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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210158289.4 (22)申请日 2022.02.21 (71)申请人 广州白云山 光华制药股份有限公司 地址 510285 广东省广州市海珠区南石路 一号 (72)发明人 蒋研风羊 晁志 郑如文 谢雪那  刘宏 梁永姗 杜海泳  (74)专利代理 机构 广州广典知识产权代理事务 所(普通合伙) 44365 专利代理师 顾书玲 万志香 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 鉴定西康柴胡的SCAR分子标记、 特异性引物 对和方法 (57)摘要 本发明公开了一种鉴定西康柴胡的SCAR分 子标记、 特异性引物对和方法, 所述SCAR分子标 记具有如SEQ  ID No.1所示的核苷酸序列; 所述 引物对的正向引 物的序列如SEQ  ID No.2所示, 反向引物的序列如SEQ  ID No.3所示。 本发明的 SCAR分子标记、 以及特异性引物对, 可以特异性 地、 准确地鉴定西康柴胡, 为西康柴胡的开发利 用与保护提供研究基础, 亦可为其它中药材遗传 特性和鉴别提供 借鉴。 权利要求书1页 说明书9页 序列表1页 附图2页 CN 114457183 A 2022.05.10 CN 114457183 A 1.一种鉴定西康柴胡的SCAR分子标记, 其特征在于, 所述SCAR分子标记具有如SEQ  ID  No.1所示的核苷酸序列。 2.权利要求1所述的SCAR分子标记在鉴定西康柴胡中的应用。 3.一种SCA R分子标记特异性引物对, 其特征在于, 所述引物对的正向引物的序列如SEQ   ID No.2所示, 反向引物的序列如SEQ  ID No.3所示。 4.权利要求3所述的SCAR分子标记特异性引物对在鉴定西康柴胡中的应用。 5.一种鉴定西康柴胡的试剂盒, 其特征在于, 所述试剂 盒包括权利要求3所述的SCAR分 子标记特异性引物对。 6.权利要求5所述的试剂盒在鉴定西康柴胡中的应用。 7.一种鉴定西康柴胡的方法, 其特 征在于, 包括以下步骤: (1)、 以待鉴定柴胡样品 的DNA为模板, 权利 要求3所述的SCAR分子标记特异性引物对为 引物, 进行PCR扩增; (2)、 对PCR扩增产物进行电泳检测, 鉴定待鉴定柴胡样品是否为西康柴胡。 8.根据权利 要求7所述的鉴定西康柴胡的方法, 其特征在于, 步骤(1)中所述PCR扩增的 反应体系为: 模板1.5 μL~2.5 μL、 正向引物0.3 μL~ 0.5 μL、 反向引物 0.3 μL~0.5 μL; Taq  Mix  5 μL~7 μL; 去离 子水加至15 μL。 9.根据权利 要求7所述的鉴定西康柴胡的方法, 其特征在于, 步骤(1)中所述PCR扩增的 反应程序为: 94℃预变性, 保持4min; 94℃变性, 保持30s, 63.4℃退火, 保持30s, 72℃延伸, 保持1min, 共35个循环; 72℃保持8mi n。 10.根据权利 要求7所述的鉴定西康柴胡的方法, 其特征在于, 步骤(2)中, 若PCR扩增产 物出现300bp特异性条 带, 则待鉴定柴胡样品为西康柴胡。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114457183 A 2鉴定西康柴胡的SCAR分子标记、 特异性引物对和方 法 技术领域 [0001]本发明属于药材检测技术领域, 更具体地, 本发明涉及一种鉴定西康柴胡的SCAR 分子标记、 特异性引物对及鉴定方法。 背景技术 [0002]柴胡是一种多基原的中药, 根据文献记载, 多种柴胡属植物都可作药用, 柴胡属植 物种类繁多, 全世界已报道的柴胡属植物约有18 0种, 物种间相似的形态使 得柴胡鉴定十 分 困难, 特别是近缘物种的鉴定一 直困扰着植物分类学家。 [0003]近年来, DNA分子标记技术逐渐成熟, DNA分子标记相对于传统的遗传标记具有遗 传多态性高、 变异丰富; 稳定性高, 不受取材部位、 发育阶段和环境因素影响; 检测手段便 捷、 准确率高等多项优势。 目前常用的DNA分子标记主要有RFLP、 RAPD、 AFLP、 SCAR、 SSR、 ISSR、 SRAP等。 [0004]RFLP是最早开发的不依赖PC R的一项分子标记技术, 虽然具有多态性稳定、 重复性 好、 可靠性高的优势, 但是也存在着一些局限性, 例如操作程序繁琐、 周期长、 成本高; 而且 一般基层不具有放射性同位素的条件, 所以此法不易普及推广。 RAPD、 ISSR、 AFLP均为基于 PCR的传统DNA分子标记 技术, 不需要明确序列信息, 对DNA的要求低, 但 也存在一定缺陷, 由 于使用的引物随机且较短, 其稳定性与重复性差, 可靠性不高。 SSR标记多用于品种遗传多 态性鉴别, 但是SSR仍离不开对实验条件的依赖, 难以做到高通量检测, 并且单个标记位点 对应的等位基因数目多, 导致不同来源的SSR数据整合变得十 分困难。 SRAP为针对基因表达 序列的多态性而开发, 被称为靶向基因标记, 为显性标记, 多应用于比较基因组学、 遗传多 样性分析、 基因定位研究。 [0005]SCAR(Sequence  character ized amplified  regions, 序列特征扩增区域)标记技 术, 是在RAPD技术基础上发展起来的, 是共显性遗传, 其是用特异引物对基因组DNA进行扩 增, 获得可以反映标记 性状的特异DNA片段的技术, 通常在不同的个体之间表现为存在或缺 失, 在图谱中通常为单一条带的有或无, 简单、 结果可靠、 成本低, 具有可重复性好、 对反应 条件不敏感、 检测便捷的优点, 可用于作物杂交育种 、 品种鉴定和混伪品的鉴别当中。 [0006]西康柴胡(Bupleurum  sikangense)是在西藏地区发现的特有新种, 在西藏的当 佐、 芒康地区常见, 其与紫花鸭跖柴胡(B.commelynoideum)亲缘关系较近, 仅通过形态特征 难以将两者鉴别。 西康柴胡相比其他种类的柴胡的物种鉴定, 其研究很少, 参考文 献和鉴定 经验几乎没有。 为了保证柴胡资源准确的鉴定以及后续对西康柴胡的开发利用, 有必要对 西康柴胡 进行可靠的物种鉴定 。 [0007]因此, 提供一种基于SCAR分子标记的、 适 合于鉴定西康柴胡的方法非常有意 义。 发明内容 [0008]基于此, 本发明的目的之一在于提供一种鉴定西康柴胡的SCAR分子标记, 该SCAR 分子标记可以特异地、 准确地 鉴定西康柴胡。说 明 书 1/9 页 3 CN 114457183 A 3

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