(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210221154.8 (22)申请日 2022.03.07 (71)申请人 中国农业科 学院作物科 学研究所 地址 100081 北京市海淀区中关村南大街 12号 (72)发明人 周永力　李健敏　卢家玲　赵璞　 (74)专利代理 机构 北京纪凯知识产权代理有限 公司 11245 代理人 张羽 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 鉴定或辅助鉴定水稻白叶枯病抗性的引物 组合物及其方法 (57)摘要 本发明公开了鉴定或辅助鉴定水稻白叶枯 病抗性的引物组合物及其方法。 该方法包括检测 待测水稻基因组中SNP位点的基因型， 根据所述 基因型鉴定或辅助鉴定水稻白叶枯病抗性， 所述 SNP位点为水稻3号染色体22 349117bp处。 该方法 可用于预测水稻对白叶枯病的抗 性。 权利要求书2页 说明书10页 序列表2页 附图1页 CN 114410828 A 2022.04.29 CN 114410828 A 1.检测水稻基因 组中SNP位 点的多态性或基因型的物质在 如下任一中的应用， (1)鉴定或辅助鉴定水稻白叶枯病抗 性； (2)筛选或选育抗白叶枯病的水稻单株或株系或品系或品种； (3)筛选或选育感白叶枯病的水稻单株或株系或品系或品种； (4)水稻育种； (5)制备鉴定或辅助鉴定水稻白叶枯病抗 性的产品； (6)制备筛 选或选育抗白叶枯病的水稻单株或株系或品系或品种的产品； (7)制备筛 选或选育感白叶枯病的水稻单株或株系或品系或品种的产品； (8)制备水稻育种的产品； 所述SNP位 点为水稻3号染色体2 2349117bp处。 2.鉴定或辅助鉴定水稻白叶枯病抗性的方法， 其特征在于： 包括检测待测水稻基因组 中SNP位点的基因型， 根据所述基因型鉴定或辅助鉴定水稻白叶枯病抗性， 所述SNP位点为 水稻3号染色体2 2349117bp处。 3.根据权利要求1所述的应用或2所述的方法， 其特征在于： 所述SNP位点的基因型为 AA、 AG或GG； 所述根据所述基因型鉴定或辅助鉴定水稻白叶枯病抗 性为如下任一种方式： 1)所述SNP位 点的基因型为A A或AG的待测水稻为或候选为 抗白叶枯病的水稻， 2)所述SNP位 点的基因型为G G的待测水稻为或候选为感白叶枯病的水稻； 3)所述SNP位点的基因型为AA或AG的待测水稻的白叶枯病抗性高于所述SNP位点的基 因型为GG的待测水稻的。 4.权利要求2或3所述的方法在水稻育种中的应用。 5.水稻育种的方法， 其特 征在于： 包括选择水稻基因组中SNP位点的基因型为AA的水稻作为亲本进行育种， 所述SNP位点 为水稻3号染色体2 2349117bp处； 或 包括选择水稻基因组中SNP位点的基因型为GG的水稻作为亲本进行育种， 所述SNP位点 为水稻3号染色体2 2349117bp处。 6.含有检测水稻基因组中SNP位点的多态性或基因型的物质的产品， 其特征在于： 所述 产品为任一种： C1)检测水稻白叶枯病抗 性相关的单核苷酸多态性或基因型的产品； C2)鉴定或辅助鉴定水稻白叶枯病抗 性的产品； C3)用于水稻育种的产品； C4)筛选或选育抗白叶枯病的水稻单株或株系或品系或品种的产品； C5)筛选或选育感白叶枯病的水稻单株或株系或品系或品种的产品； 所述SNP位 点为水稻3号染色体2 2349117bp处。 7.根据权利要求1或4所述的应用、 权利要求2、 3或5所述的方法或权利要求6所述的产 品， 其特征在于： 所述检测水稻基因组中SNP位点的多态性或基因型的物质为如下D1)、 D2) 或D3)： D1)含有扩增包括所述SNP位 点在内的水稻基因 组DNA片段的引物组合物； D2)含有D1)所述引物组合物的PCR试剂；权　利　要　求　书 1/2 页 2 CN 114410828 A 2D3)含有D1)所述引物组合物或D2)所述PCR试剂的试剂盒。 8.根据权利要求7所述的应用、 方法或产品， 其特征在于： 所述引物组合物包括引物A、 引物B和引物C； 引物A为如下(a1)或(a2)： (a1)序列表的序列1所示的单链DNA分子； (a2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同 功能的DNA分子； 引物B为如下(b1)或(b2)： (b1)序列表的序列2所示的单链DNA分子； (b2)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同 功能的DNA分子； 引物C为如下(c1)或(c2)： (c1)序列表的序列3所示的单链DNA分子； (c2)将序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列3具有相同 功能的DNA分子 。 9.DNA分子， 其特 征在于： 核苷酸序列如序列表的序列4所示。 10.权利要求9所述的DNA分子在 如下任一中的应用， (1)鉴定或辅助鉴定水稻白叶枯病抗 性； (2)筛选或选育抗白叶枯病的水稻单株或株系或品系或品种； (3)筛选或选育感白叶枯病的水稻单株或株系或品系或品种； (4)水稻育种； (5)制备鉴定或辅助鉴定水稻白叶枯病抗 性的产品； (6)制备筛 选或选育抗白叶枯病的水稻单株或株系或品系或品种的产品； (7)制备筛 选或选育感白叶枯病的水稻单株或株系或品系或品种的产品； (8)制备水稻育种的产品。权　利　要　求　书 2/2 页 3 CN 114410828 A 3