(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210184045.3 (22)申请日 2022.02.28 (71)申请人 扬州大学 地址 225009 江苏省扬州市大 学南路88号 申请人 江苏 （武进） 水稻研究所 (72)发明人 刘巧泉　张昌泉　宋学堂　陈露　 黄李春　杨勇　史玉良　 (74)专利代理 机构 扬州苏中专利事务所(普通 合伙) 32222 专利代理师 许必元 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/686(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种DNA分子标记及利用其培育低直链淀粉 含量优良食味水稻的方法 (57)摘要 本发明公开了一种DNA分子标记以及利用其 培育低直链淀粉含量优良食味水稻的方法， 通过 选用具有低直链淀粉含量且具有优良食味表现 的品种A与常规品种B杂交， 利用与低直链淀粉含 量紧密连锁的分子标记进行后代具有低直链淀 粉含量性状的快速选择， 利用本发 明方法所选育 的水稻直链淀粉含量显著低于目前江苏地区常 规粳型软米， 该类型软米具有更好的食味品质， 该方法对于拓宽软米种质资源， 培育具有优食味 品质的水稻新品种提供了重要技术路线； 同时， 也对稻米食味品质改良具有重要意 义。 权利要求书1页 说明书5页 序列表1页 附图3页 CN 114525359 A 2022.05.24 CN 114525359 A 1.一种DNA分子标记， 与水稻低直链淀粉含量 紧密连锁， 其特征在于， 所述DNA分子标记 包括引物Lac6dc ‑F和Lac6dc ‑R， 所述Lac6dc ‑F的核苷酸序列为SEQ  ID NO. 1所示； 所述 Lac6dc‑R的核苷酸序列为SEQ  ID NO. 2所示。 2.权利要求1所述DNA分子标记在水稻低直链淀粉 含量基因型鉴定中的应用。 3.权利要求1所述DNA分子标记在鉴定水稻种质资源中的应用。 4.权利要求1所述DNA分子标记在水稻优良食味品种培 育中的应用。 5.利用权利要求1所述DNA分子标记培育低直链淀粉含量优良食味水稻的方法， 其特征 在于， 所述的方法为： 通过常规杂交方法， 以具有低 直链淀粉含量且食味品质好的品种A为杂交供体， 与常规 品种B进行杂交并在杂交后代利用权利要求1所述DNA分子标记进行分子标记辅助选择； 所述的分子标记辅助选择是从F2代开始， 利用分子标记进行PCR扩增和凝胶电泳检测， 选择具有品种A基因型 的个体进一步自交或回交， 从自交或回交后代中选择综合农艺性状 优且带有品种A基因型 单株种成系进行小区鉴定， 获得性状稳定的新品系。 6.根据权利要求5所述一种培育低 直链淀粉含量优良食味水稻的方法， 其特征在于， 所 述具有低直链淀粉含量且食味品质好的品种A为武香粳113， 所述常规品种B为粳稻高产品 系P17。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114525359 A 2一种DNA分子标记及利用其培育低直链淀 粉含量优良食味水 稻的方法 技术领域 [0001]本发明属于水稻分子标记辅助选择育种技术领域， 具体涉及一种DNA分子标记及 其应用、 分子标记培 育底直链淀粉 含量优良食味水稻的方法。 背景技术 [0002]直链淀粉含量是影响稻米食味品质的最重要因素， 一般高直链淀粉含量的米饭食 味品质较差， 而具有中低直链淀粉含量的米饭适口性较好。 在水稻食味品质改良研究中一 个重要的途径是通过降低稻米直链淀粉含量来提高稻米的食味品质。 近些年， 在长三角地 区具有低直链淀粉含量的稻米由于米饭软糯、 口感较好， 而广受消费者的欢迎， 这一类稻米 由于外观半透明， 介于常规稻米和糯米之间而被称为 “软米”或“半糯”米 （王才林等.  江苏 省优良食味粳稻的遗传与育种研究[J].  遗传, 2021, 43, 442‑448） 。 当前江苏地区主推 的软米品种如 “南粳”系列软米主要是通过选用本土高产品种与具有较低直链淀粉含量的 “关东194”的品种直接或间接杂交选育而来， 尽管该方法是培育具有优良食味水稻品种的 有效策略， 但这 也导致了当前 江苏软米品种的遗传资源单一， 软米品种同质化较为 严重。 [0003]水稻胚乳中的直链淀粉主要由 Wx基因控制合成， Wx基因的等位变异是造成水稻品 种间直链淀粉淀粉含量丰富变异的主要原因。 在众多的 Wx等位变异类型中， 控制低直链淀 粉含量的 Wxmp等位基因是江苏地区粳型软米品种所主要利用的等位基因， 目前江苏省的软 米类品种几乎都是利用的来自日本品种 “关东194”的Wxmp等位基因， 这使得当前优良食味水 稻品种培育的基因资源单一， 亟需拓宽新的软米种质和基因资源 （陈智慧， 王芳权， 许扬， 王 军， 李文奇， 范方军， 仲维功， 杨杰.  软米基因Wx ‑mp在部分粳稻品种资源中的分布.  植物遗 传资源学报  2019， 20 （4） ： 975 ‑981） 。 而对于同样控制低直链淀粉含量的 Wxop等位基因一般 存在于云南等地区的籼稻中。 事实上， 除了 Wx基因外， 研究还发现了一些能够通过直接调控 Wx基因表达而影响稻米直链淀粉含量的基因， 如 Du1、Du3、qAC2和LowAC1等， 这些基因的突 变均能显著降低稻米直链淀粉含量。 从优良食味水稻的培育来看， 这类水稻种质和基因都 具有潜在的育种利用价值 （Huan g et al., Plant communications,  2021,2,100237） 。 然 而从已经育成的具有低直链淀粉含量的优良食味水稻品种来看， 尚没有明确信息表明这些 基因成功用于新品种的培育。 因此， 从育种实际出发， 亟需通过种质资源和新基因的挖掘来 拓宽满足育种需求的新种质和新基因， 并且利用相关育种技术的建立来 实现新型优良食味 水稻品种的选 育。 发明内容 [0004]本发明针对上述现有技术存在的技术问题， 为拓宽种质资源， 建立培育低直链淀 粉含量且食味优良水稻的途径， 提供一种培育底直链淀粉含量优良食味水稻的方法， 利用 分子标记辅助选择技术培育具有低直链淀粉含量优良食味水稻， 适用于具有低直链淀粉含 量优良食味水稻的分子 辅助选择育种。说　明　书 1/5 页 3 CN 114525359 A 3