(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210116764.1 (22)申请日 2022.02.07 (71)申请人 徐州锦莱卓生物科技有限公司 地址 221000 江苏省徐州市铜山区汉王镇 汉何路西侧(听泉小镇 南) (72)发明人 邱树清　丁怡雯　周发松　 (74)专利代理 机构 重庆百润洪知识产权代理有 限公司 5 0219 专利代理师 刘泽正 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 水稻籽粒大小控制基因SMG11的单倍型鉴定 标记方法 (57)摘要 本发明涉及水稻基因控制技术领域， 尤其是 指水稻籽粒大小控制基因SMG11的单倍型鉴定标 记方法， 所述单倍型分子标记由7个SNP位点组 成。 本发明利用分子标记鉴定水稻品种的功能基 因， 来判断水稻品种的表型， 更高效、 更直接 。 权利要求书5页 说明书15页 附图2页 CN 114703311 A 2022.07.05 CN 114703311 A 1.水稻籽粒大小控制基因SMG11的单倍型鉴定标记方法， 其特征在于： 所述单倍型分子 标记由7个SNP位 点组成， SNP位 点信息如下： SNP1所在基因 组位置为1号染色体5204790bp， 该处碱基为G； SNP2所在基因 组位置为1号染色体52 21997bp， 该处碱基为T； SNP3所在基因 组位置为1号染色体52 27603bp， 该处碱基为G； SNP4所在基因 组位置为1号染色体523 0051bp， 该处碱基为T； SNP5所在基因 组位置为1号染色体5237810bp， 该处碱基为G； SNP6所在基因 组位置为1号染色体525 3059bp， 该处碱基为C； SNP7所在基因 组位置为1号染色体525413 5bp， 该处碱基为G。 以上SNP位 点的物理位置是基于日本晴的全基因 组序列MSU7.0版本确定 。 2.根据权利要求1所述的水稻籽粒大小控制基因SMG11的单倍型鉴定标记方法， 其特征 在于： 所述单倍型分子标记由158个SNP位 点组成， SNP位 点信息如下： SNP1所在基因 组位置为1号染色体51945 68bp， 该处碱基为G； SNP2所在基因 组位置为1号染色体5195 002bp， 该处碱基为C； SNP3所在基因 组位置为1号染色体519585 5bp， 该处碱基为C； SNP4所在基因 组位置为1号染色体5196478bp， 该处碱基为T； SNP5所在基因 组位置为1号染色体5197085bp， 该处碱基为A； SNP6所在基因 组位置为1号染色体51976 52bp， 该处碱基为A； SNP7所在基因 组位置为1号染色体51982 28bp， 该处碱基为A； SNP8所在基因 组位置为1号染色体5198 864bp， 该处碱基为C； SNP9所在基因 组位置为1号染色体519 9390bp， 该处碱基为A； SNP10所在基因 组位置为1号染色体520 0152bp， 该处碱基为G； SNP11所在基因 组位置为1号染色体520 0683bp， 该处碱基为G； SNP12所在基因 组位置为1号染色体5201 136bp， 该处碱基为T； SNP13所在基因 组位置为1号染色体520186 6bp， 该处碱基为G； SNP14所在基因 组位置为1号染色体5202 252bp， 该处碱基为C； SNP15所在基因 组位置为1号染色体520 3042bp， 该处碱基为G； SNP16所在基因 组位置为1号染色体520 3555bp， 该处碱基为G； SNP17所在基因 组位置为1号染色体5204214bp， 该处碱基为T； SNP18所在基因 组位置为1号染色体5204790bp， 该处碱基为G； SNP19所在基因 组位置为1号染色体520 5443bp， 该处碱基为C； SNP20所在基因 组位置为1号染色体520 5773bp， 该处碱基为A； SNP21所在基因 组位置为1号染色体520 6663bp， 该处碱基为T； SNP22所在基因 组位置为1号染色体520 6863bp， 该处碱基为G； SNP23所在基因 组位置为1号染色体5207817bp， 该处碱基为G； SNP24所在基因 组位置为1号染色体5208375bp， 该处碱基为A； SNP25所在基因 组位置为1号染色体520895 0bp， 该处碱基为C； SNP26所在基因 组位置为1号染色体52095 51bp， 该处碱基为C； SNP27所在基因 组位置为1号染色体5209 984bp， 该处碱基为C；权　利　要　求　书 1/5 页 2 CN 114703311 A 2SNP28所在基因 组位置为1号染色体5210176bp， 该处碱基为T； SNP29所在基因 组位置为1号染色体521 1081bp， 该处碱基为C； SNP30所在基因 组位置为1号染色体521 1969bp， 该处碱基为C； SNP31所在基因 组位置为1号染色体52125 30bp， 该处碱基为G； SNP32所在基因 组位置为1号染色体5213172bp， 该处碱基为T； SNP33所在基因 组位置为1号染色体5213721bp， 该处碱基为G； SNP34所在基因 组位置为1号染色体5214015bp， 该处碱基为A； SNP35所在基因 组位置为1号染色体52147 72bp， 该处碱基为G； SNP36所在基因 组位置为1号染色体52154 47bp， 该处碱基为G； SNP37所在基因 组位置为1号染色体5215828bp， 该处碱基为G； SNP38所在基因 组位置为1号染色体5216875bp， 该处碱基为T； SNP39所在基因 组位置为1号染色体5217268bp， 该处碱基为A； SNP40所在基因 组位置为1号染色体52180 61bp， 该处碱基为C； SNP41所在基因 组位置为1号染色体5218241bp， 该处碱基为C； SNP42所在基因 组位置为1号染色体52 20338bp， 该处碱基为G； SNP43所在基因 组位置为1号染色体52 21476bp， 该处碱基为C； SNP44所在基因 组位置为1号染色体52 21985bp， 该处碱基为G； SNP45所在基因 组位置为1号染色体52 21997bp， 该处碱基为T； SNP46所在基因 组位置为1号染色体52 23249bp， 该处碱基为G； SNP47所在基因 组位置为1号染色体52 23537bp， 该处碱基为A； SNP48所在基因 组位置为1号染色体52 24157bp， 该处碱基为C； SNP49所在基因 组位置为1号染色体52 25236bp， 该处碱基为T； SNP50所在基因 组位置为1号染色体52 25673bp， 该处碱基为G； SNP51所在基因 组位置为1号染色体52 26391bp， 该处碱基为T； SNP52所在基因 组位置为1号染色体52 26813bp， 该处碱基为T； SNP53所在基因 组位置为1号染色体52 27603bp， 该处碱基为G； SNP54所在基因 组位置为1号染色体52 28225bp， 该处碱基为G； SNP55所在基因 组位置为1号染色体52 28868bp， 该处碱基为C； SNP56所在基因 组位置为1号染色体52 29452bp， 该处碱基为T； SNP57所在基因 组位置为1号染色体523 0051bp， 该处碱基为T； SNP58所在基因 组位置为1号染色体523 0683bp， 该处碱基为T； SNP59所在基因 组位置为1号染色体52312 23bp， 该处碱基为C； SNP60所在基因 组位置为1号染色体5231837bp， 该处碱基为G； SNP61所在基因 组位置为1号染色体523245 0bp， 该处碱基为A； SNP62所在基因 组位置为1号染色体523 3054bp， 该处碱基为G； SNP63所在基因 组位置为1号染色体523 3680bp， 该处碱基为G； SNP64所在基因 组位置为1号染色体523 3995bp， 该处碱基为A； SNP65所在基因 组位置为1号染色体5234872bp， 该处碱基为C； SNP66所在基因 组位置为1号染色体523 5423bp， 该处碱基为G；权　利　要　求　书 2/5 页 3 CN 114703311 A 3