ICS 65.020.01 CCS B 04 15 内蒙古自治区 地方 标准 DB15/T 4108—2025 马铃薯病毒 RT-PCR检测技术规程 Code of practice for RT -PCR detection of potato viruses 2025-07-10发布 2025-08-10实施 内蒙古自治区市场监督管理局 发布 DB15/T 4108 —2025 I 前言 本文件按照 GB/T 1.1 —2020《标准化工作导则 第1部分：标准化文件的结构和起草规则》的规定 起草。 本文件由内蒙古自治区果蔬标准化技术委员会（ SAM/TC 25 ）归口。 本文件起草单位：内蒙古农业大学、内蒙古师范大学、内蒙古自治区农牧业科学院、内蒙古民族幼 儿师范高等专科学校、鄂尔多斯市农牧业生态与资源保护中心。 本文件主要起草人：李正男、张磊、孙平平、张斌、席先梅、吕秀华、曹春梅、张溪、霍宏丽、周 宇、孙宇、牟英男、郭孟泽。 DB15/T 4108 —2025 1 马铃薯病毒 RT-PCR检测技术 规程 1 范围 本文件描述马铃薯病毒检测中的术语和定义， 检测对象， 抽样、 取样、 检测方法和判定规则等内容 。 本文件适用于马铃薯病毒的检测。 2 规范性引用文件 下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。 其中， 注日期的引用文件， 仅该日期对应的版本适用于本文件；不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单）适用于本 文件。 GB/T 34265 Sanger法测序技术指南 GB/T 40974 核酸样本质量评价方法 SN/T 2497.21 进出口危险化学品安全试验方法 第21部分：琼脂糖凝胶电泳试验 3 术语和定义 下列术语和定义适用于本文件。 RNA病毒 RNA viruses 核糖核酸病毒，其遗传物质为 RNA。 类病毒 viroids 又感染性 RNA，是一种和病毒相似，但不具有蛋白质外壳的一类环状闭合的单链 RNA分子。 反转录 reverse transcription （RT） 以RNA为模板，逆转录酶催化合成 DNA的过程。 互补 DNA complementary DNA （cDNA） 由逆转录酶催化合成的、与 RNA模板互补的 DNA。 聚合酶链式反应 Polymerase chain reaction （PCR） DB15/T 4108 —2025 2 利用DNA聚合酶， 对 DNA或cDNA模板的特定区域进行体外扩增的技术。 反应混合物通常由 DNA聚合酶、 脱氧核苷三磷酸、引物和缓冲液组成，反应过程主要包括变性、退火和延伸三个步骤。 引物 Primers 人工合成的具有一定长度的单链 DNA分子，与 DNA模板链的特定区域互补，其 3’末端在 PCR过程中作 为复制延伸的起始位点。 4 检测对象 主要RNA病毒种类 苜蓿花叶病毒（ Alfalfa mosaic virus ，AMV）。 黄瓜花叶病毒（ Cucumber mosaic virus ，CMV）。 马铃薯奥古巴花叶病毒（ Potato aucuba mos aic virus ，PAMV）。 马铃薯卷叶病毒（ Potato leaf roll virus ，PLRV）。 马铃薯帚顶病毒（ Potato mop -top virus ，PMTV）。 马铃薯A病毒（Potato virus A ，PVA）。 马铃薯M病毒（Potato virus M ，PVM）。 马铃薯S病毒（Potato virus S ，PVS）。 马铃薯X病毒（Potato virus X ，PVX）。 马铃薯Y病毒（Potato virus Y ，PVY）。 主要类病毒种类 马铃薯纺锤块茎类病毒（ Potato spindle tuber viroid ，PSTVd）。 注： 类病毒虽然不具有病毒所具有的蛋白质外壳，但具有 RNA基因组，检测方法与 RNA病毒一致。因此，列为本标准 的检测对象。 5 抽样方法 采用5点法抽样。 种植面积小于 2001 m2（含2001 m2） ， 抽检100株。 种植面积在 2001 m2到20010 m2之间 （含20010 m2）， 前2001 m2抽100株，之后每增 2001 m2增检50株。种植面积超过 20010 m2时，前20010 m2按上述方法抽样， 之后每增加 2001 m2增检20株。 6 取样方法 对样方内的马铃薯进行采样，取靠近顶部的新鲜叶或枝条，掸掉灰尘或其他附着物，除去蚜虫，放 置于自封采样袋内。 采样点距离检测点较远时，用湿纸巾、海绵或布条包裹叶或枝条的切割处，置于采样自封袋内进行 运输。 样品在检测点存储时间较短时（一般不超过 24 h），在4 ℃存放即可。长期存放样品时，需要将样 品用液氮预冷后，保存于 -80 ℃超低温保存箱。 DB15/T 4108—2025 3 7 检测方法 样品前处理 避开叶片中脉，切取叶片组织用于检测。 样品核酸提取 选择市售的用于提取含有多糖多酚材料 RNA的试剂盒，按照试剂盒自带的说明书进行操作。核酸质 量评价按照 GB/T 40974 执行。 反转录 以质量合格的总 RNA为模板，选择市售的具有基因组 DNA去除功能的反转录试剂盒进行反转录，合成 cDNA。反应体系和反应程序按照试剂盒自带的说明书进行设置。 PCR扩增 7.4.1 PCR反应体系 市售产品通常为预混液或单品，根据所选产品提供的说明书，进行 PCR反应混合物配制，并按说明 书指示加入 cDNA模板以及病毒检测引物。各种病毒的 特异性检测引物见表 1。 表1 马铃薯病毒的特异性检测引物 病毒名称 引物名称 引物序列 /（5’→ 3’方向） 目标DNA片段大小 /（bp） AMV AMV-Fa CCATCATGAGTTCTTCACAAA 351 AMV AMV-Rb TCGTCACGTCATCAGTGAGAC 351 CMV CMV-F GTTTATTTACAAGAGCGTACGG 650 CMV CMV-R GGTTCGAARRWATAACCGGG 650 PAMV PAMY-F ACCCAAGCGTTCCTATATACTC 360 PAMV PAMV-R GGTCAAATCATTGCCAGCAATC 360 PLRV PLRV-F CGCGCTAACAGAGTTCAGCC 336 PLRV PLRV-R GCAATGGGGGTCCAACTCAT 336 PMTV PMTV-F ATGGCTGAAAACAGAGGTGA 531 PMTV PMTV-R CTATGCACCAGCCCAGCGTAA 531 PVA PVA-F GATGTCGATTTAGGTACTGCTG 273 PVA PVA-R TCCATTCTCAATGCACCATAC 273 PVM PVM-F ACATCTGAGGACATGATGCGC 520 PVM PVM-R TGAGCTCGGGACCATTCATAC 520 PVS PVS-F TCTCCTTTGAGATAGGTAGG 602 PVS PVS-R CAGCCTTTCATTTCTGTTAG 602 PVX PVX-F ATGTCAGCACCAGCTAGCA 711 PVX PVX-R TGGTGGTGGTAGAGTGACAA 711 PVY PVY-F GGCATACGGACATAGGAGAAACT 447 PVY PVY-R CTCTTTGTGTTCTTCTCTTGTGT 447 PSTVd PSTVd-F CACCCTTCCTTTCTTCG 359 PSTVd PSTVd-R AAAACCCTGTTTCGGCGGGA 359 F表示上游引物。 R表示下游引物。 DB15/T 4108 —2025 4 7.4.2 PCR反应程序 95 ℃预变性 2 min。35个反应循环： 95 ℃变性20 s；退火20 s，退火温度按引物合成报告设置， 两个引物退火温度不一致时，取较低温度； 72 ℃延伸，延伸时间根据所选产品说明书提供的参数进行 计算。最后， 72 ℃终延伸 5 min。 琼脂糖凝胶电泳检测 7.5.1 琼脂糖凝胶制备 用Tris-乙酸缓冲液溶解琼脂糖，制备质量体积比为 1%的琼脂糖凝胶。琼脂糖凝胶的制备按照 SN/T 2497.21执行。 7.5.2 电泳检测 用Tris-乙酸缓冲液，在水平板电泳槽中进行电泳。上样、电泳按照 SN/T 2497.21 执行。电泳结束 时，凝胶置于紫外灯或凝胶成像系统进行观测和拍照，获取的图片用于结果判定。 8 判定规则 异常结果 根据琼脂糖凝胶电泳图，与图中 DNA相对分子质量标准品相比，从阴性对照样品扩增到了预期大小 的DNA片段，或从阴性对照和阳性对照样品均未扩增到预期大小的 DNA片段，此时，判定为检测错误，应 重新进行检测。 阳性结果 从阴性对照样品未扩增到预期大小的 DNA片段，从被检测样品扩增到了预期大小的 DNA片段。有阳性 对照时，从阳性对照扩增