(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210116762.2 (22)申请日 2022.02.07 (71)申请人 徐州锦莱卓生物科技有限公司 地址 221000 江苏省徐州市铜山区汉王镇 汉何路西侧(听泉小镇 南) (72)发明人 周发松　陈耿华　丁怡雯　 (74)专利代理 机构 重庆百润洪知识产权代理有 限公司 5 0219 专利代理师 刘泽正 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 水稻粒长控制基因GS3的单倍型鉴定标记及 其筛选方法 (57)摘要 本发明涉及水稻基因控制技术领域， 尤其是 指水稻粒长控制基因GS3的单倍型鉴定标记及其 筛选方法， 所述单倍型分子标记由9 个SNP位点组 成。 本发明利用分子标记鉴定水稻品种的功能基 因， 来判断水稻品种的表型， 更高效、 更直接 。 权利要求书4页 说明书12页 附图2页 CN 114525356 A 2022.05.24 CN 114525356 A 1.水稻粒长控制基因GS3的单倍型鉴定标记， 其特征在于： 所述单倍型分子标记由9个 SNP位点组成， SNP位 点信息如下： SNP1所在基因 组位置为3号染色体1673 5870bp， 该处碱基为T； SNP2所在基因 组位置为3号染色体16738719bp， 该处碱基为C； SNP3所在基因 组位置为3号染色体16748214bp， 该处碱基为C； SNP4所在基因 组位置为3号染色体16749678bp， 该处碱基为C； SNP5所在基因 组位置为3号染色体16751964bp， 该处碱基为T； SNP6所在基因 组位置为3号染色体16758967bp， 该处碱基为A； SNP7所在基因 组位置为3号染色体1676 6909bp， 该处碱基为G； SNP8所在基因 组位置为3号染色体16780934bp， 该处碱基为G； SNP9所在基因 组位置为3号染色体16783495bp， 该处碱基为G； 以上SNP位 点的物理位置是基于日本晴的全基因 组序列MSU7.0版本确定 。 2.根据权利要求1所述的水稻粒长控制基因GS3的单倍型鉴定标记， 其特征在于： 所述 单倍型分子标记由10 5个SNP位 点组成， SNP位 点信息如下： SNP1所在基因 组位置为3号染色体16 683951bp， 该处碱基为A； SNP2所在基因 组位置为3号染色体16 684942bp， 该处碱基为T； SNP3所在基因 组位置为3号染色体16 685993bp， 该处碱基为A； SNP4所在基因 组位置为3号染色体16 686946bp， 该处碱基为G； SNP5所在基因 组位置为3号染色体16 687931bp， 该处碱基为T； SNP6所在基因 组位置为3号染色体16 688825bp， 该处碱基为G； SNP7所在基因 组位置为3号染色体16 689896bp， 该处碱基为G； SNP8所在基因 组位置为3号染色体16 690397bp， 该处碱基为C； SNP9所在基因 组位置为3号染色体16 690429bp， 该处碱基为G； SNP10所在基因 组位置为3号染色体16 690861bp， 该处碱基为C； SNP11所在基因 组位置为3号染色体16 691940bp， 该处碱基为A； SNP12所在基因 组位置为3号染色体16 692834bp， 该处碱基为A； SNP13所在基因 组位置为3号染色体16 693508bp， 该处碱基为T； SNP14所在基因 组位置为3号染色体16 693675bp， 该处碱基为T； SNP15所在基因 组位置为3号染色体16 694900bp， 该处碱基为G； SNP16所在基因 组位置为3号染色体16 695507bp， 该处碱基为T； SNP17所在基因 组位置为3号染色体16 696937bp， 该处碱基为T； SNP18所在基因 组位置为3号染色体16 697757bp， 该处碱基为C； SNP19所在基因 组位置为3号染色体16 698667bp， 该处碱基为T； SNP20所在基因 组位置为3号染色体16 699850bp， 该处碱基为A； SNP21所在基因 组位置为3号染色体1670 0837bp， 该处碱基为G； SNP22所在基因 组位置为3号染色体1670175 3bp， 该处碱基为G； SNP23所在基因 组位置为3号染色体16702543bp， 该处碱基为T； SNP24所在基因 组位置为3号染色体1670 3703bp， 该处碱基为G； SNP25所在基因 组位置为3号染色体1670478 8bp， 该处碱基为T；权　利　要　求　书 1/4 页 2 CN 114525356 A 2SNP26所在基因 组位置为3号染色体1670 5962bp， 该处碱基为G； SNP27所在基因 组位置为3号染色体1670 6836bp， 该处碱基为C； SNP28所在基因 组位置为3号染色体16707940bp， 该处碱基为G； SNP29所在基因 组位置为3号染色体16708948bp， 该处碱基为T； SNP30所在基因 组位置为3号染色体16709 927bp， 该处碱基为G； SNP31所在基因 组位置为3号染色体1671 1077bp， 该处碱基为T； SNP32所在基因 组位置为3号染色体1671 1885bp， 该处碱基为T； SNP33所在基因 组位置为3号染色体16712 960bp， 该处碱基为T； SNP34所在基因 组位置为3号染色体16713 630bp， 该处碱基为T； SNP35所在基因 组位置为3号染色体1671496 3bp， 该处碱基为G； SNP36所在基因 组位置为3号染色体1671512 9bp， 该处碱基为A； SNP37所在基因 组位置为3号染色体167158 85bp， 该处碱基为C； SNP38所在基因 组位置为3号染色体1671645 0bp， 该处碱基为C； SNP39所在基因 组位置为3号染色体167179 28bp， 该处碱基为G； SNP40所在基因 组位置为3号染色体16718 865bp， 该处碱基为C； SNP41所在基因 组位置为3号染色体16719759bp， 该处碱基为G； SNP42所在基因 组位置为3号染色体16720947bp， 该处碱基为G； SNP43所在基因 组位置为3号染色体16721914bp， 该处碱基为G； SNP44所在基因 组位置为3号染色体1672 2936bp， 该处碱基为C； SNP45所在基因 组位置为3号染色体1672393 6bp， 该处碱基为C； SNP46所在基因 组位置为3号染色体16724816bp， 该处碱基为C； SNP47所在基因 组位置为3号染色体16725937bp， 该处碱基为T； SNP48所在基因 组位置为3号染色体16726916bp， 该处碱基为T； SNP49所在基因 组位置为3号染色体1672790 5bp， 该处碱基为T； SNP50所在基因 组位置为3号染色体1672890 0bp， 该处碱基为G； SNP51所在基因 组位置为3号染色体1672 9365bp， 该处碱基为A； SNP52所在基因 组位置为3号染色体1673 0746bp， 该处碱基为A； SNP53所在基因 组位置为3号染色体16731270bp， 该处碱基为T； SNP54所在基因 组位置为3号染色体16732 914bp， 该处碱基为C； SNP55所在基因 组位置为3号染色体1673 3833bp， 该处碱基为G； SNP56所在基因 组位置为3号染色体1673479 2bp， 该处碱基为A； SNP57所在基因 组位置为3号染色体1673 5870bp， 该处碱基为T； SNP58所在基因 组位置为3号染色体1673 6949bp， 该处碱基为C； SNP59所在基因 组位置为3号染色体167379 23bp， 该处碱基为A； SNP60所在基因 组位置为3号染色体16738719bp， 该处碱基为C； SNP61所在基因 组位置为3号染色体16739 940bp， 该处碱基为A； SNP62所在基因 组位置为3号染色体1674091 1bp， 该处碱基为G； SNP63所在基因 组位置为3号染色体16741947bp， 该处碱基为G； SNP64所在基因 组位置为3号染色体16742 946bp， 该处碱基为A；权　利　要　求　书 2/4 页 3 CN 114525356 A 3