(19)国家知识产权局 (12)发明 专利 (10)授权公告 号 (45)授权公告日 (21)申请 号 202210262182.4 (22)申请日 2022.03.17 (65)同一申请的已公布的文献号 申请公布号 CN 114350813 A (43)申请公布日 2022.04.15 (73)专利权人 广州达安临床检验中心有限公司 地址 510525 广东省广州市高新 技术产业 开发区荔枝山路6号 专利权人 上海市东方医院(同济大 学附属 东方医院） 　 上海达安医学检验所有限公司 (72)发明人 陈琳　傅传刚　杨旭东　吴军生　 安俊峰　曹湛波　周主青　朱哲　 (74)专利代理 机构 上海骁象知识产权代理有限 公司 31315 专利代理师 林炜 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) C12N 15/11(2006.01)(56)对比文件 CN 109781985 A,2019.0 5.21 CN 113005197 A,2021.0 6.22 CN 112980950 A,2021.0 6.18 CN 111304332 A,2020.0 6.19 CN 111499615 A,2020.08.07 US 201516 6646 A1,2015.0 6.18 CN 110499364 A,2019.1 1.26 CN 110229899 A,2019.09.13 CN 105671199 A,2016.0 6.15 CN 103695560 A,2014.04.02 李红梅 等.肿瘤放疗敏感性调节基因研究 进展. 《现代肿瘤医学》 .201 1,第19卷(第2期), Neha Shre e Maurya 等.Transcriptome profiling by combi ned machine learn ing and statistical R analysis identifies TMEM236 as a potential n ovel dia gnostic biomarker for co lorectal cancer. 《Scientific Reports》 .2021,第1 1卷 审查员 颜泉梅 (54)发明名称 TMEM236基因在制备用于诊断直肠癌新辅助 放疗抵抗标记 物中的用途 (57)摘要 本发明提供了TMEM236基因在制备用于诊断 局部进展期直肠癌新辅助放疗原发性抵抗标记 物中的用途， TMEM236基因突变位点为chr10: 17796115， 如果检测到所述 的TMEM236基因在位 点chr10:17796115发生点突变， TMEM236:NM_ 001098844:exon4:c.G667A， 则显示该患者对放 疗具有抵抗性。 本发明还提供了检测TMEM236基 因突变的试剂盒在制备用于诊断局部进展期直 肠癌新辅助放疗抵抗诊断组合物中的用途。 本发 明筛选得到胚系突变的变异 基因TMEM236能够用 于预测局部进展期直肠癌患者对新辅助放疗的 原发性抵抗。 权利要求书1页 说明书20页 序列表1页 附图13页 CN 114350813 B 2022.08.02 CN 114350813 B 1.检测TMEM236基因突变的试剂在制备用于诊断局部进展期直肠癌新辅助放疗抵抗的 组合物中的用途， 其特征在于， 所述TMEM236基因突变为NM_001098844.3:c.G667A， 且所述 TMEM236基因突变为胚系突变， 如果通过测序检测到所述突变， 则显示患者对新辅助放疗 具 有抵抗。 2.根据权利要求1所述的用途， 其特征在于： 检测TMEM236基因突变的试剂包括检测所 述TMEM236基因突变的引物对， 所述的引物对的序列如下 所示， 正向序列： 5 ’agcaagtgaggcaaagtccag’3； 反向序列： 5 ’aaaccaagtctaacaaaaacgaatg’3。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114350813 B 2TMEM236基因在制备用于诊断直肠癌新辅助放疗抵抗标记物 中的用途 技术领域 [0001]本发明属于生物学领域， 涉及一种基因诊断标记物， 具体来说是TMEM236基因在制 备用于诊断局部进 展期直肠癌新辅助放疗抵抗标记 物中的用途。 背景技术 [0002]直肠癌是消化道最常见的恶性肿瘤之一， 发病年龄中位数在45岁左右， 因其位置 深入盆腔， 解剖关系复杂， 手术不易彻底， 术后局部复发率高。 近年来， 中青年 发病率有攀升 趋势， 已严重危害 人民的生命和财产安全。 目前手术仍然是早期直肠癌的主要治疗手段， 然 而对于局部进展期直肠癌， 术前新辅助放疗联合手术是主要治疗策略， 这种方式可提高直 肠癌根治性切除及保 肛率， 并降低局部复发率。 [0003]放射治疗通过在肿瘤区域给予足够辐射剂量， 引起肿瘤细胞DNA 单双链断裂， 导致 其损伤后启动细胞凋亡程序， 达到肿块缩小控制病情， 降低肿瘤分期延长生存目的。 然而， 目前临床实践发现不同直肠癌患者对放射反应存在巨大个体差异。 约占1/3放疗敏感患者 能够达到肿块缩小消失， 甚至病理完全缓解。 约占2/3放疗抵抗患者不仅无法从治疗中获 益， 反而需要承受额外的放疗毒副反应和沉重的经济负担， 甚至延误宝 贵的手术时机， 造成 肿瘤远处转移。 因此， 直肠癌患者术前放疗敏感性预测已成为临床制 定治疗策略的重要依 据， 我们迫切需要一种 标志物或者联合检测来精准预测患者是否存在放疗抵抗。 由于目前 个体放疗抵抗的分子 机制仍不明确， 还无法前瞻性制订 合理治疗策略。 [0004]TMEM是一种跨越脂质双层整个宽度的蛋白质， 它被永久地锚定在上面。 许多TMEM 蛋白起着跨膜通道的作用， 允许特定物质通过生物膜进行运输。 TMEM家族基因被普遍认为 可起到抑癌作用， 其家族的众多基因与肿瘤化疗耐药有很大关系， 然而TMEM236基因及其与 肿瘤放疗抵抗的关系目前鲜有研究。 [0005]TMEM236基因位于chr10:17,752,110 ‑17,800,916(GRCh38/hg38)， 长度为Size: 48 ,807， 外显子计数为： 8。 TMEM236基因的详细信息公开于genecards数据库 。 [0006]真核细胞基因由编码区和非编码区两部分组成， 其中编码区包括能够编码蛋白质 的序列 （外显子） 和不能够编码蛋白质的序列 （内含子） 。 全外显子组序列仅占全基因组序列 的1%左右， 与人类85%致病基因突变相关。 与全基因组测序相比， 全外显子组测序不仅费用 更低， 而且测序覆盖度更深， 数据准确性更高。 [0007]申请人通过收集已行新辅助放疗的局部进展期直肠癌患者， 术前肠镜 活检组织及 配对正常肠组织样本， 利用全外显子测序和生物信息学分析技术， 结合临床新辅助放疗疗 效评价标准AJCC版肿瘤退缩分级 （Tumor  Regression  Grade， TRG） ， 筛选出能够精准预测放 疗抵抗的基因突变位 点。说　明　书 1/20 页 3 CN 114350813 B 3