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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 20221012575 6.3 (22)申请日 2022.02.10 (71)申请人 浙江省肿瘤医院 地址 310022 浙江省杭州市拱 墅区半山 东 路1号 (72)发明人 徐超 姚庆华  (74)专利代理 机构 北京权智天下知识产权代理 事务所(普通 合伙) 11638 专利代理师 高丽红 (51)Int.Cl. C12Q 1/689(2018.01) C12Q 1/6869(2018.01) C12N 15/11(2006.01) C12R 1/01(2006.01) (54)发明名称 一种结肠癌肿瘤患者菌群检测诊断营养不 良状况的试剂盒 (57)摘要 本发明公开了一种结肠癌肿瘤患者菌群检 测诊断营养不良状况的试剂盒, 包括: 菌株的DNA 引 物 序 列 ,所 述 菌 株 分 别 是 : Atopobium.Vaginae、 Selenomonas  sputigena、 Faecalibacterium  prausnitzii; 还包括 粪便样 本保存试剂、 PCR反应试剂、 PCR产物纯化试剂、 测 序反应试剂; 通过对结肠癌患者粪便采用, DNA提 取、 PCR扩增后, 再由Atopobium.Vaginae、 Selenomonas  sputigena、 Faecalibacterium   prausnitzii  DNA测序引物进行测序后得出样本 中关于三种菌株的DNA序列丰度, 根据三种菌株 丰度与营养评估情况的相关性诊断出结肠癌患 者营养状况; 本发明提供的试剂盒诊断方法可无 创、 准确对结肠癌营养 状况进行诊断评估。 权利要求书2页 说明书4页 附图1页 CN 114592077 A 2022.06.07 CN 114592077 A 1.一种结肠癌肿瘤患者菌群检测诊断营养不良状况的试剂盒, 其特征在于, 包括菌株 的DNA引物序列, 所述菌株分别是: Atopobium.Vaginae、 Selenomonas  sputigena、 Faecalibacterium  prausnitzii; 三种菌株的DNA特异性引物序列如下: 1)Atopobium.Va ginae DNA正向引物: 5'‑GGTGAAGCAGTGGAAACACT‑3' Atopobium.Va ginae DNA反向引物: 5'‑ATTCGCTTCTGCTCGCGCA ‑3' 2)Selenomonas sputigena  DNA正向引物: 5'‑AGAGTTTGATCCTGGCTCAG‑3' Selenomonas sputigena  DNA反向引物: 5'‑CTCAATATTCTCAAGCTCGGTT‑3' 3)Faecal ibacteriumprausn itzii DNA正向引物: 5'‑CCCGGCATCGGGTAGAG‑3' Faecalibacteriumprausn itzii DNA反向引物: 5'‑GGACGCGAG GCCATCTC‑3'; 所述试剂盒还包括: 粪便样本保存试剂、 PCR反应试剂、 PCR产物纯化试剂、 测序反应试 剂。 2.根据权利要求1所述一种结肠癌肿瘤患者菌群检测诊断营养不良状况的试剂盒, 其 特征在于, 所述粪便样本保存试剂为DNAhelper保护液, 且粪便样本与DNAhelper保护液的 比例为1:2。 3.根据权利要求1所述一种结肠癌肿瘤患者菌群检测诊断营养不良状况的试剂盒, 其 特征在于, 所述PCR反应试剂 包括: 10xPCR反应缓冲液、 25mM  dNTP混合液、 5U/u l Taq DNA聚 合酶、 20uM引物对、 d dH2O。 4.根据权利要求1所述一种结肠癌肿瘤患者菌群检测诊断营养不良状况的试剂盒, 其 特征在于, 所述PCR产物纯化试剂包括: 1U/ul  SAP酶、 10U/ul  ExoI酶、 ddH2O。 5.根据权利要求1所述一种结肠癌肿瘤患者菌群检测诊断营养不良状况的试剂盒, 其 特征在于, 所述测序反应体系包括: 25%BigDye  mix1ul、 3.2uM  DNA测序引物、 125mM  EDTA 溶液、 100%乙醇溶 液、 70%乙醇溶 液、 HIDI溶 液、 ddH2O。 6.根据权利要求5所述一种结肠癌肿瘤患者菌群检测诊断营养不良状况的试剂盒, 其 特征在于, 所述DNA测序引物序列如下: Atopobium.Va ginae DNA测序引物: 5'‑GGTGAAGCAGTGGAAACACT‑3'; Selenomonas sputigena  DNA测序引物: 5'‑AGAGTTTGATCCTGGCTCAG‑3'; Faecalibacteriumprausn itzii DNA测序引物: 5'‑CCCGGCATCGGGTAGAG‑3'。 7.根据权利要求1所述一种结肠癌肿瘤患者菌群检测诊断营养不良状况的试剂盒, 其 特征在于, 所述Atopobium.Vaginae在经过测序后其所获得的结果与内参基因相比, 超过 2.98倍即表示患者可能存在中重度营养不良需要干预; Selenomonas  sputigena的结果与权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 114592077 A 2内 参 基 因 相 比 ,超 过 2 . 6 6 倍 即 表 示 可 能 存 在 中 重 度 营 养 不 良 ;而 Faecalibacteriumprausnitzii的结果与内参基因相比, 超过1.96倍即表示可能存在中重 度营养不良。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 114592077 A 3

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