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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210138809.5 (22)申请日 2022.02.15 (71)申请人 中国农业科 学院作物科 学研究所 地址 100081 北京市海淀区中关村南大街 12号 (72)发明人 翁建峰 程子祥 吕香玲 李新海  宋新元 路明 宋茂兴 周志强  李明顺 郝转芳 张德贵 雍红军  韩洁楠  (74)专利代理 机构 北京智永 源知识产权代理事 务所(普通 合伙) 11967 专利代理师 李腾 姚亮梅 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种与玉米抗灰斑病主效QTL紧密连锁的分 子标记与应用 (57)摘要 本发明公开了一种 与玉米抗灰斑病主效QTL 紧密连锁的分子标记, 所述玉米抗灰斑病主效 QTL是位于玉米第1号染色体Bin1.02位置, 命名 为QTLqGLS1.02, 与其紧密连锁的分子标记为 COP‑M1, 所述COP ‑M1的物理位置: Chromosome1: 23820258‑23820275。 本研究首次在玉米1号染色 体抗灰斑病主效QTL开发一个分子标记COP ‑M1。 本发明中玉米抗灰斑病的主效QTL点位置明确, 贡献率较高, 能显著改善玉米自交系材料的抗病 性状, 检测方法方便快速, 能够有效用于灰斑病 抗性材料的鉴定与商业 化感病品种的改良。 权利要求书1页 说明书4页 序列表1页 附图2页 CN 114480710 A 2022.05.13 CN 114480710 A 1.一种与玉米抗灰斑病 主效QTL紧密连锁的分子标记, 其特征在于, 所述玉米抗灰斑病 主效QTL是位于玉米第1号染色体Bin1.02位置, 命名为QTL  qGLS1.02, 与其紧密连锁的分子 标记为COP ‑M1, 所述COP ‑M1的物理位置: C hromosome1:23820258 ‑23820275 。 2.根据权利要求1所述的分子标记, 其特征在于, 所述分子标记的引物序列为SEQ  ID  NO.1和SEQ  ID NO.2所示。 3.根据权利要求2所述的分子标记, 其特征在于, 利用SEQ  ID NO.1和SEQ  ID NO.2所示 的引物在玉米抗病自交系齐319中可扩增出大小为191bp的条带, 核苷酸序列如SEQ  ID  NO.3所示; 在感病自交系掖478中可扩增出大小为185bp的条带, 核苷酸序列如SEQ  ID NO.4 所示。 4.根据权利要求2所述的分子标记, 其特征在于, 利用SEQ  ID NO.1和SEQ  ID NO.2所示 的引物在玉米感病自交系郑58和昌7 ‑2中可扩增出大小为185bp的条带, 核苷酸序列如SEQ   ID NO.4所示。 5.权利要求1~4任意一项所述分子标记在鉴定玉米抗灰斑病的主效QTL与改良感病 玉 米自交系中的应用。 6.权利要求1~4任意一项所述分子标记在筛选或鉴定玉米抗灰斑病种质资源中的应 用。 7.权利要求1~4任意 一项所述分子标记在玉米抗灰斑病分子标记辅助育种中的应用。 8.用于鉴定或辅助鉴定玉米抗灰斑病性状的试剂盒, 其特征在于, 所述试剂盒包含扩 增分子标记COP ‑M1的引物, 所述分子标记的引物序列为SEQ  ID NO.1和SEQ  ID NO.2所示。 9.一种可用于 辅助鉴定玉米材 料及其杂交后代抗灰斑病的方法, 具体方法如下: 提取玉米亲本1(抗病亲本)与亲本2(感病亲本)及其杂交后代的基因组DNA,用所述分 子标记COP ‑M1的引物进 行扩增电泳, 与抗病亲本1做带型对照, 带型相同即为抗病, 与亲本2 相同则为感病。 10.一种为抗灰斑病育种选择抗病亲本自交系的方法, 具体方法如下: 提取玉米亲本基 因组DNA, 并利用所述分子标记C OP‑M1引物进 行扩增电泳, 与抗病亲本条带一致的材料即作 为抗病育种的亲本 。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114480710 A 2一种与玉米抗 灰斑病主 效QTL紧密连锁的分子标记与应用 技术领域 [0001]本发明涉及 基因工程及分子生物学领域, 具体地说, 涉及与 玉米抗灰斑病主效QTL 紧密连锁的分子标记与应用。 背景技术 [0002]玉米是重要的粮饲兼用作物, 中国即是玉米生产大国, 同时也是消费大国。 由尾孢 菌侵染玉米叶片引起的玉米灰斑病已成为我国东北、 华北及西南玉米产区重要的病害之 一。 其中引起东北地区灰斑病的病原菌为玉蜀黍尾孢菌, 引起西南地区灰斑病的病原菌为 玉米尾孢菌(刘文奎等, 2013)。 该病在整个生育期皆可发生, 但以抽雄和灌浆期发病 为重, 主要危害玉米叶片。 产量损失在10% ‑70%之间。 挖掘抗源材料是抗病品种选育工作的关 键。 大量研究表明, 玉米种质中抗性基因资源相对匮乏, 不同玉米种质对灰斑病的抗性存在 显著差异, 四平头、 旅大红骨、 PA和BSSS等类群种质多表现为感病或高感, 而拥有亚热带或 热带血缘的PB类玉米种质, 尤其是78599  后代选系, 具有相对较好的抗性, 如齐319、 CNl65、 沈137等, 在 多次试验鉴定中均表现出稳定的抗病性(徐秀德等, 2003; 董怀玉等, 2005; 吕香 玲等, 201 1; Lv等)。 [0003]因此, 从PB类玉米种质中挖掘和鉴定抗灰斑病基因(QTLs), 对玉米种质抗性改良 和培育抗灰斑病品种具有重要的理论和实 践意义。 发明内容 [0004]本发明的目的是提供与玉米抗灰斑病主效QTL紧密连锁的分子标记。 [0005]本发明的另一目的是提供所述分子标记在筛选或鉴定玉米抗灰斑病种质资源中 的应用。 [0006]本发明的再一目的是提供一种培 育对玉米灰斑病 种质资源提高的方法。 [0007]为了实现本发明目的, 本发明首先提供了一种与玉米抗灰斑病主效QTL  紧密连锁 的分子标记, 所述玉米抗灰斑病主效QTL是位于玉米第1号染色体  Bin1.02位置, 命名为QTL   qGLS1.02, 与其紧密连锁的分子标记为COP ‑M1, 所述COP ‑M1的物理位置: Chromosome1: 23820258 ‑23820275 。 [0008]在一优选实施例中, 所述分子标记的引物序列为SEQ  ID NO.1和SEQ  ID NO.2所 示。 [0009]其中, 利用SEQ  ID NO.1和SEQ  ID NO.2所示的引物在玉米抗病自交系齐319 中可 扩增出大小为191bp的条带, 核苷酸序列如SEQ  ID NO.3所示; 在感病自交系掖478中可扩增 出大小为185bp的条 带, 核苷酸序列如  SEQ ID NO.4所示。 [0010]其中, 利用SEQ  ID NO.1和SEQ  ID NO.2所示的引物在玉米 感病自交系郑58中和感 病自交系昌7 ‑2中可扩增出 大小为185bp的条 带, 核苷酸序列如SEQ  ID NO.4所示。 [0011]进一步地, 本发明还提供所述分子标记在鉴定玉米抗灰斑病的主效QTL  与改良感 病玉米自交系中的应用。说 明 书 1/4 页 3 CN 114480710 A 3

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