(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210098252.7 (22)申请日 2022.01.26 (71)申请人 中山大学附属第一医院 地址 510000 广东省广州市中山 二路58号 (72)发明人 莫承强　谢云　关键烽　吴荣佩　 (74)专利代理 机构 广州三环 专利商标代理有限 公司 44202 专利代理师 薛梦 (51)Int.Cl. C12Q 1/06(2006.01) C12Q 1/689(2018.01) C12N 15/11(2006.01) A61K 45/00(2006.01) A61P 13/04(2006.01) A23L 33/135(2016.01)G16B 30/10(2019.01) G16B 50/30(2019.01) G16B 20/00(2019.01) G16B 25/00(2019.01) G16B 25/20(2019.01) G16H 50/30(2018.01) (54)发明名称 一种微生物标志物及其在诊断男性泌尿道 结石的应用 (57)摘要 本发明涉及微生物 技术领域， 具体公开了一 种微生物标志物及其在诊断男性泌尿道结石的 应 用 。所 述 微 生 物 标 志 物 包 括 菌 目 Bacteroidales、 Bifidobacteriales、 Campylobacterales、 Enterobacteriales、 Neisseriales及Pasteurellaless。 本发明可以 通过检测男性泌尿道微生物表型与泌尿道结石 发病的关系， 并建立应用泌尿道 微生态辅助泌尿 道结石的诊断、 筛选泌尿道结石发病的高危人 群， 为泌尿道结石的精准防控提供新的手段。 权利要求书1页 说明书5页 序列表1页 附图2页 CN 114507705 A 2022.05.17 CN 114507705 A 1.一种辅助男性泌尿道结石无创诊断的微生物标志物， 其特征在于， 所述微生物标志 物包括菌目Bacteroidales、 Bifidobacteriales、 Campylobacterales、 Enterobacteriales、 Neis seriales及Pasteurel laless。 2.一种检测如权利要求1所述的微生物标志物的试剂， 其特征在于， 所述试剂包括如 SEQ ID NO:1‑2所示的引物。 3.如权利要求1所述的微生物标志物或如权利要求2所述的试剂在构建预测男性泌尿 道结石发病风险的计算模型中的应用。 4.如权利要求3所述的应用， 其特征在于， 计算模型的输入变量为如权利要求1所述的 微生物标志物的相对丰度； 优选地， 微生物标志物的相对丰度的测定方法包括宏基因组测 序、 16S rRNA扩增子测序、 微 滴式数字PCR、 qPCR定量检测中的一种或多种。 5.如权利要求1所述的微生物标志物或如权利要求2所述的试剂在制备预测男性泌尿 道结石发病风险的诊断试剂或诊断试剂盒中的应用。 6.一种诊断试剂 盒， 其特征在于， 包括检测如权利要求1所述的微生物标志物含量的试 剂。 7.如权利要求6所述的诊断试剂盒， 其特征在于， 所述试剂包括聚合酶链式反应、 逆转 录‑聚合酶链式反应、 巢式PCR或核酸杂交用试剂。 8.如权利要求6或7所述的诊断试剂盒， 其特征在于， 尿液微生物标志物含量是通过扩 增待检测男性患者尿液样本中的结石特征尿液微生物标志物的基因组特征性片段来确定 的； 优选地， 所述片段为16S  rRNA基因的片段， 所述扩增通过聚合酶链 式反应实现； 所述检 测通过高通 量测序仪实现。 9.一种利用如权利要求1所述的微生物标志物辅助男性泌尿道结石的诊断系统， 其特 征在于， 所述系统包括核酸样本分离系统、 测序系统、 比对判定系统， 所述比对判定系统与 所述测序系统相连； 优选地， 所述比对判定系统包括数据处 理单元和结果判定单 元。 10.一种如权利要求1所述的微生物标志物在制备预防/或治疗男性泌尿道结石药物或 功能性食品中的应用。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114507705 A 2一种微生物标志物及其在诊断男性泌 尿道结石的应用 技术领域 [0001]本发明涉及 微生物技术领域以及医药技术领域， 尤其是一种微生物标志物及 其在 诊断男性泌尿道结石的应用。 背景技术 [0002]泌尿道结石(urolithiasis)是指在泌尿系统内因尿液中不溶于水 的沉淀形成颗 粒或成块样聚集物， 包括肾结石、 输尿管结石、 膀胱结石和尿道结石。 泌尿道结石是一种常 见的泌尿道疾病， 严重的泌尿道结石可引起剧烈的下背部疼痛或腹痛、 尿血、 继发感染、 引 起肾功能受损等。 目前导致泌尿道结石的仍不清晰， 且其 发病率在不同地区有明显差异。 有 研究指出， 泌尿道结石的发病有明显的性别差异， 男性泌尿道结石的患病率明显高于女性， 约为4～5:1。 [0003]据研究， 男性易发生泌尿道结石的已知原因包括： 男性体内雄激素水平较高， 容易 在泌尿道积累结石 前体物质； 慢性泌尿道较为狭长且输尿管紧张度高， 尿液流动速度 慢， 结 石前体成分不易排出。 目前泌尿道结石的诊断主要依赖于泌尿道B超、 X线造影、 CT或MRI的 影像学检查， 暂无不依赖影像学 的其它无创诊断手段。 由于影像学仅能识别已形成一定体 积的结石， 因此目前临床 暂无预判泌尿道结石高危人群的诊断方案， 不能对高危人群尤其 是男性群 体进行早期的预防。 发明内容 [0004]本发明的目的在于克服上述现有技术的不足之处而提供一种微生物标志物及其 在诊断男性泌尿道结石的应用。 本发明可以通过检测男性泌尿道微生物表型与泌尿道结石 发病的关系， 并建立应用泌尿道微生态辅助泌尿道结石的诊断、 筛选泌尿道结石发病的高 危人群， 为泌尿道结石的精准防控提供新的手段。 [0005]第一目的， 本发明提供了一种辅助男性泌尿道结石无创诊断的微生物标志物， 所 述微生物标志物包括菌目Bacteroidales、 Bifidobacteriales、 Campylobacterales、 Enterobacteriales、 Neis seriales及Pasteurel laless。 [0006]第二目的， 本发明提供了一种检测上述微生物标志物的试剂， 所述试剂包括如SEQ   ID NO:1‑2所示的引物。 [0007]第三目的， 本发明提供了上述微生物标志物或如试剂在构建预测男性泌尿道结石 发病风险的计算模型中的应用。 [0008]作为本发明所述应用的优选实施方式， 计算模型的输入变量为上述微生物标志物 的相对丰度； 优选地， 微生物标志物的相对丰度的测定方法包括宏基因组测序、 16S  rRNA扩 增子测序、 微 滴式数字PCR、 qPCR定量检测中的一种或多种。 [0009]本发明将泌尿道菌群(即本发明的微生物标志物)的相对丰度或含量作为预测指 标， 因此， 采用上述的分子生物学方式均可对其进 行检测， 这种多样化的定量手段可打破特 定实验条件和实验技能的限制， 使某些不具备特定实验设备的实验室也可实验本发明的数说　明　书 1/5 页 3 CN 114507705 A 3