(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210387687.3 (22)申请日 2022.04.13 (71)申请人 华南农业大 学 地址 510610 广东省广州市天河区五山 华 南农业大 学 (72)发明人 聂庆华　蔡丹凤　王芷筠　周震　 徐海平　 (74)专利代理 机构 北京东方盛凡知识产权代理 事务所(普通 合伙) 11562 专利代理师 张换君 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种与鸡生长性状和产蛋性状相关的SNP分 子标记及应用 (57)摘要 本发明公开了一种与鸡生长性状和产蛋性 状相关的SNP分子标记及应用， 属于生物技术领 域。 所述SNP分子标记包括SNP1(NC_052532.1: g.25052822A>T)和/或SNP2(NC_052532.1: g.25052876G>C)。 试验验证， SNP1突变位点的TT 或TA基因型个体表现出300日龄产蛋数最多， SNP2突变位点的CC基因型个体表现出84日龄体 重最大； CC基因型个体91日龄体重最大； GC基因 型个体表现出300日龄产蛋数最多。 因此， 本发明 公开的SNP分子标记可应用到早期筛选鸡生长性 状和产蛋性状上， 准确鉴定鸡生长性状和产蛋性 状， 以为鸡的选 育提供科学数据。 权利要求书1页 说明书7页 序列表2页 附图1页 CN 114774559 A 2022.07.22 CN 114774559 A 1.一种与鸡生长性状和产蛋性状相关的SNP分子标记， 其特征在于， 包括SNP1和/或 SNP2； 其中， 所述SNP1位于如SEQ  ID NO:1所示序列的NC_052532.1:g.25052822位点， 该位 点存在A/T突变； 所述SNP2位于如SEQ  ID NO:1所示序列的NC_052532.1:g.25052876位点， 该位点存在G/ C突变。 2.根据权利要求1所述与鸡生长性状和产蛋性状相关的SNP分子标记， 其特征在于， SNP1突变位 点的基因型包括A A、 TA和TT， SNP2突变位 点的基因型包括G G、 GC、 CC。 3.一种用于扩增权利要求1或2所述与鸡生长性状和产蛋性状相关的SNP分子标记的引 物对， 其特 征在于， 引物序列为： CAPZA2‑F： GTTTGACACGGCCAGAGGTA； CAPZA2‑R： AAGGCTGACGTAGACA ACGG。 4.一种包 含权利要求3所述引物对的检测试剂盒。 5.一种权利 要求1或2所述SNP分子标记、 权利要求3所述的引物对、 或权利要求4所述的 检测试剂盒在鸡遗传育种中的应用。 6.根据权利要求1或2所述与鸡生长性状和产蛋性状相关的SNP分子标记早期筛选鸡生 长性状和产蛋性状的方法， 其特征在于， 包括利用所述SNP分子标记早期 筛选体重和产蛋数 量的过程。 7.根据权利要求6所述的方法， 其特 征在于， 包括以下步骤： (1)提取待测鸡血 液DNA； (2)以步骤(1)所得的DNA为模板， 利用权利 要求4中所述的引物对进行PCR扩增， 得到扩 增产物； (3)对步骤(2)所 得扩增产物上的突变位 点g.25052822和g.25052876进行基因分型； (4)基于步骤(3)的基因分型对鸡生长性状和产蛋性状进行早期选择， 其中， g.25052822位点的TT或TA基因型个体表现出300日龄产蛋数最多； g.25052876位点的CC基 因型个体表现出84日龄体重最大； CC基因型个体91日龄体重最大； GC基因型个体表现出300 日龄产蛋数最多。 8.根据权利要求7所述的方法， 其特征在于， 扩增体系包括： 2 ×Rapid Taq Master Mix  25 μL、 ddH2O 19 μL、 CAPZA2 ‑F 2 μL、 CAPZA2 ‑R 2 μL和DNA模板2 μL； 扩增程序包括： 95℃预变性 3min； 95℃变性15s， 58℃退火15s， 72℃延伸15s， 3 5个循环； 72℃彻底延伸5mi n； 4℃保存。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114774559 A 2一种与鸡生长性状和 产蛋性状相关的SNP分子标记及应用 技术领域 [0001]本发明涉及生物技术领域， 特别是涉及一种与鸡生长性状和产蛋性状相关的SNP 分子标记及应用。 背景技术 [0002]鸡作为最重要的农业畜禽动物之一， 其产 蛋性状一直是家禽育种的重要性状， 包 括产蛋数、 产蛋率、 蛋重等。 而产蛋数作为最重要的产蛋性状已经在蛋鸡的育种实践中得到 巨大的提升， 而对于中 国地方品种而言， 对产蛋数的提升仍有巨大的空间。 同时鸡的产肉性 能直接影响着市场经济效益。 三黄鸡具备较强的野生性能， 对环境能够很快适应， 长势较 快， 并且具备较高的抗病能力， 鸡肉制品及鸡蛋拥有良好的品质， 市场中广受推崇， 历年来 养殖数量和养殖规模都保持在较高水平。 从育种角度上， 培育出高产肉量与产蛋量的三黄 鸡能够极大地带动三黄鸡产业的经济效益， 有利于资源的有效利用， 对推动三黄鸡养殖产 业发展具有重大意 义。 [0003]分子标记辅助选择(Molecular  Mark‑assist Selection， MAS)是一种常用的分子 育种技术， 具有存在范围广、 遗传稳定、 直观准确等优点。 单核苷酸多态性(Single   nucleotide  polymorphism， SNP)是指在基因组水平上由单个核苷酸插入、 缺失、 颠换和转 换等变异而引起的DNA序列的多态性。 SNP是动物可遗传变异中最常见的一种， 在动物基因 组中广泛存在， 其作为一种DNA分子标记， 具有可稳定遗传易于检测等特性， 对提高选种准 确性和育种效率具有明显效果， 可广泛用于鸡的大群体规模化育种筛选。 SNP作为遗传标记 已经广泛地应用于基因定位、 克隆、 遗传育种以及遗传 多样性等研究领域。 进一步挖掘分子 水平上与鸡生长性状和产蛋性状相关的候选基因， 通过对其多态性的研究并建立相关分子 遗传标记， 可以为鸡 的生长性状和产蛋性状的分子标记辅助选择育种提供有利的技术支 撑， 有效推动蛋肉兼用鸡的育种工作。 [0004]肌动蛋白(Actin)是一类形成微丝的高度保守的多功能蛋白， 目前已经鉴定出三 组主要的肌动蛋白亚型， 分别为α、 β 和γ， 其中α ‑actin存在于肌肉细胞中， 是肌肉组织收缩 装置的主要成分， β、 γ ‑actin存在于绝大多数细胞中， 作为细胞骨架的组成部分和细胞内 部运动的介质。 Actin在细胞内有两种形式， 一种是单体的球形分子， 称为球状肌动蛋白 (Globularactin， G ‑actin)， 另一种是球形肌动蛋白的多聚体， 称为纤丝状肌动蛋白， 也称 F‑肌动蛋白(Fibrosactin， F ‑actin)， 即微丝。 只有F ‑actin才具有生理活性， G ‑actin通过 结合ATP转化为F ‑actin， 2种形式在一定生理条件下可以相互转换， 使F ‑actin保持着聚合 与解聚的动态平衡， 参与细胞一系列的生理功能。 肌动蛋白参与许多重要的细胞过程， 包括 细胞连接和细胞形状的建立和维持、 细胞运动、 细胞分裂、 囊泡和细胞器运动、 细胞信号传 导等， 然而肌动蛋白在真核细胞中作用不仅限于此， 它还介导吞噬杯的形成， 调节细胞的吞 噬功能， 此外近年来研究表明肌动蛋白对细胞 的凋亡、 增殖和迁移等生物学功能也有着重 要的影响。 [0005]刺端肌动蛋白结合蛋白肌肉Z线α 亚基2， (Capping  actin protein of muscle Z‑说　明　书 1/7 页 3 CN 114774559 A 3