(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210147562.3 (22)申请日 2022.02.17 (71)申请人 武汉大学深圳研究院 地址 518063 广东省深圳市南 山区粤海街 道高新区南区粤兴二道6号 申请人 武汉大学　 袁隆平农业高科技股份有限公司 　 湖北洪山实验室 (72)发明人 陈荣智　何光存　杨远柱　秦鹏　 王凯　邓钊　杜波　祝莉莉　 (74)专利代理 机构 北京路浩知识产权代理有限 公司 11002 代理人 钱云 (51)Int.Cl. C12N 15/11(2006.01)C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) (54)发明名称 一种SNP分子标记及其在检测水稻抗褐飞虱 基因Bph4 4(t)中的应用 (57)摘要 本发明涉及植物分子育种领域， 尤其涉及一 种SNP分子标记及其在检测抗褐飞虱基因Bph44 (t)中的应用。 所述SNP位点为如下任 意一种或多 种： i)位于 水稻4号染色体第942119bp处的SNP位 点， 多态性为G/T； ii)位于水稻4号染色体第 1006206bp处， 多态性为 G/A。 本发明提供的SNP分 子标记及相应的KASP引物可以实现对抗褐飞虱 基因Bph44(t)准确、 快速的检测， 进而可以加快 抗褐飞虱基因Bph44(t)在抗飞虱育种中的应用， 显著缩短抗褐飞虱水稻品种的选育周期， 降低选 育成本， 具有较高的应用价 值。 权利要求书1页 说明书7页 序列表2页 附图3页 CN 114410623 A 2022.04.29 CN 114410623 A 1.一种SNP分子标记， 其特征在于， 所述SNP分子标记包括如下任意一种或多种SNP位 点： i)位于水稻4 号染色体第9421 19bp处的SNP位 点， 多态性 为G/T； ii)位于水稻4 号染色体第10 06206bp处的SNP位 点， 多态性 为G/A。 2.根据权利要求1所述的SNP分子标记， 其特征在于， 针对位于水稻4号染色体第 942119bp处的SNP位点， 多态性为T的水稻植株相较于多态性为G的水稻植株具备更高的褐 飞虱抗性； 和/或， 针对位于水稻4号染色体第1006206bp处的SNP位点多态性为A的水稻植株相较于多态 性为G的水稻植株具 备更高的褐飞虱抗 性。 3.用于扩增如权利要求1或2所述的SNP分子标记的引物 组合， 其特征在于， 包括如下任 意一种或多种引物对： i)如SEQ ID NO.1‑2所示的特异性引物和如SEQ  ID NO.3所示的通用引物； ii)如SEQ ID NO.4‑5所示的特异性引物和如SEQ  ID NO.6所示的通用引物。 4.根据权利要求3所述的引 物组合， 其特征在于， 引 物对i)中如SEQ  ID NO.1‑2所示的 特异性引物分别携带不同的荧光标记； 和/或， 引物对ii)中如SEQ  ID NO.4‑5所示的特异性 引物分别携带不同的荧 光标记。 5.一种试剂盒， 其特 征在于， 包括权利要求3或4所述的引物组合。 6.权利要求1或2所述的SNP分子标记， 或权利要求3或4所述的引物组合， 或权利要求5 所述试剂盒在检测抗褐飞虱基因B ph44(t)中的应用。 7.权利要求1或2所述的SNP分子标记， 或权利要求3或4所述的引物组合， 或权利要求5 所述试剂盒在抗褐飞虱水稻材 料选育或水稻分子标记辅助育种中的应用。 8.一种检测抗褐飞虱基因B ph44(t)的方法， 其特 征在于， 包括： 针对待测水稻， 检测其基因组中如权利 要求1或2所述SNP分子标记的多态性， 根据检测 结果判断所述待测水稻是否含有水稻抗褐飞虱基因B ph44(t)。 9.根据权利要求8所述的方法， 其特征在于， 当出现如下任意一种或多种情况时， 判断 所述待测水稻含有抗褐飞虱基因B ph44(t)： i)位于水稻4 号染色体第9421 19bp处的SNP位 点多态性 为T； ii)位于水稻4 号染色体第10 06206bp处的SNP位 点多态性 为A。 10.根据权利要求7或8所述的方法， 其特 征在于， 包括： 提取所述待测水稻的基因组DNA， 采用权利 要求3或4所述引物组合针对所述基因组DNA 进行PCR扩增以检测如权利要求1所述SNP位点的多态性； 根据检测结果判断所述待测水稻 是否含有水稻抗褐飞虱基因B ph44(t)。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114410623 A 2一种SNP分子标记及其在检测水稻抗褐飞虱基因 Bph44(t)中 的应用 技术领域 [0001]本发明涉及植物分子育种领域， 尤其涉及一种SNP分子标记及其在检测抗褐飞虱 基因Bph44(t)中的应用。 背景技术 [0002]水稻是目前最重要的粮食作物之一。 褐飞虱是水稻单食性害虫， 通过口针吸食水 稻韧皮部中的汁液， 对于水稻有着广泛的危害， 其轻度危害导致水稻植株生长活力降低、 分 蘖减少、 产量下降和空瘪粒增加； 而重度危害则可能致使水稻全株死亡， 甚至颗粒无收。 遏 制褐飞虱的发展和危害对于保障现有水稻生产安全的有重大意 义。 [0003]传统的褐飞虱的防治主要是依靠施用化学杀虫剂。 由于褐飞虱爆发多发生在水稻 成熟灌浆期， 此时稻株长势旺盛， 将杀虫剂施到稻株基部的操作非常 困难。 而且化学杀虫剂 的长时间施用， 也会导致褐飞虱抗药性成倍增加， 降低药剂的防治效果。 此外， 化学杀虫剂 的施用也消灭了稻田中的褐飞虱天敌， 极易诱发褐飞虱的 “再猖獗”， 给防治带来更大 的困 难。 而且农药的施用也会增 加生产成本， 带来环境和粮食污染等 生态问题。 [0004]传统的水稻抗虫育种是通过抗虫性状鉴定对植株进行表型选择。 由于水稻材料抗 虫性鉴定的复杂性， 利用常规育种手段进行抗虫基因的转育效率低下。 分子标记辅助选择 是一种利用与抗性基因紧密连锁或基因内部功能标记， 在后代中进 行基因型分析， 可快速、 准确分辨出育种材料是否带有抗褐飞虱基因， 大大提高抗褐飞虱育种的效率和准确 性， 节 约了成本， 缩短了 育种周期。 发明内容 [0005]为了解决现有技术存在的问题， 本发明提供一种SNP分子标记及其在检测抗褐飞 虱基因Bph44(t)中的应用。 [0006]第一方面， 本发明提供一种SNP分子标记， 所述SNP分子标记包括如下任意一种或 多种SNP位 点： [0007]i)位于水稻4 号染色体第9421 19bp处的SNP位 点， 多态性 为G/T； [0008]ii)位于水稻4 号染色体第10 06206bp处的SNP位 点， 多态性 为G/A。 [0009]进一步地， 针对位于水稻4号染色体第 942119bp处的SNP位点， 多态性为T的水稻植 株相较于多态性 为G的水稻植株具 备更高的褐飞虱抗 性； [0010]针对位于水稻4号染色体第1006206bp处的SNP位点多态性为A的水稻植株相 较于 多态性为G的水稻植株具 备更高的褐飞虱抗 性。 [0011]第二方面， 本发明提供一种用于扩增所述SNP分子标记的引物组合， 包括如下任意 一种或多种引物对： [0012]i)如SEQ ID NO.1‑2所示的特异性引物和如SEQ  ID NO.3所示的通用引物； [0013]ii)如SEQ ID NO.4‑5所示的特异性引物和如SEQ  ID NO.6所示的通用引物。说　明　书 1/7 页 3 CN 114410623 A 3