(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210188194.7 (22)申请日 2022.02.28 (71)申请人 中国医学 科学院肿瘤医院 地址 100000 北京市朝阳区潘家园南里17 号 申请人 北京莱盟君泰国际医疗技 术开发有 限公司 (72)发明人 赫捷　刘骞　高亦博　李典格　 丁盟　 (74)专利代理 机构 成都顶峰专利事务所(普通 合伙) 51224 专利代理师 钱学宇 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 用于检测早期结直肠癌的血浆游离DNA甲基 化生物标记 物或其组合物、 应用及试剂盒 (57)摘要 本发明公开了一种用于检测早期结直肠癌 的血浆游离DNA甲基化生物标记物或其组合物、 应用及试剂盒， 属于生物检测技术领域。 甲基化 生物标记物包括cg19419054， cg10566012， cg02088996， cg05413061， cg10514097， cg10406295， cg21517947， cg20675505， cg18412834， cg03734437中的一种或多种组合 物。 通过联合检测多个结直肠癌相关并且特异的 甲基化标记物或其组合物来预测早期结直肠癌， 提高了检出率。 标记物与年龄及血浆游离DNA浓 度结合所训练出的模型在区分良性肠病(息肉) 和早期结直肠癌的血浆样本时的预测AUC值可达 0.936， 具有应用价值。 DNA甲基化标记物实为上 述位点上下游50bp大小的基因区域并通过计算 整个区域的平均甲基化值来增强预测模型的稳 定性。 权利要求书2页 说明书11页 附图11页 CN 114657248 A 2022.06.24 CN 114657248 A 1.一种用于检测早期结直肠癌的血浆游离DNA 甲基化生物标记物或其组合物， 其特征 在于， 所述甲基化生物标记物包括人类基因组中的cg19419054， cg10566012， cg02088996， cg05413061， cg10514097， cg10406295， cg21517947， cg20675505， cg18412834， cg03734437 中的一种或者多种的组合物； 其中， 所述cg19419054， cg10566012， cg02088996和cg05413061中的一种或者多种的组 合物， 为结直肠癌甲基化发生下降时的 甲基化生物标记 物或其组合物； 所述cg10514097， cg10406295， cg21517947， cg20675505， cg18412834和cg03734437中 的一种或者多种的组合物， 为结直肠癌甲基化发生上升时的甲基化生物标记物或其组合 物。 2.根据权利要求1所述的用于检测早期结直肠癌的血浆游离DNA 甲基化生物标记物或 其组合物， 其特征在于， 所述cg19419054的DNA甲基化标记物是指人类基因组中chr6: 39779523‑39779573之间的CpG位 点； 优选为， 所述cg10566012的DNA甲基化标记物是指人类基因组中chr13:40121121 ‑ 40121171之间的CpG位 点； 优选为， 所述cg02088996的DNA甲基化标记物是指人类基因组中chr7:41817746 ‑ 41817796之间的CpG位 点； 优选为， 所述cg05413061的DNA甲基化标记物是指人类基因组中chr3:16225282 ‑ 16225332之间的CpG位 点。 3.根据权利要求1所述的用于检测早期结直肠癌的血浆游离DNA 甲基化生物标记物或 其组合物， 其特征在于， 所述cg10514097的DNA甲基化标记物是指人类基因组中chr16: 86544762‑86544812之间的CpG位 点； 优选为， 所述cg10406295的DNA甲基化标记物是指人类基因组中chr8:41167088 ‑ 41167138之间的CpG位 点。 4.根据权利要求1所述的用于检测早期结直肠癌的血浆游离DNA 甲基化生物标记物或 其组合物， 其特征在于， 所述cg21517947的DNA甲基化标记物是指人类基因组中chr8: 41167082‑41167132之间的CpG位 点； 优选为， 所述cg20675505的DNA甲基化标记物是指人类基因组中chr8:72756787 ‑ 72756837之间的CpG位 点。 5.根据权利要求1所述的用于检测早期结直肠癌的血浆游离DNA 甲基化生物标记物或 其组合物， 其特征在于， 所述cg18412834的DNA甲基化标记物是指人类基因组中chr20: 61885266‑61885316之间的CpG位 点； 优选为， 所述cg03734437的DNA甲基化标记物是指人类基因组中chr8:97173501 ‑ 97173551之间的CpG位 点。 6.根据权利要求2 ‑5任一项所述的用于检测早期结直肠癌的血浆游离DNA甲基化生物 标记物或其组合物， 其特 征在于， 所述人类 基因组为hg19人类 基因组。 7.一种用于检测早期结直肠癌的血浆游离DNA 甲基化生物标记物或其组合物的应用， 其特征在于， 所述如权利要求1 ‑6任一项所述的甲基化生物标记物或其组合物用于结合年 龄和血浆cfDNA浓度进行检测。 8.一种用于检测早期结直肠癌发生的试剂盒， 其特征在于， 所述试剂盒包括如权利要权　利　要　求　书 1/2 页 2 CN 114657248 A 2求1‑6任一项所述甲基化 生物标记 物或其组合物； 以及还包括甲基化 生物标记 物或其组合物的探针。 9.根据权利要求8所述的用于检测早期结直肠癌发生的试剂 盒， 其特征在于， 所述探针 用于杂交捕获含有权利要求1所述甲基化 生物标记 物或其组合物的DNA序列片段。权　利　要　求　书 2/2 页 3 CN 114657248 A 3