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(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210095125.1 (22)申请日 2022.01.26 (71)申请人 四川大学 地址 610000 四川省成 都市一环路南 一段 24号 (72)发明人 邓锐杰 朱小颖 罗爱民 吴茗花  (74)专利代理 机构 成都四合天行知识产权代理 有限公司 51274 代理人 董斌 (51)Int.Cl. C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一对Wxc型糯高粱的ARMS-PCR引物及其分子 检测方法 (57)摘要 本发明公开了一对Wxc 型糯高粱的ARMS ‑PCR 引物及其分子检测方法, 本发明属于糯高粱甄选 检测技术领域。 公开的引物Wxc ‑F、 Wxc‑R的核酸 序列分别如SEQ  ID NO: 1、 SEQ  ID NO: 2所示, Wxc 型糯高粱的ARMS ‑PCR分子检测方法, 包 括如下步 骤: (1)ARMS ‑PCR引物对 Wxc‑F、 Wxc‑R的设计; (2) 样品总DNA的提取, 利用S1的引 物进行ARMS ‑PCR 扩增反应; (3)采用琼脂糖凝胶电泳法检测扩增 产物, 根据凝胶成像系统上成像判定检测结果, 若有条带生成, 则表明该样品中含Wxc型糯高粱; 若无条带生成, 则表明该样品中不含Wxc型糯高 粱。 本发明不需要限制性内切酶进行切割, 且适 用于大量样品分析。 权利要求书1页 说明书5页 序列表3页 附图3页 CN 114164259 A 2022.03.11 CN 114164259 A 1.一对Wxc型糯高粱的ARMS ‑PCR引物, 包括Wxc ‑F、 Wxc‑R, 其核酸序列分别如SEQ  ID  NO: 1、 SEQ ID NO: 2所示。 2.Wxc型糯高粱的ARMS ‑PCR分子检测方法, 其特 征在于, 包括如下步骤: (1)ARMS‑PCR引物对Wxc ‑F、 Wxc‑R的设计; (2)样品总DNA的提取, 利用S1的引物进行ARMS ‑PCR扩增反应; (3)采用琼脂糖凝胶电泳法检测扩增产物, 根据凝胶成像系统上成像判定检测结果, 若 有条带生成, 则表明该样品中含Wxc型糯高粱; 若 无条带生 成, 则表明该样品中不含Wxc型糯 高粱。 3.根据权利要求2所述的Wxc型糯高粱的ARMS ‑PCR分子检测方法, 其特征在于, 步骤(2) 中, 所述扩增反应的体系: 10μL  2×PCR Master, 1μL  DNA模板, 1μL  Wxc‑F, 1μL Wxc‑R, SterileddH2O补齐到20 μL。 4.根据权利 要求2或3所述的Wxc型糯高粱的ARMS ‑PCR分子检测方法, 其特征在于, 步骤 (2)中, 所述扩增反应的条件为: 94℃预变性3min, 之后进行32个循环的94℃30s、 50℃30s、 72℃30s, 最后进行 72℃终止延伸7mi n。 5.根据权利要求2所述的Wxc型糯高粱的ARMS ‑PCR分子检测方法, 其特征在于, 步骤(3) 中, 所述琼脂糖凝胶电泳判别的方法是: 取5μL的ARMS ‑PCR扩增产物, 加入1μL6 ×Loading  buffer, 混匀, 加入到3%的琼脂糖凝胶中, 于150V电压下电泳30min, 在凝胶成像系统上成 像观察结果。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114164259 A 2一对Wxc型糯高粱的ARMS ‑PCR引物及其分子检测方 法 技术领域 [0001]本发明属于糯高粱甄选检测技术领域, 具体涉及一对Wxc型糯高粱的ARMS ‑PCR引 物及其分子检测方法。 背景技术 [0002]高粱为世界重要粮食作物之一, 与许多禾谷类作物一样, 其种子 的胚乳具有糯性 和粳性之分, 这是 由胚乳中直链淀粉和支链淀粉含量及比例决定的。 颗粒结合淀粉合成酶 (GBSS)是淀粉合 成途径中的关键酶, 它直接参与直链淀粉的生物 合成。 高粱糯性性状 分为4 种类型Wxa、 Wxb、 Wxc和Wxd。 Wxc是由GBSS基因第九内含子上有1个G缺失, 导致阅读 框的转变 和早期翻译终止 。 该缺失位于原核生物和真核生物高度保守的区域。 [0003]糯高粱是酿造白酒的主要原 料, 国酒茅台、 五粮液、 郎酒等名酒的酿酒工艺对高粱 有着特殊要求。 选育具有高乙醇转化率、 高产量、 高品质等优良籽粒性状的糯性高粱越来越 受到白酒行业的重视。 据有关文献报道, 我国西南地区白酒酿造用糯高粱主要为Wxa型和 Wxc型糯高粱。 [0004]过去糯高粱的鉴别方法主要为碘染色法、 双波长比色法等, 仪器简单、 操作方便, 但存在无法通量检测、 效率低的问题, 随着生物检测技术的发展, 生物检测技术也应用在了 糯高粱甄选上。 目前, 针对高粱糯性性状鉴别普遍采用普通PCR法和全基因组测序法。 ①普 通PCR法: 是一种在体外对 特定的DNA片段进行扩增的技术, 可以将少量的DNA片段进 行放大 扩增。 PCR技术的操作简 便, 只需将反应液和引物加入P CR仪中, 大部 分过程都能由仪器自动 完成, 扩增过程也较为迅速, 一般只需要3个小时左右即可完成扩增 。 不过, PCR反应产物需 要用限制性内切酶对产物进行酶切, 进行观察实验结果。 其反应耗材较多, 操作复杂。 ②全 基因组测序法: 全基因组测序包含糯高粱个体的核DNA的全部遗传信息, 与参考粳高粱基因 组比对可以获得非常全面的遗传标记信息, 如SNP等分子标记。 但 其成本高、 时间周期 长, 不 适用于大量样品分析, 因此很难在大多数检测部门推广使用。 [0005]ARMS‑PCR分子检测是比较好的方法, 专利申请号为2020111655981、 专利名称为 Wxc型糯高粱的ARMS ‑PCR引物及其分子检测方法的专利申请就公开了Wxc型糯高粱的ARMS ‑ PCR分子检测方法, 然而该申请虽然公开了Wxc型糯高粱的ARMS ‑PCR分子检测方法, 但是其 引物却并未公开, 使得该方法无法得以实现, 其它引物已无法应用于Wxc型糯高粱 的ARMS‑ PCR分子检测。 发明内容 [0006]本发明的目的在于提供一对Wxc型糯高粱的ARMS ‑PCR引物及其分子检测方法, 以 解决现有酿 酒高粱检测技术存在成本高、 时间周期 长, 不适用于大量样品分析, 因此很难在 大多数检测部门推广使用的问题。 [0007]为实现上述目的, 本发明采用的技 术方案如下: [0008]Wxc型糯高粱的ARMS ‑PCR引物, 包括Wxc ‑F、 Wxc‑R, 其核酸序列 分别如SEQ  ID NO:说 明 书 1/5 页 3 CN 114164259 A 3

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