(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210089135.4 (22)申请日 2022.01.25 (71)申请人 广西壮族自治区农业科 学院 地址 530007 广西壮 族自治区南宁市大 学 东路174号 (72)发明人 农保选　秦碧霞　张宗琼　李丹婷　 夏秀忠　崔丽贤　谢慧婷　杨行海　 李战彪　曾宇　梁云涛　廖张波　 施兰蕙　 (74)专利代理 机构 北京鑫瑞森知识产权代理有 限公司 1 1961 代理人 王立普 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/11(2006.01)A01H 1/04(2006.01) (54)发明名称 抗南方水稻黑条矮缩病位点qSRBSDV10及其 分子标记方法 (57)摘要 本发明提供了抗南方水稻黑条矮缩病位点 qSRBSDV10及其分子标记方法， 属于植物分子遗 传学技术领域。 本发明利用水稻抗病品系I5与感 病品种广恢998杂交和自交获得的F2群体进行 QTL‑seq和遗传连锁分析， 获得抗南方水稻黑条 矮缩病位点qSRBSDV10， 其位于分子标记N10 ‑31‑ N10‑35之间， 当存在位点qSRBSDV10时， 使用分子 标记N10‑31能够扩增出150bp的条带， 使用分子 标记N10‑35能够扩增出137bp的条带。 本发明可 通过特定分子标记来检测抗性材料I5及其衍生 品种(系)中是否含有抗南方水稻黑条矮缩病位 点qSRBSDV10， 可预测其南方水稻黑条矮缩病抗 性水平， 大 大提高选择效率。 权利要求书1页 说明书6页 序列表1页 附图1页 CN 114164298 A 2022.03.11 CN 114164298 A 1.一种用于检测抗南方水稻黑条矮缩病位点qSRBSDV10的特异性引物组合， 其特征在 于， 具体序列如SEQ  ID No.1～SEQ ID No.2所示或如SEQ  ID No.3～SEQ ID No.4所示。 2.一种用于检测抗南方水稻 黑条矮缩病位点qSRBSDV10的分子标记， 其特征在于， 所述 分子标记为N10 ‑31或N10‑35； 所述分子标记N10 ‑31的引物序列如SEQ  ID No.1～2所示； 所 述分子标记N10 ‑35的引物序列如SEQ  ID No.3～4所示。 3.一种含有权利要求1所述的引物组合的试剂盒。 4.权利要求1所述的引物组合或权利要求2所述的分子标记或权利要求3所述的试剂 盒 在水稻育种中的应用。 5.权利要求1所述的引物组合或权利要求2所述的分子标记或权利要求3所述的试剂 盒 在快速筛选抗南方水稻黑条矮缩病品种或者品系中的应用。 6.一种抗南方水稻 黑条矮缩病位点qSRBSDV 10的分子标记方法， 其特征在于， 用分子标 记N10‑31或分子标记N10 ‑35扩增水稻抗性材料I5及其衍生品种(系)DNA， 如果用分子标记 N10‑31能扩增出150bp的条带， 或用分子标记N10 ‑35能扩增出137bp的条带， 则标志着水稻 材料中存在抗南方水稻黑条矮缩病位点qSRBSDV10； 所述分子标记 N10‑31的引物序列如SEQ   ID No.1～2所示； 所述分子标记N10 ‑35的引物序列如SEQ  ID No.3～4所示。 7.一种权利要求2所述的分子标记的筛 选方法， 其特 征在于， 包括以下步骤： (1)以抗南方水稻黑条矮缩病的普通野生稻导入系材料I5为供体， 感南方水稻黑条矮 缩病的栽培稻品种广恢9 98为受体， 通过杂交和自交构建了一套水稻F2分离群 体； (2)采用室内接种鉴定对上述群 体的F2： 3系进行南方 水稻黑条矮缩病的抗 性鉴定； (3)在F2群体中选取高抗和高感样本， 提取DNA， 对抗南方水稻黑条矮缩病基因进行基 因定位； (4)在初定位区间， 开发InDel标记， 利用遗传连锁分析技术， 结合分子标记带型及抗性 表型数据， 将目标基因限定在两个分子标记N10 ‑31和N10‑35之间； (5)获得抗南方水稻黑条矮缩病野生稻导入新材料I5抗南方水稻黑条矮缩病位点 qSRBSDV10一个， 位于分子标记N10 ‑31‑N10‑35之间， 通过所述分子标记来检测抗性品种I5 及其衍生品种中是否含有该主基因位 点， 预测其 南方水稻黑条矮缩病抗 性水平。 8.如权利要求7所述的筛选方法， 其特征在于， 所述步骤(3)中基因定位于第10染色体 上。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114164298 A 2抗南方水稻黑条矮缩病位点qSRBSDV10及其分子标记方 法 技术领域 [0001]本发明属于植物分子遗传学技术领域， 尤其涉及抗南方水稻黑条矮缩病位点 qSRBSDV10及其分子标记方法。 背景技术 [0002]水稻是世界上最重要的粮食作物之一， 全世界一半以上的人口以稻米为主要粮 食， 中国60％以上的人口以稻米为主食。 南方水稻黑条矮缩病是一种由白背飞虱以持久增 殖型方式传播的水稻病毒性病害。 水稻各生长期均可受该病危害， 苗期感病 可造成严重矮 缩、 不抽穗或仅抽包颈穗， 造成严重减产甚至绝收； 分蘖期或拔节期感病， 会导致稻穗变小、 秕谷增多， 造成减产。 由于生产上抗该病的水稻品种稀少， 本世纪以来， 该病的发生给中国 中南部、 越南北部及日本南部的水稻生产造成极大损失。 与普通水稻黑条矮缩病不同， 南方 水稻黑条矮缩病是一种以白背飞虱为主要传播媒介的水稻病毒病， 其病原病毒为南方水稻 黑条矮缩病毒(Southern  rice black‑streaked  dwarf virus， 简称SRBSDV)， 是呼肠孤病 毒科斐济病毒属 第2组的一个新种。 生产上针对此病害尚无有效措施， 对该病的防治主要 是 使用化学药剂灭杀传毒媒介白背飞虱， 但由于白背飞虱的种群数量巨大、 迁飞性强， 且耐 药、 传毒持久等特点， 导致防治效果不佳， 此外， 过量使用化学农药还会污染环 境， 破坏生态 系统。 [0003]种植抗病品种是防控水稻病害最经济、 有效的措施之一， 然而， 当前对该病抗源发 掘的报道较少， 鉴定到的抗源有限， 仅有少数关于南方水稻黑条矮缩病抗性基因/QTL定位 的报道， 定位抗性基因、 利用紧密连锁的分子标记可加速抗病育种进程， 因此， 加强南方水 稻黑条矮缩病抗性基因/QTL的发掘、 开发与抗性基因紧密连锁的分子标记， 对抗南方水稻 黑条矮缩病水稻育种意 义重大。 发明内容 [0004]为了解决上述技术问题， 本发明提供了一种抗南方水稻黑条矮缩病位点 qSRBSDV10、 分子标记方法及其应用。 本发明利用水稻抗病品系I5与感病品种广恢998杂交 和自交获得的F2群体进行QTL ‑seq和遗传连锁分析， 获得抗南方水稻黑条矮缩病位点 qSRBSDV10， 其位于分子标记N10 ‑31‑N10‑35之间， 当存在位点qS RBSDV10时， 使用分子标记 N10‑31能够扩增出150bp的条带， 使用分子标记N10 ‑35能够扩增出137bp的条带。 本发明可 通过特定分子标记来检测抗性材料I5及其衍生品种(系)中是否含有抗南方水稻黑条矮缩 病位点qSRBSDV10， 可预测其南方水稻黑条矮缩病抗性水平， 大大提高选择效率， 对水稻抗 病育种有重要的指导和实 践意义。 [0005]为了实现上述目的， 本发明采用了以下技 术方案： [0006]本发明提供了一种用于检测抗南方水稻黑条矮缩病位点qSRBSDV10的特异性引物 组合， 具体序列如SEQ  ID No.1～SEQ ID No.2所示或如SEQ  ID No.3～SEQ ID No.4所示。 [0007]本发明还提供了一种用 于检测抗南方水稻黑条矮缩病位点qSRBSDV10的分子标说　明　书 1/6 页 3 CN 114164298 A 3