(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210098504.6 (22)申请日 2022.01.27 (71)申请人 深圳联合医学 科技有限公司 地址 518000 广东省深圳市南 山区西丽 街 道留仙洞村留仙文化园(原 ‘桑泰科技 园’)第6栋2楼202室 (72)发明人 谭爱女　郭永超　王艳平　徐露　 (74)专利代理 机构 上海助之鑫知识产权代理有 限公司 31328 代理人 陈详 (51)Int.Cl. C12Q 1/70(2006.01) C12Q 1/6851(2018.01) C12N 15/11(2006.01) C12R 1/93(2006.01) (54)发明名称 检测新型冠状病毒及其Omicron突变株的试 剂盒和方法 (57)摘要 本发明公开了一种检测新型冠状病毒及其 Omicron突变株的试剂盒和方法。 本发明通过对 新冠ORF1ab、 N、 S三靶标基因进行联合检测对新 型冠状病毒进行定性检测， 同时S基因检测靶标 区域覆盖Omicron变异株的特异性突变位点， 如 若新型冠状病毒为Omicron变异株， 因突变位点 的发生会 导致S基因丢失无信号， 从而对Omicron 变异株与非Omicron变异株进行鉴别。 本发明的 检测试剂， 能够高效率、 高特异性、 高稳定性、 低 成本的对新型冠状病毒及其 Omicron突变株感染 患者进行检测。 权利要求书1页 说明书14页 序列表9页 附图6页 CN 114107574 A 2022.03.01 CN 114107574 A 1.一种用于检测新型冠状病毒及其Omicron变异株的引物对集， 其特征在于， 所述引物 对集包括第一引物对： 所述第一引物对包括： 如SEQ  ID NO.7所示的正向引物； 和， 如SEQ  ID NO.8所示的反向 引物。 2.如权利要求1所述的引物对集， 其特征在于， 所述引物对集还包括检测新型冠状病 毒 ORF1ab基因、 和/或N基因的引物对。 3.如权利要求1所述的引物对集， 其特征在于， 所述引物对集还包括选自下组 的一种或 多种引物对： 第二引物对， 所述第二引物对特异性扩增新型冠状病毒ORF1ab基因， 所述第二引物对 包括： 如SEQ ID NO.1所示的正向引物； 和， 如SEQ  ID NO.2所示的反向引物； 第三引物对， 所述第三引物对特异性扩增新型 冠状病毒N基因， 所述第三引物对 包括： 如SEQ ID NO.4所示的正向引物； 和， 如SEQ  ID NO.5所示的反向引物； 第四引物对， 所述第四引物对特异性扩增内参  RNase P基因， 所述第四引物对 包括： 如SEQ ID NO.10所示的正向引物； 和， 如SEQ  ID NO.11所示的反向引物。 4.一种用于检测新型冠状病毒及其Omicron突变株的探针集， 其特征在于， 所述探针集 包括： 核苷酸序列如SEQ  ID NO.9所示的第一探针。 5.如权利要求4所述的探针集， 其特征在于， 所述探针集还包括选自下组 的一种或多种 探针： 核苷酸序列如SEQ  ID NO.3所示的第二探针； 核苷酸序列如SEQ  ID NO.6所示的第三探针； 核苷酸序列如SEQ  ID NO.12所示的第四探针。 6.一种用于检测新型冠状病毒及其Omicron突变株的试剂盒， 其特征在于， 所述试剂盒 包括用于检测新型冠状病毒及其Omicron变异株的引物对， 所述引物对包括： 如SEQ  ID  NO.7所示的正向引物； 和， 如SEQ  ID NO.8所示的反向引物。 7.如权利要求6所述的试剂 盒， 其特征在于， 所述试剂盒包括权利要求1至3任一项所述 的引物对集。 8.如权利要求7所述的试剂 盒， 其特征在于， 所述试剂盒还包括权利要求4或5所述的探 针集。 9.一种非诊断目的的检测新型冠状病毒及其Omicron突变株的方法， 其特征在于， 所述 方法包括 步骤： （1） 提供待检测对象的样本； （2） 制备荧 光定量PCR反应 体系并进行荧 光定量PCR检测： 其中， 所述荧光定量PCR反应体系包括： 步骤 （1） 提供的所述样本、 权利要求1所述的引 物对集、 和权利要求 4所述的探针集。 10.权利要求1至3任一项所述的引物对集、 和/或权利要求4至5任一项所述的探针集的 用途， 用于制备PCR检测试剂盒， 所述PCR检测试剂盒用于检测新型冠状病毒及其Omicr on突 变株。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114107574 A 2检测新型冠状病毒及其Omicron突变株的试剂盒和方 法 技术领域 [0001]本发明属于生物技术领域， 具体地说本发明涉及一种检测新型冠状病毒及其 Omicron突变株的试剂盒和方法。 背景技术 [0002]新型冠状病毒(SARS ‑CoV‑2)是一种单股正链RNA病毒， 容易发生变异。 在临床上， 新冠病毒感染者的症状差异较大， 从无症状到危重症都有可能发生。 除了个体因素 的差异 外， 病毒变异也可能是导 致感染患者症状差异大的重要因素。 [0003]研究表明， 新型冠状病毒突变速率约为每月2～4个突变， 目前在已知的株系 发现 了超过25个突变的变异株。 相继在多个国家发现Alpha新冠变异株、 Beta新冠变异 株、 Gamma 新冠变异株、 Delta新冠变异株、 Omicr on新冠变异株， 它们在病毒表 面刺突蛋白的受体结合 域(RBD)发生了突变， 使其与人体细胞表面的血管紧张素转化酶2(ACE2)受体更容易结合， 病毒的变异会显著影响其传播能力和致病能力。 [0004]新冠病毒奥密克戎变异株在病毒刺突 （Spike） 蛋白突变较多， 同时具有前4个变异 株Alpha （阿尔法） 、 Beta （贝塔） 、 Gamma （伽玛） 和Delta （德尔塔） 刺突蛋白的重要氨基酸突变 位点， 包括增强细胞受体亲和力和病毒复制能力的突变位 点， 导致其具有极强的传播能力。 [0005]因此， 开发一种能够同时检测新型冠状病毒以及Omicron变异株的联合筛查试剂 盒， 对于疫情防控和 确诊患者的治疗具有非常积极的意 义。 发明内容 [0006]本发明针对新型冠状病毒及其Omicron变异株开发了快速检测新型冠状病毒及 Omicron突变株的组合物、 试剂盒、 方法及用途。 [0007]在本发明的第一方面， 提供了一种用于检测新型冠状病毒及其Omicron变异株的 引物对集， 所述引物对集包括第一引物对： 所述第一引物对包括： 如S EQ ID NO.7所示的正向引物； 和， 如SEQ  ID NO.8所示的 反向引物。 [0008]在另一优选例中， 所述引物对集还 包括检测新型 冠状病毒的其它引物对。 [0009]在另一优选例中， 所述引物对集还包括检测新型冠状病毒ORF1ab基因、 和/或N基 因的引物对。 [0010]在另一优选例中， 所述引 物对集还包括第二引 物对， 所述第二引 物对特异性扩增 新型冠状病毒ORF1ab基因， 所述第二引物对 包括： 如SEQ ID NO.1所示的正向引物； 和， 如SEQ  ID NO.2所示的反向引物。 [0011]在另一优选例中， 所述引 物对集还包括第三引 物对， 所述第三引 物对特异性扩增 新型冠状病毒N基因， 所述第三引物对 包括： 如SEQ ID NO.4所示的正向引物； 和， 如SEQ  ID NO.5所示的反向引物。 [0012]在另一优选例中， 所述引 物对集还包括第四引 物对， 所述第四引 物对特异性扩增说　明　书 1/14 页 3 CN 114107574 A 3