(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210242968.X (22)申请日 2022.03.11 (71)申请人 中国农业科 学院油料作物研究所 地址 430062 湖北省武汉市武昌区徐 东二 路2号 (72)发明人 白泽涛　杨黎　刘胜毅　赵传纪　 刘杰　程晓辉　刘越英　刘立江　 黄军艳　 (74)专利代理 机构 深圳智趣知识产权代理事务 所(普通合伙) 44486 专利代理师 崔艳峥 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/6811(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种油菜黑腐病的分子标记及其获得方法 和应用 (57)摘要 本发明公开了一种油菜黑腐病的分子标记 及其获得方法和应用。 通过剪叶法接种鉴定出油 菜黑腐病抗性材料， 构建其与感病来源材料的F2 群体， 采用BSA ‑seq技术， 对抗病基因进行初定 位， 在此区间内筛选出能用于抗黑腐病筛选和基 因定位的SNP和InDel 分子标记。 所述 分子标记物 包括SNP分子 标记1～9和InDel 分子标记1～4， 本 发明为油菜黑腐病功能基因的挖掘和分子育种 提供了新的分子标记， 对增强油菜对黑腐病抗性 具有重要的应用前 景。 权利要求书3页 说明书13页 序列表6页 附图5页 CN 114854890 A 2022.08.05 CN 114854890 A 1.一种油菜黑腐病的分子标记， 其特征在于， 所述分子标记物包括SNP分子标记和 InDel分子标记， 所述SNP分子标记包括SNP标记1、 SNP标记2、 SNP标记3、 SNP标记4、 SNP标记 5、 SNP标记6、 SNP标记7、 SNP标记8、 SNP标记9中的至少一种； 所述InDel分子标记包括InDel 标记1、 InDel标记 2、 InDel标记3、 I nDel标记4中的至少一种。 2.根据权利要求1所述的分子标记， 其特 征在于， 所述SNP标记1～ 9均位于油菜的染色体A 9上； 所述SNP标记1为碱基G或A， 所述SNP标记位于核酸的第364位， 所述核酸具有SEQ  ID  NO.1所示核苷酸序列； 所述SNP标记2为碱基A或G， 所述SNP标记位于核酸的第337位， 所述核酸具有SEQ  ID  NO.2所示核苷酸序列； 所述SNP标记3为碱基A或T， 所述SNP标记位于核酸的第357位， 所述核酸具有SEQ  ID  NO.3所示核苷酸序列； 所述SNP标记4为碱基G或A， 所述SNP标记位于核酸的第939位， 所述核酸具有SEQ  ID  NO.4所示核苷酸序列； 所述SNP标记5为碱基C或T， 所述SNP标记位于核酸的第376位， 所述核酸具有SEQ  ID  NO.5所示核苷酸序列； 所述SNP标记6为碱基T或C， 所述SNP标记位于核酸的第222位， 所述核酸具有SEQ  ID  NO.6所示核苷酸序列； 所述SNP标记7为碱基C或G， 所述SNP标记位于核酸的第516位， 所述核酸具有SEQ  ID  NO.7所示核苷酸序列； 所述SNP标记8为碱基A或T， 所述SNP标记位于核酸的第215位， 所述核酸具有SEQ  ID  NO.8所示核苷酸序列； 所述SNP标记9为碱基A或G， 所述SNP标记位于核酸的第653位， 所述核酸具有SEQ  ID  NO.9所示核苷酸序列。 3.根据权利要求1所述的分子标记， 其特征在于， 所述InDel分子标记1～4均位于油菜 的染色体A 9上； 用于扩增所述 InDel标记1的引物对具有如下核苷酸序列： InDel‑5‑F： GCATTTTCATTCTTCAGTGC； InDel‑5‑R： TGTTTTCGAAGTCAAAAGGT； 所述InDel ‑5引物对扩增的InDel标记特征条带为170bp， 核苷酸序列如SEQ  ID NO.10 所示； 用于扩增所述 InDel标记 2的引物对具有如下核苷酸序列： InDel‑36‑F： CTGAGTCA AGGCTCCAAATA； InDel‑36‑R： CGTATTGGAGGAATGGTATG； 所述InDel‑36引物对扩增的InD el标记特征条带为190bp， 核苷酸序列如SEQ  ID NO.11 所示； 用于扩增所述 InDel标记3的引物对具有如下核苷酸序列： InDel‑45‑F： ATCATGCATAGA AAGCCACT； InDel‑45‑R： AGTTACTACGCGTC CATGTT；权　利　要　求　书 1/3 页 2 CN 114854890 A 2所述InDel‑45引物对扩增的InD el标记特征条带为143bp， 核苷酸序列如SEQ  ID NO.12 所示； 用于扩增所述 InDel标记4的引物对具有如下核苷酸序列： InDel‑57‑F： CCTCTTCAACTTCTTCTCCA； InDel‑57‑R： CCAAGTAAACATGCGA ATAA； 所述InDel‑57引物对扩增的InD el标记特征条带为163bp， 核苷酸序列如SEQ  ID NO.13 所示。 4.用于检测权利要求1所述的SNP分子标记和I nDel分子标记的引物对。 5.根据权利要求 4所述的引物对， 其特 征在于， 所述引物对的序列为： 所述引物对Xc c‑183用于扩增SEQ  ID NO.1所示核苷酸序列； 所述引物对Xc c‑2010用于扩增SEQ  ID NO.2所示核苷酸序列； 所述引物对Xc c‑3743用于扩增SEQ  ID NO.3所示核苷酸序列； 所述引物对Xc c‑3757用于扩增SEQ  ID NO.4所示核苷酸序列； 所述引物对Xc c‑3773用于扩增SEQ  ID NO.5所示核苷酸序列； 所述引物对Xc c‑3920用于扩增SEQ  ID NO.6所示核苷酸序列； 所述引物对Xc c‑4033用于扩增SEQ  ID NO.7所示核苷酸序列； 所述引物对Xc c‑4043用于扩增SEQ  ID NO.8所示核苷酸序列； 所述引物对Xc c‑4356用于扩增SEQ  ID NO.9所示核苷酸序列； 所述引物对I nDel‑5用于扩增SEQ  ID NO.10所示核苷酸序列；权　利　要　求　书 2/3 页 3 CN 114854890 A 3