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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210090300.8 (22)申请日 2022.01.25 (71)申请人 广西壮族自治区药用植物园 地址 530000 广西壮 族自治区南宁市 兴宁 区厢竹大道8 8号 (72)发明人 汤丹峰 韦范 缪剑华 全昌乾  韦坤华  (74)专利代理 机构 武汉蓝宝石专利代理事务所 (特殊普通 合伙) 42242 专利代理师 方菲 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 鉴定仙草品种的EST-SSR分子标记、 试剂盒 及鉴定方法 (57)摘要 本发明提供一种提供鉴定仙草品种的EST ‑ SSR分子标记、 试剂盒及鉴定方法, 利用转录组数 据中的EST序列分析其所含微卫星重复序列的组 成和特征, 开发仙草EST ‑SSR引物, 并验证仙草 EST‑SSR引物有效性及其在仙草中的通用性, 以 期为仙草及其近缘属种的亲缘关系鉴定、 系统进 化、 遗传变异、 遗传图谱构建等研究提供重要的 工具和有价 值的信息 。 权利要求书2页 说明书23页 附图4页 CN 114507748 A 2022.05.17 CN 114507748 A 1.一种鉴定仙草品种的EST ‑SST分子标记, 其特征在于, 所述分子标记所针对 的SSR位 点包括TDF016位点、 TDF032位点、 TDF048位点、 TDF050位点、 TDF109位点、 TDF139位点、 TDF166位点、 TDF172位点及TDF191位点, 各位点核苷酸序列所包含的重复单元分别为(CCT) 5、 (CAA)5、 (CAA)6、 (ACC)7、 (TGA)8、 (TCA)7、 (CATC CTT)5、 (CAC)7及(G GT)5。 2.一种鉴定仙草品种的EST ‑SST分子标记引物组, 其特 征在于, 包括: 引物对1: GACCAACCAATCATGTTCCC和AAGAAGGTGTGGTTGTTGGC; 引物对2: TTAGATGTTCCTCGAACCCG和GCATC CCGACGTGATAGACT; 引物对3: GGAGCAATTCGCTTCAGTTC和CATGTAGC CGATCCCAATTT; 引物对4: AACTGAATCCCAATTGCAGC和TG GGAAGCTGTCA ACACTCA; 引物对5: GGACTGAAACTGGGAGTGGA和GATC CAGCTTCATGGGAAGA; 引物对6: TCCTCCGCTTTGTTCATTCT和AGGTTGCGTACATCTGAC CC; 引物对7: CCCTCAATTCATCCCTCTCA和AT TGATGAAGAGACTGCG GG; 引物对8: AGCATCCTGCGACTC CTAAA和CCGGAAATACGAATGCCTAA; 引物对9: GTGGAAAGGGTGGAGGATTT和TCCTCCTCCAGCACCACTAC。 3.一种鉴定仙草品种的试剂盒, 其特征在于, 包括权利要求2所述的EST ‑SST分子标记 引物组。 4.根据权利要求3所述的鉴定仙草品种的试剂盒, 其特征在于, 还包括DNA提取试剂、 DNA聚合酶预混液及电泳试剂中的至少一种。 5.一种鉴定仙草品种的方法, 其特 征在于, 包括如下步骤: 提供待鉴定品种, 提取样品基因 组DNA; 采用权利 要求2所述的鉴定仙草品种的EST ‑SST分子标记引物组, 通过荧光PCR扩增, 得 扩增产物; 将所述扩增产物进行电泳检测荧 光PCR扩增条 带。 6.根据权利要求5所述的鉴定仙草品种的方法, 其特 征在于, 还 包括如下步骤: 再将扩增产物稀释, 加入 包含Liz 500内标的去离 子甲酰胺, 进行毛细管电泳检测; 将所述毛细管电泳检测结果进行峰图分析, 得到等位基因分型表及分型峰图, 编码形 成指纹图谱。 7.根据权利要求5或6所述的鉴定仙草品种的方法, 其特征在于, 所述荧光PCR的反应体 系为: 1 μL基因 组DNA, 0.3 μL上 下游引物, 5 μL  2×Taq PCR Master Mix, 超纯 水补足至10 μL。 8.根据权利要求7所述的鉴定仙 草品种的方法, 其特征在于, 所述荧光PCR的反应程序权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 114507748 A 2为: 95℃预变性5min, 9 5℃变性30s, 62~ 52℃退火30s, 72℃延伸30s, 运行 10个循环, 9 5℃变 性30s, 52℃退火3 0s, 72℃延伸3 0s, 运行25个 循环, 最后72℃延伸20mi n。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 114507748 A 3

PDF文档 专利 鉴定仙草品种的EST-SSR分子标记、试剂盒及鉴定方法

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