(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210123336.1 (22)申请日 2022.02.10 (71)申请人 黑龙江省农业科 学院耕作栽培 研究 所 地址 150086 黑龙江省哈尔滨市南岗区学 府路370号耕作栽培 研究所 (72)发明人 杨贤莉　张喜娟　姜树坤　王立志　 赵茜　李明贤　李忠杰　迟力勇　 李锐　吕国依　吴立仁　夏天舒　 商全玉　孙兵　孟英　唐傲　 刘猷红　董文军　谢婷婷　刘凯　 姜辉　任洋　陈磊　王阳　王峭然　 宋丽娟　 (74)专利代理 机构 成都方圆聿联专利代理事务 所(普通合伙) 51241 代理人 邓永红(51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/11(2006.01) A01H 1/04(2006.01) (54)发明名称 水稻低温萌发基因CTG6的分子标记及其应 用 (57)摘要 本发明公开了水稻低温萌发基因CTG6的分 子标记及其应用， 该分子标记的正向引物序列 为： TTGAAATTTGAGATGAAAAGTTGA(SEQ  ID No.1所 示)， 反向引物序列为： CATTGGATGGCTAGCTCCTT (SEQ ID No.2所示)。 利用本发明的分子标记在 水稻生长早期或在苗床上对低温萌发的基因 CTG6进行选择， 选择效率大大提高， 同时能够缩 短选择周期。 权利要求书1页 说明书3页 序列表1页 附图1页 CN 114214454 A 2022.03.22 CN 114214454 A 1.水稻低温萌发基因CTG6 的分子标记， 该分子标记的正向引 物序列如SEQ  ID No.1所 示， 反向引物序列如SEQ  ID No.2所示。 2.权利要求1所述的分子标记在水稻低温萌发基因CTG6的辅助育种中的应用。 3.根据权利要求2所述的应用， 其特征在于， 以带有低温萌发基因CTG6的丽江新团黑谷 或其衍生后代 为亲本与待改良材料进行杂交， 采用SEQ  ID No.1和SEQ  ID No.2所示的分子 标记对杂交后代进行PCR扩增， 扩增出2 41bp核苷酸片段的单株就是成功导入CTG6基因的材 料， 扩增出209bp核苷酸片段的单株为 不带有CTG6基因的材 料。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114214454 A 2水稻低温萌发基因CTG6的分子标记及其应用 技术领域 [0001]本发明属于分子生物学领域， 具体涉及一种水稻低温萌发基因CTG6的分子标记及 其应用。 背景技术 [0002]水稻(Oryza  sativa L.)是喜温作物， 起源于热带、 亚热带， 相较小麦、 大麦等其他 谷类作物， 水稻对低温更加敏感。 华南双季稻区早稻直播和东北高寒稻区的单季稻直播往 往会遇到春季低 温天气， 造成种子萌发不齐， 缺苗断垄， 导致严重减产。 这就要求用于直播 的水稻种子有较强的低 温萌发力。 而上述稻作区一直以育秧移栽为主， 导致品种的低 温萌 发能力长期不作为育种目标， 造成品种低温萌发基因大量丢失。 致使许多高产、 优质的水稻 品种由于低温发芽力弱而不能用作直播稻， 限制了直播稻的生产。 解决水稻萌发期低 温冷 害的根本方法就是培 育耐低温的水稻品种。 [0003]在水稻生长发育过程中开展耐低温基 因的挖掘及 其机制研究， 为确保水稻正常生 长发育提供了理论基础。 QTL分析已经明确多个在营养生长和生殖生长过程中耐低温的 QTLs， 它们分布在12条染色体上(http://qtaro.abr.affrc.go.jp)。 但是目前只有少数基 因被克隆。 目前， 精细定位的水稻低温萌发QTL非常少， 主要是qLTG3 ‑1和OsSAP16， 精细定位 的区间分别为 4.8kb和72.3kb。 [0004]现有的改良水稻萌发期耐低温 能力的基因很少， 已有的改良水稻萌发期耐低温性 状专利CN111304216A水稻低温萌发相关基因OsDJC58及其应用， 利用热激蛋白基因OsDJC58 在多个逆境中能发挥作用， 在萌发期低温处理 时， 该基因参与了种子低温萌发过程的启动， 可以提高水稻萌发期的耐冷性。 然而热激蛋白对植物逆境的调控不单单是正调控， 可能同 时存在负调控或者是其 他复杂的调控关系。 存在一定的不确定性。 发明内容 [0005]本发明所要解决的技术问题为： 一方面， 提供一个新的水稻低温萌发基因及其分 子标记， 另一方面， 提供了该分子标记在该基因的辅助育种中的应用。 [0006]本发明的技术方案为： 水稻低温萌发基因CTG6的分子标记， 该分子标记的正向引 物序列为： TTGAAATTTGAGATGAAAAGTTGA(SEQ  ID No.1所示)， 反向引物序列为： CATTGGATGGCTAGCTC CTT(SEQ ID No.2所示)。 [0007]本发明的分子标记在水稻低温萌发基因CTG6的辅助育种中的应用。 [0008]具体地， 以带有低温萌发基因CTG6的丽江新团黑谷或其衍生后 代为亲本与 待改良 材料进行杂交， 采用SEQ  ID No.1和SEQ  ID No.2所示的分子标记对杂交后代进行PCR扩增， 扩增出241b p核苷酸片段的单株就是成功导入CTG6基因的材料， 扩增出209bp 核苷酸片段的 单株为不带有CTG6基因的材 料。 [0009]与现有技 术相比， 本发明具有以下有益效果： [0010]利用本发明的分子标记在水稻生长早期或在苗床上对低温萌发的基因CTG6进行说　明　书 1/3 页 3 CN 114214454 A 3