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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210139718.3 (22)申请日 2022.02.16 (71)申请人 华中农业大 学 地址 430070 湖北省武汉市洪山区狮子山 街1号 (72)发明人 马洪菊 何顺 毛植尧 冯唐奇  (74)专利代理 机构 北京知文通达知识产权代理 事务所(普通 合伙) 16051 专利代理师 刘江良 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 利用LAMP快速检测抗ALS类除草剂稗草ALS 基因突变的方法 (57)摘要 本发明公开了一种快速检测抗ALS类除草剂 稗草 (Echinochloa  Beauv.) 的ALS基因W574L突 变的引物和方法, 本发明有助于基层植保单位快 速了解稗草抗药性情况、 准确制定杂草防治策 略、 避免草害爆发。 检测方法如下: 1) 提取稗草基 因组DNA; 2) 建立反应体系, 在63℃下扩增60   min; 3) 在80℃下 终止反应后, 在反应产物中加入 荧光显色剂或利用2%琼脂糖凝胶电泳检测是否 发生扩增, 并以此确定是否存在抗性突变。 本发 明可以用极短的时间检测杂草抗性突变, 不需要 昂贵的仪 器, 节约了高额的测序费用。 权利要求书2页 说明书6页 附图2页 CN 114525357 A 2022.05.24 CN 114525357 A 1.一种基于环介导等温扩增快速检测抗ALS类除草剂稗草 ( Echinochloa  Beauv.) ALS 基因W574L突变的方法, 其特征在于, 针对拟检测的样品通过下述引物进行环介导等温扩 增, 并进行检测; 其中, 所述引物如下: F3: CAACCAACACCTGGGTATGG B3: TTCCTGGTGCGGGACAAT FIP: GCTCTCAT TCTCTGGGTTCCCCTGGTGCAGTTGGAGGACA BIP: GAAGAGCGAAGTACGTGCAGCAGATATC CAACAGGTACGGCC。 2.如权利要求1所述的方法, 其特 征在于, 反应 体系按25 μL计, 具体如下: 组分 (浓度) 添加量 ( μL) 终浓度 10 x ThermoPo lbuffer 2.5 1 x 甜菜碱 (4.5 M) 5.0 0.9 M dNTPs (10 mM) 3.5 1.4 mM MgSO4 (10 0 mM) 1.5 6 mM FIP (40 μM) 1.5 2.4 mM BIP (40 μM) 1.5 2.4 mM F3 (5 μM) 1 0.2 mM B3 (5 μM) 1 0.2 mM Bst DNA聚合酶 (8 U ·μL ‑1) 1 0.32 U·μL ‑1 DNA模板 1 无菌水 5.5 总体积 25 。 3.如权利要求1所述的方法, 其特征在于, 反应条件是在63℃条件下进行扩增反应60   min, 反应结束后, 在80℃条件下放置10  min用于终止反应。 4.如权利要求1所述的方法, 其特 征在于, 所述检测方法如下: 反应产物进行琼脂糖凝胶电泳检测, 如果未有条带, 说明结果为阴性, 即不存在突变; 若出现有条 带, 说明结果 为阳性即存在所述 突变。 5.如权利要求1所述的方法, 其特 征在于, 所述检测方法如下: 直接在扩增产物中加入1   µL的1000 x SYBR Green Ι, 在正常光照下 呈橙色, 在紫外光下荧光反应弱, 说明结果为阴性即不存在突变) ; 在正常光下呈绿色, 在紫外 光下出现强荧 光反应, 说明结果 为阳性即存在所述 突变。 6.一种基于环介导等温扩增快速检测抗ALS类除草剂稗草 ( Echinochloa  Beauv.) ALS 基因W574 L突变的引物, 其特 征在于, 所述引物如下: F3: CAACCAACACCTGGGTATGG B3: TTCCTGGTGCGGGACAAT FIP: GCTCTCAT TCTCTGGGTTCCCCTGGTGCAGTTGGAGGACA BIP: GAAGAGCGAAGTACGTGCAGCAGATATC CAACAGGTACGGCC。 7.如权利要求1至5任一项所述的方法在鉴定抗ALS类除草剂稗草 ( Echinochloa   Beauv.) 是否具有抗 性中的应用。权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 114525357 A 28.如权利要求6所述 的引物在鉴定抗ALS类除草剂稗草 ( Echinochloa  Beauv.) 是否具 有抗性中的应用。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 114525357 A 3

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