(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210219039.7 (22)申请日 2022.03.08 (71)申请人 郑州源创吉因实业有限公司 地址 450000 河南省郑州市航空港区黄海 路与生物科技二街交叉口东北角郑州 临空生物医药园1 1号楼 申请人 徐茜 (72)发明人 徐茜　赵辉　郭玉刚　高萧芳　 孙宪凯　 (74)专利代理 机构 郑州铭晟知识产权代理事务 所(特殊普通 合伙) 41134 专利代理师 张鹏 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) C12N 15/11(2006.01)G16B 5/00(2019.01) G16B 20/30(2019.01) (54)发明名称 基于坏死性凋亡相关基因组合构建的模型 在制备预测低级别胶质瘤预后产品中的应用 (57)摘要 本发明公开了基于坏死性凋亡相关基因组 合构建的模型在制备预测低级别胶质瘤预后产 品中的应用， 本发明采用 坏死性凋亡相关基因： BID、 H2AFY2、 MAPK9、 TNFRSF10B作为检测靶标， 构 建的模型预测性能良好； 构建结合坏死性凋亡相 关基因风险评估模型和临床因素的列线图对生 存率具有更高的预测性能,对模 型中的高风险和 低风险在免疫浸润方面的差异比较和预后模型 对预后治疗的用药指导有望将基于坏死性凋亡 相关基因构建的模型用于L GG患者预后和免疫治 疗反应的临床预测。 权利要求书1页 说明书6页 序列表4页 附图7页 CN 114736964 A 2022.07.12 CN 114736964 A 1.基于坏死性凋亡相关基因组合构建的模型在制备预测低级别胶质瘤预后产品中的 应用。 2.根据权利要求1所述应用， 其特 征在于， 所述坏死性凋亡相关基因组合包括BID、 H2AFY2、 MAPK9、 TNFRSF10B； 所述BID、 H2AFY2、 MAPK9、 TNFRSF10B的序列为SEQUENC E LISTING所示。 3.根据权利要求1所述应用， 其特征在于， 所述应用是通过检测所述坏死性凋亡相关基 因组合的表达水平， 从而预测低级别胶质瘤预后和指导临床应用。 4.根据权利要求3所述应用， 其特征在于， 所述检测采用的试剂包括特异性扩增坏死性 凋亡相关基因的上下游引物或者特异性识别坏死性凋亡相关基因的探针； 所述上下游引物 为SEQUENC E LISTING所示； 所述产品包括试剂盒和芯片。 5.一种预测低级别胶质瘤预后的产品， 其特征在于， 包括检测离体低级别胶质瘤组织 样本中坏死性凋亡相关基因： BID、 H2 AFY2、 MAPK9、 TNFRSF10B表达水平的试剂。 6.根据权利要求5所述预测低级别胶质瘤预后的产品， 其特征在于， 采用所述产品检测 坏死性凋亡相关基因的表达水平， 使用风险评分公式 进行风险 评分， 其中， n为坏死性凋亡相关基因的数量， βi为坏死性凋亡相关基因的系数， exp  of  mRNA为纳入风险评分系统的基因表达水平； 所纳入组合的4个坏死性凋亡相关基因： BID、 H2AFY2、 MAPK9、 TNFRSF10B的系数分别为 –0.073、‑0.047、‑0.071、 0.089； 预测低级别胶质瘤 预后情况时， 风险评分临界值(0.87)将患者分为高风险组和低风险组。 7.采用权利要求6所述风险评分公式的构建方法获得的预测低级别胶质瘤预后模型 为： 风险评分＝( ‑0.073×BID表达水平)+( ‑0.047×H2AFY2表达水平)+( ‑0.071×MAPK9表 达水平)+(0.089 ×TNFRSF10B表达水平)； 当风险评分大于0.87092时， 患者为高风险患者； 当风险评分小于 0.87042时， 患者 为低风险患者。 8.根据权利要求7所述的预测低级别胶质瘤预后模型， 其特征在于， 根据Cox回归分析 得到独立临床因素， 结合风险评 分模型， 绘制列线图， 评估患者的预后生存率并制定个性化 治疗方案 。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114736964 A 2基于坏死性凋亡相关基因组合构建的模型在制备 预测低级别 胶质瘤预后产品中的应用 技术领域 [0001]本发明涉及 生物医学技术领域， 特别是涉及基于坏死性凋亡相关基因组合构建的 模型在制备 预测低级别胶质瘤预后产品中的应用。 背景技术 [0002]胶质瘤是最常见的原发性中枢神经系统恶性肿瘤， 据美国脑肿瘤注册中心统计， 胶质瘤约占所有中枢神经系统恶性肿瘤的8 0％。 WHO中枢神经系统分类将胶质瘤分为whoI ‑ IV级， I、Ⅱ级为低级别， Ⅲ、 IV级为高级别 。 低级别胶质瘤(low  grade glioma,LGG)虽然只 占20％,其治疗方案的选择， 受诸多因素影响。 低级别胶质瘤具有侵袭性生长、 对放化疗耐 药等恶性生物学特征， 有发展为高级别胶质瘤的趋势。 随着对其研究 的逐渐深入， 循证医学 证据不断积累， 尤其是分子病理诊断在临床实践中的应用， 各权威指南对低分级脑胶质瘤 临床诊疗方案的推荐均做出相应更新， 同时因为对低分级脑胶质瘤的研究还很不深入， 因 此临床诊疗的许多环节还存在争议。 因此， 建立一种有效的低级别胶质瘤预后评估模型用 于LGG患者预后和免疫 治疗反应的临床预测是很有必要的。 [0003]近年来， 坏死性凋亡的信号通路得到了广泛的研究。 坏死性凋亡是一种依赖于 RIPK1和RIPK3激酶活性的细胞死亡模式。 坏死性凋亡与多种癌症密切相关， 包括低级别胶 质瘤， 其形成受坏死小体、 坏死凋亡小体等一系列因素调控。 BID在细胞凋亡过程中起主要 作用， 并与特定类型胃癌的生长有关。 MAPK9在NSCLC组织的正常组织中表达上调， CircRNF20通过激活MAPK9加速非小细胞肺癌进展。 YIPF2通过增强T NFRSF10B向非小细胞肺 癌细胞质膜的再循环来 促进细胞凋亡， 然 而这些基因在LG G中的应用还未 见报道。 发明内容 [0004]针对上述情况， 本发明之目的在 于提供基于坏死性凋亡相关基因(NECsig)组合构 建的模型在制备 预测低级别胶质瘤(LG G)预后产品中的应用。 [0005]其解决的技 术方案是： [0006]基于坏死性凋亡相关基因组合构建的模型在制备预测低级别胶质瘤预后产品中 的应用。 [0007]进一步的， 所述坏死性凋亡相关基因组合包括BID、 H2AFY2、 MAPK9、 TNFRSF10B； 所 述BID、 H2 AFY2、 MAPK9、 TNFRSF10B的序列为SEQUENC ELISTING所示。 [0008]进一步的， 所述应用是通过检测所述坏死性凋亡相关基因组合的表达水平， 从而 预测低级别胶质瘤预后和指导临床应用。 [0009]进一步的， 所述检测采用的试剂包括特异性扩增坏死性凋亡相关基因的上下游引 物或者特异性识别坏死性凋亡相关基因的探针； 所述上下游引物为SEQUENCE  LISTING所 示； 所述产品包括试剂盒和芯片。 [0010]一种预测低级别胶质瘤预后的产品包括检测离体低级别胶质瘤组织样本中坏死说　明　书 1/6 页 3 CN 114736964 A 3