(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210127317.6 (22)申请日 2022.02.11 (71)申请人 四川农业大 学 地址 611134 四川省成 都市温江区惠民路 211号 (72)发明人 谭礼强　崔懂　毛润锦　王留彬　 (74)专利代理 机构 北京正华智诚专利代理事务 所(普通合伙) 11870 代理人 杨浩林 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种鉴定早 生茶树的SNP位 点及其应用 (57)摘要 本发明提出了一种鉴定早生茶树的SNP位点 及其应用， 涉及分子标记技术领域。 具体而言， 第 一、 第二和第三个SNP位点位于舒茶早参考基因 组的第四染色体的第179776419位、 第五染色体 的第97586343位， 第九染色体的第163016524位， 三个SNP位点的上下游500bp的DNA序列分别如 SEQ ID No.1‑3所示。 通过对 三个SNP位点中的一 个、 两个或三个进行基因型分析， 并根据基因型 结果对待选育样本进行筛选， 可以不受环境和生 长时期的影响、 有效快速的鉴定出早生茶树资 源。 权利要求书1页 说明书7页 CN 114350847 A 2022.04.15 CN 114350847 A 1.一种鉴定早生茶树的SNP位点， 其特征在于， 包括第一SNP位点， 所述第一SNP位点位 于舒茶早 参考基因组的第四染色体的第1797 76419位， 该位 点的核苷酸碱基为A或G。 2.根据权利要求1所述的鉴定早生茶树的SNP位点， 其特征在于， 还包括第二SNP位点， 所述第二SNP位点位于舒茶早参考基因组的第五染色体的第97586343位， 该位点的核苷酸 碱基为C或T。 3.根据权利要求2所述的鉴定早生茶树的SNP位点， 其特征在于， 还包括第三SNP位点， 所述第三SNP位点位于舒茶早参考基因组的第九染色体的第163016524位， 该位点的核苷 酸 碱基为C或T。 4.根据权利 要求1所述的鉴定早生茶树的SNP位点， 其特征在于， 基于第一SNP位点的GG 型样本的萌发期早于A A型样本和AG型样本 。 5.根据权利 要求2所述的鉴定早生茶树的SNP位点， 其特征在于， 基于第二SNP位点的CT 型样本的萌发期早于 CC型样本和T T型样本。 6.根据权利 要求2所述的鉴定早生茶树的SNP位点， 其特征在于， 基于第三SNP位点的CT 型样本的萌发期早于 CC型样本和T T型样本。 7.一种如权利要求1 ‑6任意一项所述的鉴定早生茶树的SNP位点在鉴定早生或特早生 茶树中的应用。 8.根据权利要求7所述的应用， 其特征在于， 包括如下步骤， 提取待选育样本的基因组 DNA， 采用包括PCR扩增和直接测序的技术获得第一、 第二、 第三SNP位点的基因型信息并用 于早生型茶树品种筛 选。 9.根据权利 要求8所述的应用， 其特征在于， 筛选所述第一SNP位点基因型为GG、 所述第 二SNP位点基因型为CT和/或所述第三SNP位点基因型为CT的样 本为所述早生 或特早生茶树 的种质。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114350847 A 2一种鉴定早生茶树的SNP位点 及其应用 技术领域 [0001]本发明涉及分子标记技术领域， 具体而言， 涉及一种鉴定早生茶树的SNP 位点及其 应用。 背景技术 [0002]春季萌芽期是茶树最重要的经济性状之一， 一般萌芽期更早的茶树具有更高的栽 培价值。 选育和推广早生、 优质茶树品种一直是我国茶树育种工作的重要内容之一。 一般以 茶树品种一芽一叶期的出现时间 比当地“福鼎大白茶 ”接近的品种称为早生茶树品种； 比 “福鼎大白茶 ”早10天以上称为特早 生茶树品种。 [0003]虽然基于田间直接观测判断子代的发芽期较简单， 但从茶树种子播种到得到较为 可靠的发芽期观测结果需要至少4 ‑6年时间， 期间幼龄 茶园的管 理成本较高， 且 结果也会显 著受到每年气候变化的影响。 然而现目前针对早生或特早生茶树的筛选仍存在技术难题， 而导致育种筛 选效果有限， 且增 加管理的金钱成本和时间成本等。 发明内容 [0004]本发明的第一目的在于提供一种鉴定早生茶树的S NP位点， 可通过该S NP位点解决 现目前对早 生或特早 生茶树的筛 选困难的技 术问题。 [0005]本发明的第二目的在于提供一种鉴定早 生茶树的SNP位 点的应用。 [0006]本发明解决其 技术问题是采用以下技 术方案来实现的。 [0007]一方面， 本申请提供了一种鉴定早生茶树的SNP位点， 包括第一SNP位点， 第一SNP 位点位于舒茶早参考基因组(下载地址： hTTp://tpdb.shengxin.ren/， 基因组文件名称： CSS_ChrLev_20200506_Genome.fas.gz)的第四染色体的第179776419位， 该位点的核苷酸 碱基为A或G。 提取待选育样 本的基因组DNA， 采用包括P CR扩增和直接测序的方法获得第一、 第二、 第三SNP位点的基因型信息， 并用于早生型茶树品种筛选。 筛选第一SNP位点基因型为 GG、 第二SNP位 点基因型为CT和/或第三SNP位 点基因型为CT的样本 。 [0008]可通过对样本DNA基因组进行扩增后， 以筛选出其S NP基因型信息， 根据其SNP基因 型信息进 行比对， 当该第一SNP位点的基因型符合早生茶树 或特早生茶树的标准后， 对其进 行筛选， 筛选出样本中含有符合早生茶树或特早生茶树标准的位点样本， 从而得到早生茶 树或特早 生茶树种质。 [0009]另一方面， 本申请还提供了一种鉴定早生茶树的SNP位点在鉴定早生或特早生茶 树种质中的应用。 [0010]相对于现有技 术， 本发明至少具有如下优点或有益效果： [0011]本发明提供了一种鉴定早生茶树的S NP位点及其应用， 通过对茶树的该第一S NP位 点进行筛选， 能够在不受环境和树龄的影响下、 更快捷和便利的筛选出早生 或特早生茶树， 从而降低茶树品种选育过程中的管理成本以及管 理难度， 并提高早生或特早生茶树的筛选 效率。说　明　书 1/7 页 3 CN 114350847 A 3