(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210078925.2 (22)申请日 2022.01.24 (71)申请人 北京市农林科 学院 地址 100097 北京市海淀区彰化路5 0号北 京市农林科 学院蔬菜所 (72)发明人 李大勇　张彬　刘雪　 (74)专利代理 机构 北京纪凯知识产权代理有限 公司 11245 代理人 关畅 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 鉴定苋菜叶色性状的InDel 分子标记及其应 用 (57)摘要 本发明公开了鉴定苋菜叶色性状的InDel分 子标记及其应用。 本发明具体地公开了与苋菜甜 菜红素合成相关基因连锁的InDel分子标记或检 测所述分子标记的物质在鉴定或辅助鉴定苋菜 叶色性状中的应用， 其中所述分子标记的核苷酸 序列如SEQ  ID No.1所示。 本发明设计了 该InDel 分子标记的引物， 并提供一种鉴定或辅助鉴定苋 菜叶色性状的方法。 本发明的与苋菜甜菜红素合 成相关基因连锁的InDel 分子标记及其引物准确 性高、 特异性强、 稳定性好、 检测简单便捷、 经济 高效， 可广泛应用于苋菜种质资源分析和/或分 子辅助遗传育种等方面。 权利要求书1页 说明书7页 序列表1页 附图1页 CN 114410821 A 2022.04.29 CN 114410821 A 1.分子标记或检测所述分子标记的物质在鉴定或辅助鉴定苋菜叶色性状中的应用， 其 特征在于， 所述分子标记的核苷酸序列如SEQ  ID No.1所示。 2.根据权利要求1所述的应用， 其特征在于， 所述物质含有扩增包含权利要求1中所述 分子标记在内的苋菜基因 组DNA片段的PCR引物。 3.根据权利要求2所述的应用， 其特征在于， 所述PCR引物为引物对， 所述引物对由正向 引物和反向引物组成， 所述正向引物为核苷酸序列是SEQ  ID No.2的单链DNA， 所述反向引 物为核苷酸序列是SEQ  ID No.3的单链DNA。 4.权利要求1中所述的分子标记， 和/或， 权利要求3中所述的引物对。 5.含有权利要求3中所述引物对的试剂盒。 6.一种鉴定或辅助鉴定苋菜叶色性状的方法， 其特 征在于， 所述方法包括以下步骤： A1)以待鉴定苋菜基因组DNA为模板， 利用权利要求3中所述引物对进行PCR扩增， 得到 PCR产物； A2)根据所述PCR产物来 鉴定苋菜叶色性状。 7.根据权利要求6所述的方法， 其特征在于， 根据所述PCR产物来鉴定苋菜叶色性状为： 如果所述P CR产物含有权利要求 1中所述分子标记， 则待鉴定苋菜为红色叶性状或红绿混合 双色叶性状； 如果所述PCR产物不含有权利要求1中所述分子标记， 则待鉴定苋菜为绿色叶 性状。 8.权利要求5所述的试剂盒在鉴定或辅助鉴定苋菜叶色性状中的应用。 9.权利要求1中所述的分子标记， 和/或， 权利要求3中所述的引物对， 和/或， 权利要求5 所述的试剂盒在苋菜种质资源分析和鉴定和/或分子 辅助遗传育种中的应用。 10.扩增权利要求1中所述的分子标记的引物对。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114410821 A 2鉴定苋菜叶色性状的InDel分子标记及其应用 技术领域 [0001]本发明涉及分子标记技术领域， 具体涉及鉴定苋菜叶色性状的InDel分子标记及 其应用。 背景技术 [0002]苋(Amaranthus tricolor  L.)属于苋科苋属， 有多种食用方式， 主要以幼苗或嫩 茎叶作为食用部位， 在我国南方地区有较广泛的食用和种植。 近年来， 因为苋中含有甜菜红 素(betac yanin)， 在其叶片和茎中呈现出独特的红绿混合色， 商品性状鲜明独特， 越来越受 到市场的青睐， 市场需求量逐步提升。 甜菜红素是杂环酪氨酸衍生的具有还原性的一类色 素， 实验表明， 甜菜红素有很强的抗氧化能力， 能够显著抑制低密度脂蛋白的氧化， 并具有 促进免疫系统、 化学治疗癌症， 预防心血管疾病和神经变性疾病的作用。 不仅如此， 甜菜红 素还广泛应用于食品、 制药和化妆品行业。 因此， 对甜菜红素生物合 成的研究具有越来越重 要的生物学意 义和产业 价值。 [0003]插入缺失标记(Insertion ‑deletion,InDel)是指在近缘种或 同一物种 不同个体 之间基因组同一位点的序列发生不同大小核苷酸片段的插入或缺 失， 是同源序列比对产生 空位(gap)的现象。 InDel多态性分子标记是基于插入/缺失位点两侧的序列设计特异引物 进行PCR扩增的标记， 其本质仍属于长度多态性标记， 可利用便捷的电泳平台进行分型。 开 发准确性高、 稳定性好， 检测简单便捷的InDel分子标记在苋菜种质资源分析和鉴定、 分子 辅助遗传育种等领域具有重要的意 义和广泛的应用前 景。 发明内容 [0004]本发明所要解决的技术问题是如何鉴定或辅助鉴定苋菜叶色性状， 和/或， 如何加 快苋菜选择育种进程。 所要解决的技术问题不限于如所描述的技术主题， 本领域技术人员 通过以下描述可以清楚地理解本文未提及的其它技 术主题。 [0005]为解决上述技术问题， 本发明首先提供了InDel分子标记或检测 所述分子标记的 物质在鉴定或辅助鉴定苋菜叶色性状中的应用， 所述分子标记的核苷酸序列如SEQ  ID  No.1所示。 [0006]其中， SEQ ID No.1由138个核苷酸组成。 [0007]所述分子标记在苋菜基因 组DNA起始密码子ATG上游323bp的位置处。 [0008]上述应用中， 所述物质含有扩增包含所述分子标记在内的苋菜基因组DNA片段的 PCR引物。 [0009]上述应用中， 所述PCR引物为引物对， 所述引物对由正向引物和反向引物组成， 所 述正向引物为核苷酸序列是SEQ  ID No.2的单链DNA， 所述反向引物为核苷酸序列是SEQ  ID  No.3的单链DNA。 [0010]所述正向引物名称为AmTCYP76AD ‑Forward  primer； 所述反向引物名称为 AmTCYP76AD‑Reverse primier。说　明　书 1/7 页 3 CN 114410821 A 3