(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210220371.5 (22)申请日 2022.03.08 (66)本国优先权数据 202110258132.4 2021.0 3.09 CN (71)申请人 广州市基准医疗 有限责任公司 地址 510000 广东省广州市国际生物岛螺 旋三路8号5 02单元 (72)发明人 刘鑫　李慧　杨婷　陈志伟　 范建兵　 (74)专利代理 机构 北京安信方达知识产权代理 有限公司 1 1262 专利代理师 刘晓杰　武晶晶 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 可用于胃癌HER2伴随诊断的基因甲基化标 记物或其组合和应用 (57)摘要 本发明涉及一种可用于胃癌HER2伴随诊断 的甲基化标记物或其组合， 所述甲基化标记物或 其组合包括选自以下的任意一种或两种以上的 组合： chr17:37879893、 chr17:37881021、 chr17: 37886390、 chr17:37893765、 chr17:37860353。 本 发明还提供了上述甲基化分子标记物或其组合 的检测试剂盒， 以及检测方法。 本发明获得了在 胃癌HER2+及HER2 ‑恶性患者血浆中明显异常甲 基化修饰的基因组片段， 该血浆基因组片段组合 能够作为H ER2伴随诊断诊断标记 物。 权利要求书4页 说明书15页 序列表9页 附图6页 CN 115044671 A 2022.09.13 CN 115044671 A 1.一种可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的甲基化标记物或其组合， 其 特征在于， 所述甲基化标记物或其组合包括选自以下标记物中的任意一种或两种及以上的 组合： chr17:37879893、 chr17:37881021、 chr17:37886390、 chr17:37893765、 chr17: 37860353、 chr17:37843 592。 2.根据权利要求1所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的甲基化标 记物或其组合， 其特征在于， 所述甲基化标记物或其组合包括chr17:37879893和/或chr17: 37843592标记物。 3.根据权利要求2所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的甲基化标 记物或其组合， 其特征在于， 所述甲基化标记物或其组合包括标记物chr17:37879893和 chr17:3786 0353。 4.根据权利要求1所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的甲基化标 记物或其组合， 其特征在于， 所述甲基化标记物或其组合还包括选自以下的至少一种： chr17:37862986， chr17:37862178， chr17:37884314， chr17:37879819， chr17:37895887， chr17:37893999， chr17:37855528， chr3:38080799， chr17:37843863， chr17:37821433， chr17:3785 6695， chr17:379 26322标记物。 5.根据权利要求4所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的甲基化标 记物或其组合， 其特征在于， 所述甲基化标记物组合包括chr17:3787989 3， chr17:3 7886390 和chr17:378939 99标记物。 6.根据权利要求4所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的基因 甲基 化标记物或其组合， 其特征在于， 所述甲基化标记物或其组合包括chr17:37879893， chr17: 37886390， chr17:3789376 5， chr17:37862178， 和c hr17:378939 99标记物。 7.根据权利要求2所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的甲基化标 记物或其组合， 其特征在于， 所述甲基化标记物组合包括chr17:37843592、 chr17:3 7879893 和chr17:3786 0353标记物。 8.根据权利要求2所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的甲基化标 记物或其组合， 其特征在于， 所述甲基化标记物组合包括chr17:37843592、 chr17:3 7893999 和chr17:3786 0353标记物。 9.根据权利要求2所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的甲基化标 记物或其组合， 其特征在于， 所述甲基化标记物组合包括chr17:37843592、 chr17:3 7862178 标记物。 10.根据权利要求1 ‑8任一项所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断 的甲基化标记物或其组合， 其特征在于， 所述甲基化标记物或其组合还包括选自以下标记 物中至少一种： c hr8:41309473， chr17:3784326 5， chr17:37843818， c hr17:37843793， c hr17:378 86349， chr17:378 86390， chr17:37820452， c hr17:37820496， c hr17:37968912， c hr17:37968904， chr17:37893804， c hr17:378943 52， chr17:37893 005， chr17:378943 34， chr17:37893813， c hr17:37894 439， chr17:37894258， c hr17:3789428 8， chr17:378 86321， chr17:379 26309， chr17:3789416 5， chr17:37894 469， chr17:3787326 6， chr17:3789423 3， chr17:37894252， c hr18:19745506，权　利　要　求　书 1/4 页 2 CN 115044671 A 2chr17:37894 413， chr17:37785459， c hr17:37894 403， chr17:37785442， chr17:378958 80， chr18:19745476， c hr18:19745494， c hr17:37896175， chr17:37873 304， chr17:37894 485， chr18:19745514， chr17:37785429， chr17:37873 326， chr18:19745472， c hr17:37894 482， chr18:19745487， chr17:37896 050， chr18:19745442， chr17:37896 074， chr17:37785426， chr17:37894347， c hr18:19745458， c hr3:3808079 9， chr2:279383 52， chr17:37895919， chr18:19745509， chr17:37894397， c hr2:279383 60， chr17:3789620 3， chr17:379 26366， chr18:19745504， chr19:36232197， c hr17:3789616 5， chr17:37896 063， chr1:26551710， chr1:26551791， chr6:167276 600， chr1:26551681， chr1:26551782， chr17:38024048， chr18:19745530， chr18:19745445， chr1:28919250， chr17:37820516， chr19: 50832069， chr2:157178147， c hr2:157178249， c hr2:27938342， c hr6:167276 599， chr1:28919 276， chr17:37784733， chr6:167276 619， chr2:1571782 98， chr6:4321 1253， chr1:46632751， chr1:26551788， chr11:94473568， chr1:46632737， chr19:50832047。 11.根据权利要求10所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的甲基化 标记物或其组合， 其特 征在于， 所述甲基化标记 物组合包括 chr17:37879893， c hr17:37862178,c hr17:37862 986， chr17:378943 52， chr17:37820452， c hr17:3789376 5， chr17:378 86349， chr17:3785 6695， chr17:37843793， c hr17:378 86390标记物。 12.根据权利要求10所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的甲基化 标记物或其组合， 其特 征在于， 所述甲基化标记 物组合包括 chr17:37879893， c hr17:378 81021， chr17:378 86390， chr17:3789376 5， chr17:3786 0353， chr17:37862 986， chr17:37862178， c hr17:378 84