 于， 该分子标记与抗条锈病基因QYrsv.swust ‑1BL两翼紧密连锁的分子标记， 为A012893和 A012894； 分子标记A012893引物的核苷酸序列如SEQ  ID NO.36～SEQ  ID NO.38所示； 分子 标记A012894引物的核苷酸序列如SEQ  ID NO.39～SEQ ID NO.41所示。 3.用于鉴定成株期抗条锈病基因QYrsv.swust ‑1BL的试剂盒， 其特征在于， 该试剂盒中 的引物为如权利要求2中所述的抗条锈病 基因QYrsv.swust ‑1BL紧密连锁的分子标记的引 物。 4.如权利要求2所述的成株期抗条锈病基因QYrsv.swust ‑1BL紧密连锁的分子标记的 引物在分子标记辅助育种或抗条锈病基因QYrsv.swust ‑1BL研究中的应用。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114410652 A 2一种成株期抗条锈病基因Q Yrsv、 swust‑1BL紧密连锁分子标 记及应用 技术领域 [0001]本发明涉及基因紧密连锁的分子标记， 具体涉及一种成株期抗条锈病基因 QYrsv.swust ‑1BL紧密连锁分子标记及应用。 背景技术 [0002]小麦条锈病是威胁小麦生产最严重的真菌病害之一。 结合DNA分子标记技术挖掘 和定位抗条锈病基因， 与常规杂交育种、 以往的细胞遗传染色体分带技术和同工酶技术相 比， 使得基因定位研究更加的方便与快捷， 加速 了抗病品种的培 育进程。 [0003]随着近年新型分子标记的发展及高通量新一代测 序等技术的应用， 单碱基多态性 标记(single  nuclotide  polymorphism,SNP)具有在基因组中分布广、 遗传稳定性高、 单个 位点成本低、 共显性、 等技术优势， 被广泛应用在基因定位、 克隆以及辅助育种当中。 目前开 发的SNP芯片包括9K、 6 60K、 58K、 55K、 35K、 90K、 820K， 已发布在网上 供查询使用。 [0004]KASP(Kompet itive Allele Specific  PCR， 竞争性等位基因PCR)属于SNP  分型检 测技术。 相比传统的SSR分子标记和SNP分析法， 该技术大大简化了操作时间和步骤， 不仅可 以检测单个位 点的突变， 还可以检测片段缺失和大片段插 入比如转基因材 料等。 [0005]在小麦基因定位研究中常用的以PCR(Polymer ase Chain Reaction， 聚合酶链 式 反应)技术为基础的分子标记比如RAPD(Random  Amplification  Polymorphic  DNA， 随机扩 增多态性DNA)、 AFLP(Amplified  Fragment  Length Polymorphi sm， 扩增片段长度多态性)、 SSR(Simple  Sequence  Repeat， 简单序列重复)、 STS(Sequence  Tagged Site， 序列标志位 点)等。 但 这些分子标记绝大部 分通量较低， 且使用起来操作不便， 效率也较为低下， 十 分不 利于大规模检测试验的开展。 小麦基因组研究的复杂性， 阻碍了构建基因的高密度遗传图 谱。 [0006]成株期抗条锈病基因QYrsv.swust ‑1BL来源于硬粒小麦Svevo中， 两侧紧密连锁的 标记分别是IWB5732和IWB4839， 遗传距离为0.75cM(721.8Kb)  (William  et al.,2003； Kolmer,2015； Zhou  et al.,2021)。 在该区域还包含广谱抗病基因Yr29/Lr46/Sr58/P m39， 表现出对多种真菌病害比如白粉病、 叶锈病和秆锈病的抗性。 其中Yr29/Lr 46表现出部 分成 株期抗锈性， 也是和叶片尖端坏死基因(Ltn2)相关联。 在中国和以色列所有试验环境下， QYrsv.swust ‑1BL 解释了11.0％～34.4％的表型变异， 这和Yr29相似(Zhou  et al., 2021)。 因此不能确定这两个基因是否是相同的基因， 或者是等位基因亦或是紧密连锁的基 因， 此外两翼连锁的标记也不是足够和目的基因紧密连锁， 能够有效应用在分子标记辅助 选择育种当中， 因而， 亟需加密图谱， 开发更加精密的分子标记进行辅助选择育种研究， 同 时区分QYrsv.swust ‑1BL和Yr29是否是同一个 基因或是新的成株期抗病位 点。 发明内容 [0007]本发明的目的是提供一种成株期抗条锈病基因QYrsv.swust ‑1BL紧密连锁分子标说　明　书 1/10 页 3 CN 114410652 A 3