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(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210090118.2 (22)申请日 2022.01.25 (71)申请人 上海纽仁生物医药 科技有限公司 地址 200000 上海市松江区九亭镇九新公 路800号1号楼 905室-1 (72)发明人 张允斌 张倩  (74)专利代理 机构 成都顶峰专利事务所(普通 合伙) 51224 代理人 钱学宇 (51)Int.Cl. C12N 15/113(2010.01) C12N 15/11(2006.01) C12Q 1/6886(2018.01) C12Q 1/6851(2018.01) (54)发明名称 hsa_circ_000642 0环状RNA及其在胶质瘤诊 断、 预后评估中的应用 (57)摘要 本发明公开了一种hsa_circ_0006420环状 RNA及其在胶质瘤诊断、 预后评估中的应用, 属于 癌症诊断领域。 hsa_circ_0006420环状RNA的核 苷酸序列如SEQ  ID NO.1所示。 本发明得到一个 新的hsa_circ_0006420环状RNA基因, 胶质瘤肿 瘤组织以及患者血液样本中的hsa_circ_ 0006420环状RNA表达显著升高, 可应用于胶质瘤 诊断、 替莫唑胺治疗后响应以及患者生存期预 测。 权利要求书1页 说明书6页 序列表2页 附图3页 CN 114277031 A 2022.04.05 CN 114277031 A 1.一种hsa_circ_0 006420环状RNA基因, 其核苷酸序列如SEQ  ID NO.1所示。 2.一种用于检测hsa_circ_0006420环状RNA基因的检测引物, 其特征在于, 所述检测引 物的核苷酸序列如S EQ ID NO.2~3所示, 所述检测引物可用于制备胶质瘤 诊断或预后评估 试剂盒。 3.一种hsa_circ_0006420环状RNA基因作为分子标志物在制备用于诊断胶质瘤的试剂 盒中的应用。 4.一种用于检测hsa_circ_0006420环状RNA基因的试剂在制备用于胶质瘤诊断或预后 评估的试剂盒中的应用。 5.根据权利要求4所述的应用, 其特征在于, 所述检测hsa_circ_0006420环状RNA基因 的试剂选自: 对hsa_circ_0006420环状RNA基因具有检测特异性的探针、 基因芯片或如SEQ   ID NO.2~3所示的检测引物。 6.根据权利要求4所述的应用, 其特征在于, 所述试剂 盒还包括RNA提取试剂、 逆转录反 应体系和荧 光定量PCR试剂。 7.一种用于胶质瘤诊断或胶质瘤预后评估的试剂盒, 其特征在于, 所述试剂盒包括如 权利要求2所述的检测引物。 8.根据权利要求7所述的用于胶质瘤诊断或胶质瘤预后评估的试剂 盒, 其特征在于, 所 述试剂盒还 包括荧光定量PCR试剂。 9.根据权利要求8所述的用于胶质瘤诊断或胶质瘤预后评估的试剂 盒, 其特征在于, 所 述荧光定量PCR试剂总量为20 μL包括: 1 μL的cDNA、 0.2 μL、 10 μM的如SEQ  ID NO.2所示的检测 引物、 0.2 μL、 10 μM的如SEQ  ID NO.3所示的检测引物、 10 μL的2X  PCR Master Mix。 10.一种用于检测hsa_circ_0006420环状RNA基因的试剂在制备用于评估抗肿瘤药物 对胶质瘤治疗效果的试剂盒中的应用; 优选地, 所述 抗肿瘤药物为 替莫唑胺。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114277031 A 2hsa_circ_0 006420环状RNA及其在胶质瘤诊断、 预后评估中的 应用 技术领域 [0001]本发明属于癌症诊断技术领域, 具体涉及一种hsa_circ_0006420环状RNA及其在 胶质瘤诊断、 预后评估中的应用。 背景技术 [0002]脑胶质瘤是成年人最为频发的脑肿瘤疾病, 占颅内肿瘤的40.49%。 从确诊开始, 脑胶质瘤患者平均生存寿命不超过五年。 目前而言胶质瘤的诊断和治疗方法虽处于不断改 进阶段, 但是胶质瘤患者生存率并没有明显提高。 胶质瘤诊断仍然处于以临床、 病理学和影 像学信息为基础的经验性阶段, 而且一经诊断, 绝大多 数均为中晚期, 手术后的生存率不容 乐观。 因此, 寻找胶质瘤早期诊断标志物对患者进行 “早发现, 早治疗 ”, 以及提高胶质瘤患 者的生存期, 并相应地选择合理的后续治疗方案, 是神经 科学领域亟待解决的研究任务。 [0003]CircRNA是近年来发现的非编码RNA家族重要成员, 其形成没有极性和聚腺苷酸尾 的环化结构, 由于circRNA分子呈封闭环状结构, 具有 更高的核酸 酶稳定性, 不受RNA外切酶 影响, 不易降解, 这使 得它们成为临床应用新型生物标记具有很大的优势。 高通量测序和生 物信息学方法揭示了circRNA在真核生物中广泛表达。 研究发现大多数circRNA参与一些肿 瘤的发生 发展, 在病理条件 下以组织特异 性异常表达。 研究发现circRNA在肿瘤发生发展中 发挥关键作用, 其作用机制上主要包括方面: (1)circRNA作为miRNA的吸附物(sponge), 通 过吸附miRNA调控其靶基因和下游 通路的表达, 进而影 响胶质瘤的发生发展; (2)circRNA通 过翻译成肽段或者蛋白发挥作用; (3)通过结合母基因(host  gene)DNA序列介导母基因 mRNA的转录调控, 这些 特性使得circRNA成为肿瘤诊断和治疗的重要靶点和潜在标志 物。 发明内容 [0004]本发明针对现有胶质瘤诊断的缺陷, 提供一种用于胶质瘤诊断和预后评估的新靶 标, 即hsa_circ_0006420环状RNA 基因, 并提供该靶 标的新应用, 特别是在其检测试剂、 胶质 瘤诊断、 肿瘤药物对胶质瘤的治疗效果以及 胶质瘤预后评估中的应用。 [0005]本发明通过以下技 术方案实现: [0006]第一方面, 本发明提供一种hsa_circ_0006420环状RNA基因, 其核苷酸序列如SEQ   ID NO.1所示。 [0007]hsa_circ_0006420环状RNA分子是由AEBP2基因的第2和3号外显子首位相接连接 而成的环状RNA分子(AEBP2基因全长79,021nt, 共由9个外显子组成。 hsa_circ_0006420环 状RNA全长序列为: [0008]CATAAGCAGTACTATAATGGATGTAGACAGCACAATTTCCAGTGGGCGTTCAACTCCAGCAATGATGA ATGGACAA GGAAGCACTACTTCTTCAA GCAAAAATATTGCCTATAATTGTTGTTGGGACCA GTGCCAGGCTTGCTT CAACTCTA GCCCAGATCTGGCA GATCACATCCGTTCCATACATGTA GATGGTCA GCGAGGAGGGGTATTTGTTTGC TTATGGAAA GGTTGTAAA GTATATAACACTCCATCTACCA GTCAAAGTTGGTTACAAA GGCATATGCTGACACACA说 明 书 1/6 页 3 CN 114277031 A 3

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