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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210246961.5 (22)申请日 2022.03.14 (71)申请人 沈阳农业大 学 地址 110866 辽宁省沈阳市沈河区东陵路 120号 (72)发明人 姜宏波 刘京慧 包杰 陈启军  (74)专利代理 机构 沈阳铭扬联创知识产权代理 事务所(普通 合伙) 21241 专利代理师 吕敏 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01) C12N 15/11(2006.01) C12Q 1/6851(2018.01) (54)发明名称 中华小长臂虾微孢子虫绝对荧光定量PCR检 测方法、 试剂盒及引物 (57)摘要 一种中华小长臂虾微孢子虫绝对荧光定量 PCR检测方法、 试剂盒及引物, 属于分子生物学技 术领域。 具体检检测方法: 采集样本; 中华小长臂 虾微孢子虫DNA的提取; 合成扩增片段大小为 141bp的上下游引物; 绝对荧光定量PCR方法的建 立; 标准曲线的绘制; 绝对荧光定量PCR方法的灵 敏度和特异性试验。 本发明建立快速, 灵敏的中 华小长臂虾微孢子虫分子检测方法, 与传统的 PCR检测方法相比, 具有省事、 高效、 灵敏、 定量的 特点。 权利要求书1页 说明书7页 序列表1页 附图3页 CN 114592071 A 2022.06.07 CN 114592071 A 1.一种中华小长臂虾微孢子虫绝对荧光定量PCR检测的特异性引物, 其特征在于: 根据 中华小长臂虾 微孢子虫的靶基因序列, 合 成扩增片段大小为 141bp的上下游引物, 所述引物 的序列如下: 上游引物为:5 ’ ‑ATTCCCTCGTTCGTTGAGTCAGAT TG‑3’, 下游引物为: 5 ’ ‑GTGGCATTGTCATCATC CCTTTGTTG‑3’, 引物浓度有 要求为10 μM/ μL。 2.一种中华小长臂虾微孢子虫绝对荧光定量PCR检测的试剂 盒, 其特征在于: 包括权利 要求1所述的上 下游引物以及中华小长臂 虾微孢子虫质粒 标准品。 3.根据权利要求1所述的用于中华小长臂虾微孢子虫绝对荧光定量PCR检测的试剂 盒, 其特征在于: 所述中华小长臂虾微孢子虫质粒标准品由Eb99F/Eb99R引物进行扩增得到目 的片段制备而成, ‑20℃保存。 4.如权利要求1 ‑2任一项所述的引物在中华小长臂虾微孢子虫绝对荧光定量PCR检测 中的应用。 5.一种中华小长臂虾微孢子虫绝对荧光定量PCR检测方法, 其特征在于: 绝对荧光定量 PCR方法的建立: 使用2 ×ChamQ Universal  SYBR qPCR Master Mix试剂进行绝对 荧光定量 PCR方法的建立, 反应体系为20 μL, 2 ×ChamQ Universal  SYBR qPCR Master Mix 10.0 μL, 上下游引物各0.4 μL, ddH2O 7.2 μL, 模板2 μL; 加 样时先将引物和ddH2O均匀混合并分装到反 应管, 后加均匀混合好的模板和2 ×ChamQ Universal  SYBR qPCR Master Mix, 上机器前离 心处理; 反应条件为: 预变性95℃30s, 1个循环; 变性95℃10s, 退火60℃ 30s, 延伸72℃ 30s, 40个 循环。 6.根据权利要求5所述的一种中华小长臂虾微孢子虫绝对荧光定量PCR检测方法, 其特 征在于: 所述 荧光定量PCR标准曲线的绘制: (1)制备含 扩增靶序列的阳性质粒作为阳性标准品; (2)将构建标准重组质粒换算拷贝数后, 进行连续的10倍梯度稀释, 从7.7 ×100到7.7× 108共设置9个浓度梯度, 每个梯度设置6个重复, 于荧光定量PCR仪中进行扩增, 各取2 μL当 做模板, 同时设置以d dH2O为模板为阴性对照; (3)扩增结束后收集数据, 根据扩增屈曲线、 Ct值, 每个浓度重复3次进行检测, 得出最 佳的检测区间, 并绘制标准曲线。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114592071 A 2中华小长臂虾微孢 子虫绝对荧光定量PCR检测方 法、 试剂盒及 引物 技术领域 [0001]本发明属于分子生物学技术领域, 特别是涉及一种中华小长臂虾微孢子虫绝对荧 光定量PCR检测方法、 试剂盒及特异性引物。 背景技术 [0002]微孢子虫最早被报道于1857年, (Nageli  1857), 是典型的专性胞内寄生的单细胞 真核生物, 微孢子虫自身具有着独特 的特征, 如独特的侵染装置, 孢子发芽时弹出极丝, 将 具有感染性的胞原质运输到细胞内。 国际动物命名委员会(ICZN)已确定微孢子虫门包括 200多个属(Becnel  et al., 2014)。  Thelohania属侵染直额长臂虾(Palaemon   rectirostris)、 锯齿长臂虾  (Palaemon  serratus)和海洋褐虾(Cran gon vulgaris)和淡 水龙虾和奥斯塔欧洲鳌虾(Astacus  fluviatilis )等虾类(Edgerton  BF et al, 2002;   Stentiford  GD et al, 2013)。 [0003]Enterocytospora  artemiae(EAM)最早发现于2013年, 它 被认为是一种专性于卤 虫的寄生虫, 仅限于欧洲和美洲(Ro de等人, 2013年)。 然而, 在2020  年, 发现这种微孢子虫 已经蔓延到亚洲, 并感染了具有重要经济意义的中华小长臂虾(Jiang  et al.,2020)。 EAM 主要寄生于中华小长臂虾的肝胰腺。 EAM感染严重时会导致肝胰腺发白病变, 并大大降低中 华小长臂虾的活力, 使其生长缓慢、 发育停滞。 虽然死亡率不高, 但这些微孢子虫对宿主营 养的吸收导致繁育成本增 加。 [0004]目前, 对于EAM的检测主要有光学显微、 电子显微镜镜观察、 组织病理切片, 但是这 些技术分别使用时, 却各有其局限性。 电镜观察耗时长, 费用高并需要 具备特殊放入实验器 材视野狭窄, 感染宿主的微孢子虫数量较低时, 通过传统染色、 光学显微镜或电子显微镜进 行观察变得无效, 从而 无法准确测定各种微孢子虫。 组织病理切片虽组织结构保存良好, 在 病理和回顾性研究中有较大的实用价值, 但观察需要 大量虫体, 不适用于早期检测, 操作繁 琐, 费时费工; 常规P CR灵敏度低、 不能准确、 定量的检测EAM及其在宿 主组织中的寄生活性。 相比之下, 实时荧光定量PCR(qPCR), 具有优势: 如高特异性和高灵敏度, 消耗更少时间, 并 可得知初始DNA模板的拷贝数。 qPCR检测过程是在一个相 对封闭、 独立的系统中完成, 防止 样品和环境的交叉污染(Kotk ová等人, 2018年; L i等人, 2019年)。 发明内容 [0005]针对上述存在的中华小长臂虾微孢子虫诊断技术检测灵敏度不高、 操作频繁、 检 测时期较晚等技术问题, 本发明提供一种中华小长臂虾微孢子虫  Enterocytospora   artemiae(EAM)绝对荧光定量PCR检测方法、 试剂盒及特异性引物, 它可以快速诊断中华小 长臂虾微孢子虫的特异性引物及SYBR  Green荧光定量PCR检测, 使得中华小长臂虾微孢子 虫检测的灵敏度和特异性得到 很大程度的增强, 并避免了漏检和误 解。 [0006]本发明的目的是通过以下技 术方案来实现的:说 明 书 1/7 页 3 CN 114592071 A 3

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专利 中华小长臂虾微孢子虫绝对荧光定量PCR检测方法、试剂盒及引物 第 1 页 专利 中华小长臂虾微孢子虫绝对荧光定量PCR检测方法、试剂盒及引物 第 2 页 专利 中华小长臂虾微孢子虫绝对荧光定量PCR检测方法、试剂盒及引物 第 3 页
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